[发明专利]一种与鸡优良生产性状相关的鸡FABP1基因分子遗传标记及其应用

说明书

技术领域

本发明属于分子生物技术领域，涉及一种肉食鸡的优良屠宰性状分子遗传标记及其在辅助筛选或预测具备优良屠宰性状的肉食鸡品种中的应用。

背景技术

目前对于分子遗传标记较为完整的描述，是指易于识别、遵循孟德尔遗传模式的、具有个体特异性或分布规律具有种质特征的某一类表性特征或遗传物质，其范围包括：基因或遗传物质产物的变异特征、作为基因或遗传物质载体的染色体的形态学变异、基因或遗传物质本身的变异等。DNA分子遗传标记技术是一种新兴的分子标记技术，目前已经在分子生物学特别是在分子遗传学上得到了广泛的应用。由于真核生物的遗传信息都储存在染色体和细胞器基因组的DNA序列中，因此从理论上讲，DNA水平上的分子标记是所有遗传标记中最为稳定最为可靠的。现代分子生物学技术的发展使得直接利用DNA序列中核苷酸的变异作为遗传标记成为了可能。

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是指在染色体基因组水平上单个核苷酸的变异引起的DNA序列多态性，而其中最少一种等位基因在群体中的频率不小于1％。它包括碱基的转换、颠换、插入及缺失等形式。由于SNP具有高密度性、富有代表性、遗传稳定性及易实现分析的自动化等优点，因此作为一类遗传标记，SNP在遗传学分析中得到了广泛的应用。

脂肪酸结合蛋白(Fatty acid binding protein，FABP)广泛存在于脊椎动物和费脊椎动物的细胞质中，属于脂质结合蛋白超家族成员。FABP蛋白是一族小分子细胞内蛋白，对长链脂肪酸有很高的亲和力，能把脂肪酸从细胞膜转移到细胞内，在长链脂肪酸的代谢中起重要作用。迄今为止已经发现了9种类型的FABP蛋白，每种类型的FABP蛋白在不同的组织和细胞中表达。

FABP1是肝型脂肪酸结合蛋白，属于FABP超家族中的一员，存在于肝细胞和小肠粘膜细胞胞质吗，对软脂酸盐、油酸和硬脂酸盐等具有高度亲和力，参与脂肪酸的摄取和转运。在肝脏，长链脂肪酸一般通过位于肝细胞膜上的FABP脂肪酸转运蛋白摄取入胞，随后在FABP1的辅助下被转运到线粒体、过氧化物酶体、内质网等进行β-氧化，从而调控细胞内的脂肪酸代谢，最终使体内脂肪酸代谢保持相对平衡。作为分子标记，FABP1表现出高遗传的多态性。脂肪性状是评价鸡肉品质的重要指标，此类性状的发育会直接影响其商品性能。因此，对于调控脂肪性状发育基因的SNPs的表征对于通过肉鸡的分子育种和辅助选择提高其生产性能具有十分重要的作用。在申请人相关实验涉及鸡的群体中，FABP1单核苷酸未突变的个体其产肉率以及肉质均优于纯合突变个体以及杂合突变个体，从数据上直观地体现了FABP1基因SNPs对鸡生产性状的影响。这一发现若应用到优质家禽的育种等研究工作中，有望为培育出高产优质肉性状的优良品种提供帮助。经检索，目前FABP1基因SNPs作为遗传标记，特别是作为肉食鸡的优良屠宰性状分子遗传标记应用于筛选或预测具备优良屠宰性状的肉食鸡品种还未见报道。

发明内容

针对现有技术的不足，本发明要解决的问题是提供一种与鸡优良生产性状相关的鸡FABP1基因分子遗传标记及其在辅助筛选或预测具备优良屠宰性状的肉食鸡品种中的应用。

本发明所述的与鸡优良生产性状相关的鸡FABP1基因分子遗传标记是鸡FABP1基因单核苷酸多态性序列上的多态性位点，其特征在于：所述鸡FABP1基因单核苷酸多态性序列的多态性位点是在FABP1基因序列第二外显子的第83位为C或T的碱基多态性位点，表现为CC、CT或TT三种基因型，其中TT型为肉食鸡的优良屠宰性状分子遗传标记。

本发明所述与鸡优良生产性状相关的鸡FABP1基因分子遗传标记在辅助筛选或预测具备优良屠宰性状的肉食鸡品种中的应用。

上述应用的具体方法是：以待检测鸡FABPl基因组DNA为模板，以引物对FABP1 E2F/E2R进行PCR扩增，扩增完成后进行琼脂糖凝胶电泳，然后使用特定的限制性核酸内切酶对扩增出的目的片段进行酶切；之后对酶切产物再一次进行琼脂糖凝胶电泳，来检测酶切产物的片段大小，分析确定鸡FABP1基因的碱基多态性位点，当FABP1基因序列第二外显子的第83位为C或T，且基因型为TT型时，即可判定待检测鸡品种为具有优良屠宰性状的品种鸡；

其中：

所述引物对FABP1 E2F/E2R的核苷酸序列为：

FABP1 E2F：CTTGAGAGGCTCTTCCACAATAG；