[发明专利]一种榆树枯萎病菌的分子检测方法有效
申请号: | 201510078255.4 | 申请日: | 2015-02-13 |
公开(公告)号: | CN104630371B | 公开(公告)日: | 2017-01-18 |
发明(设计)人: | 叶建仁;陶兆雪;王焱;张培;吴小芹;周爱东 | 申请(专利权)人: | 南京林业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/645 |
代理公司: | 南京申云知识产权代理事务所(普通合伙)32274 | 代理人: | 邱兴天 |
地址: | 210037 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 榆树 枯萎 病菌 分子 检测 方法 | ||
1.一种榆树枯萎病菌的分子检测方法,其特征在于:以待测样品DNA为模板,以通用引物ITS1-F/ITS4-B进行巢式PCR的第一轮反应,以第一轮反应产物为模板,以引物OpF和引物OpR为特异性引物,进行巢式PCR的第二轮反应,反应产物进行电泳检测,电泳图中出现304bp条带即为检测出榆树枯萎病菌,否则未检出;其中,引物OpF序列为:5'-GCCCGCCACTGGTTTTGA-3';引物OpR序列为:5'-CCGCCCGAACCTTTTCCA-3'。
2.根据权利要求1所述的榆树枯萎病菌的分子检测方法,其特征在于,具体步骤如下:
(1)取0.5g冷冻过的菌丝,放于2mL的平底离心管内,加入2颗直径为3mm钢珠,关上管盖置于研磨仪上,30f/min,研磨3min,取出钢珠,加入500μL CTAB,于液氮内冷冻2min,再放于75℃水浴锅内融化2分钟,重复两次,最后一次于75℃水浴锅内融化30min,接着加入500μL的25:24:1的酚:氯仿:异戊醇,上下颠倒混匀,12000rpm离心10min,取上清,加入2倍体积的预冷无水乙醇沉淀1h,12000rpm离心10min,弃上清,沉淀用70%乙醇洗涤,自然风干,50μL ddH2O溶解DNA,-20℃保存备用;
(2)巢式PCR反应,巢式PCR第一轮PCR反应的引物为通用引物ITS1-F/ITS4-B,PCR反应总体积为25μL,包含1μL基因组DNA,10μM的上下游引物各1μL,2.5μL 10×PCR buffer,2μL 25mM的MgCl2,2.5μL dNTP,1.25U Taq DNA聚合酶,14.75μL ddH2O;PCR反应程序为:预扩增95℃ 180s,接着94℃ 30s,58℃ 30s,72℃ 60s,30个循环,最后在72℃延伸10min;巢式PCR第二轮反应以特异性引物OpF/OpR为引物,巢式PCR第一轮PCR产物稀释50倍,取2uL作为第二轮反应模板,PCR反应体系与第一轮相同,PCR反应条件为:预扩增95℃ 180s,接着94℃ 30s,58℃ 30s,72℃ 60s,30个循环,最后在72℃延伸10min;
(3)取巢式PCR产物进行琼脂凝胶电泳检测,电泳图中出现304bp条带即为检测出榆树枯萎病菌。
3.根据权利要求1所述的榆树枯萎病菌的分子检测方法,其特征在于:步骤(1)中,在进行菌丝DNA提取时,当DNA溶于100uL TE溶液后,再次加入200uL CTAB重复提取一次。
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