[发明专利]汉坦病毒集成式核酸检测试剂盒及检测方法有效

专利信息
申请号: 201510409650.6 申请日: 2015-07-14
公开(公告)号: CN104946800A 公开(公告)日: 2015-09-30
发明(设计)人: 宋锋林;高玉峰;程晓兰;姜陆;万雪 申请(专利权)人: 宋锋林;高玉峰
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68
代理公司: 大连博晟专利代理事务所(特殊普通合伙) 21236 代理人: 于忠晶
地址: 116000 辽*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要:
搜索关键词: 病毒 集成 核酸 检测 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.汉坦病毒集成式核酸检测试剂盒,其特征是:包括汉坦病毒巢式PCR第一轮及巢式PCR第二轮反应体系,其中PCR第一轮反应体系包括一对通用引物HTV-MFO、HTV-MRO;PCR第二轮反应体系包括汉城型引物SEO-MF、SEO-MR和汉滩型PCR引物HMF、HMR,引物序列如下:

2.根据权利要求1所述的汉坦病毒集成式核酸检测试剂盒,其特征是:所述PCT第一轮为RT-PCR反应体系,总体积为50 μL, 包括Enzyme Mix 2.0 μL, 2×Buffer 25.0 μL,模板RNA 2-14 μL,引物HTV-MFO (20 μM) 2.0 μL,引物HTV-MRO (20 μM)2.0 μL,补充RNase Free H2O使总体积达到50 μL;

所述PCR第二轮汉城型反应体系总体积为50 μL,包括DNA  Polymerase (1U/μl) 2.0 μL,10×PCR Buffer 5.0 μL,4×dNTP 5.0 μL, 模板4.0 μL(RT-PCR),引物SEO-MF(20μM)2.0 μL,引物 SEO-MR (20 μM)2.0 μL,补充ddH2O 30.0 μL,使总体积达到50 μL;

所述PCR第二轮汉滩型反应体系总体积为50 μL,包括DNA  Polymerase (1U/μL) 2.0 μL, 10×PCR Buffer 5.0 μL, 4×dNTP 5.0 μL,模板4.0 μL, 引物HMF (20μM)2.0 μL,引物HMR (20μM)2.0 μL,补充ddH2O 30.0 μL,使总体积达到50 μL。

3.汉坦病毒集成式核酸检测方法,其特征是:

(1)汉坦病毒核酸检测引物的设计与合成:以汉坦病毒M片段设计并合成RT-PCR通用外引物HTV-MFO、HTV-MRO,扩增片段大小为445 bp;汉城型PCR引物SEO-MF、SEO-MR,扩增片段大小为417 bp;汉滩型PCR引物HMF、HMR,扩增片段大小为382 bp,引物序列如下:

(2)PCR反应体系的建立:

RT-PCR反应体系为50 μL, 包括Enzyme Mix 2.0 μL, 2×Buffer 25.0 μL,模板RNA 2-14 μL,引物HTV-MFO (20 μM) 2.0 μL,引物HTV-MRO (20 μM)2.0 μL,补充RNase Free H2O使总体积达到50 μL;将RT-PCR反应体系的混合液,模板RNA除外,分装至200 μL PCR管中并置于冰箱中,-20 ℃及以下冷冻3 h以上,将PCR管置于冻干机内进行真空干燥处理3h,保存于-20℃冰箱中待用;

PCR第二轮汉城型反应体系为50 μL,包括DNA  Polymerase (1U/μl) 2.0 μL,10×PCR Buffer 5.0 μL,4×dNTP 5.0 μL,模板4.0 μL(RT-PCR),引物SEO-MF(20μM)2.0 μL,引物 SEO-MR (20 μM)2.0 μL,补充ddH2O 30.0 μL,使总体积达到50 μL;将PCR第二轮汉城型反应体系的混合液,模板除外,分装至200 μL PCR管中并置于冰箱中,-20 ℃及以下冷冻3 h以上,将PCR管置于冻干机内进行真空干燥处理3h,保存于-20℃冰箱中待用;

PCR第二轮(汉滩型)反应体系为50 μL,包括DNA  Polymerase (1U/μL) 2.0 μL, 10×PCR Buffer 5.0 μL, 4×dNTP 5.0 μL,模板4.0 μL, 引物HMF (20μM)2.0 μL,引物HMR (20μM)2.0 μL,补充ddH2O 30.0 μL,使总体积达到50 μL;将PCR第二轮汉滩型反应体系的混合液,模板除外,分装至200 μL PCR管中并置于冰箱中,-20 ℃及以下冷冻3 h以上,将PCR管置于冻干机内进行真空干燥处理3h,保存于-20℃冰箱中待用;

(3)实时荧光定量PCR反应:RT-PCR反应条件包括50℃ 30min;94℃ 3min ,94℃ 20 s,54℃ 30s,72℃ 30s,40 cycles;72℃ 5min;

PCR第二轮汉城型反应条件包括94℃ 3min ;94℃ 15 s,53℃ 25s,70℃ 25s,38 cycles;70℃ 5min;

PCR第二轮汉滩型反应条件包括94℃ 3min;94℃ 15 s, 56℃ 25s,72℃ 25s,35 cycles;72 ℃ 5 min。

4.    根据权利要求3所述的汉坦病毒集成式核酸检测方法,其特征是:对汉坦病毒集成式核酸检测试剂盒进行评价,包括敏感性、特异性、重复性及稳定性评价:

    所述敏感性评价采用的方法及结果是:将RT-PCR反应体系用RNase Free H2O复溶,或根据加入模板RNA的情况减少RNase Free H2O加入量,使反应总体系为50 μL;将待检模板用RNase Free H2O作10倍系列稀释,按原反应组成、反应条件进行检测试验;以能够检出阳性样品的最低浓度为该试剂盒的检测下限,即敏感度; 

所述特异性评价采用的方法及结果:用本发明的汉坦病毒集成式核酸检测试剂盒检测登革病毒(Ⅰ型)、登革病毒(Ⅱ型)、登革病毒(Ⅲ型)、登革病毒(Ⅳ型)、西尼罗病毒、流行性乙型脑炎病毒;

    所述重复性评价采用的方法及结果:从同批次制备的试剂盒中,分别随机抽取20套装有混合试剂的PCR管,各平分为两组,分别检测阳性样品和阴性样品,进行3批次试验;

    所述稳定性评价采用的方法及结果:在不同的温度条件下(常温、4℃和-20℃)保存试剂盒,一定时间后检测同一浓度的阳性和阴性样品并与原检测结果比对,观察试剂盒的稳定性;将检测试剂盒在常温、4℃和-20℃条件下分别保存7天、30天和1年,试剂盒对相应样品的检测结果没有明显的变化。

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