[发明专利]用于核酸高通量测序的方法有效

专利信息
申请号: 201510795041.9 申请日: 2008-10-30
公开(公告)号: CN105349647B 公开(公告)日: 2020-08-28
发明(设计)人: 阿诺德·欧力分特 申请(专利权)人: 完整基因有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;C12M1/34;G01N35/00
代理公司: 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 代理人: 李程达
地址: 美国加利*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 用于 核酸 通量 方法
【权利要求书】:

1.高通量核酸测序的自动化方法,其包括以下步骤:

将一个或多个流动池放置在反应平台上,每个流动池包括多个可辨别的反应位点和附着于所述多个反应位点的多个核酸样品;

将处理试剂注入所述流动池,以执行测序反应产生荧光测序产物;

使用运载器件将每个流动池转移至检测子系统的视野内的位置,所述检测子系统包括经配置用于捕获所述流动池的光学图像的成像器;

在所述视野内照射每个流动池,以使所述荧光测序产物在所述可辨别的反应位点发出可辨别光谱荧光;和

捕捉来自所述流动池中可辨别反应位点的荧光的图像,以鉴定所述核酸样品的核酸序列;

其中隔震器防止震动干扰图像捕捉;并且

其中反应步骤中的样品制备和捕捉步骤中的数据提取以相互不同的速度发生。

2.如权利要求1所述的方法,其中发生所述捕获步骤的持续时间短于所述反应步骤。

3.如权利要求1所述的方法,其包括将多个流动池放置在多个反应平台上,并将每个流动池从所述多个反应平台转移至检测子系统。

4.如权利要求1所述的方法,其中所述转移是通过包含由计算机控制的夹持机构的运载工具进行的。

5.如权利要求4所述的方法,其中所述运载工具包括控制和传感机构,并且成像子系统包括位置登记机构。

6.如权利要求1所述的方法,其中每个流动池的转移包括使反应子系统中流体储液器与所述流动池的流体入口可逆地断开连接。

7.如权利要求1所述的方法,其还包括在已捕获图像之后,将每个流动池返还至其初始反应平台。

8.高通量核酸测序的自动化方法,其包括重复执行以下步骤:

在反应平台上同时处理多个流动池,使得在每个流动池中固定的核酸接受生化测序反应,产生荧光测序产物;并且

使用配置用于将每个流动池从流体处理器转移至成像器的运载器件,将所述反应平台上每个流动池依次转移至检测子系统,以捕获荧光测序产物的图像,

其中隔震器防止震动干扰检测子系统捕捉图像。

9.如权利要求1-8中任一项所述的方法,其中所述检测子系统与系统的其他模块间隔,使得来自其他模块的震动不会破坏成像器的图像捕获。

10.如权利要求1-8中任一项所述的方法,其中所述检测子系统与系统的其他模块物理隔离,使得来自其他模块的震动不会破坏成像器的图像捕获。

11.如权利要求1-8中任一项所述的方法,其中所述隔震器位于检测子系统与反应子系统之间从而将所述检测子系统与所述反应子系统的震动隔离。

12.如权利要求1-8中任一项所述的方法,其中每个流动池具有约50-300μL的体积。

13.如权利要求1-8中任一项所述的方法,其包括在300毫秒内从每个流动池中多个不同的荧光标记捕获图像。

14.如权利要求1-8中任一项所述的方法,其包括每天捕获约200,000个流动池图像。

15.用于高通量核酸测序的系统,其包括:

反应子系统,包括至少一个反应平台,被配置成用于在反应单元中对核酸样品进行生化测序反应;

检测子系统,用于捕捉用于光学图像分析的测序反应光学图像;

联接子系统,用于将多个核酸样品或反应单元转移至检测子系统的检测视野内;

隔震器,防止震动干扰检测子系统捕捉图像;

其中检测子系统的运行速率不同于反应子系统的运行速率。

16.如权利要求15所述的系统,其中反应平台包括多个流动池。

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