[发明专利]用于制备DNA文库的DNA接头分子以及生产它们的方法和用途有效
申请号: | 201480053727.4 | 申请日: | 2014-09-29 |
公开(公告)号: | CN105579592B | 公开(公告)日: | 2020-12-15 |
发明(设计)人: | 彼得·黑恩;亚历山大·阿扎维;彼得·格吕内费尔德 | 申请(专利权)人: | 凯杰有限公司 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6806 |
代理公司: | 中原信达知识产权代理有限责任公司 11219 | 代理人: | 杨青;缑正煜 |
地址: | 德国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 制备 dna 文库 接头 分子 以及 生产 它们 方法 用途 | ||
1.一种DNA接头分子,其包含双链分子,其中
a.第一链的5’末端被修饰成使得第一核苷酸不含游离羟基并且在5’位置处没有游离磷酸基团,
b.所述第一链的3’末端被修饰成使得最后一个核苷酸在3’位置处不含游离羟基,
c.反向链的5’末端被修饰成使得第一核苷酸不含游离羟基并且在5’位置处没有游离磷酸基团,
d.所述反向链的3’末端以游离羟基为特点,
其中两条链的5’末端处和第一链的3’末端处的羟基被酯化或醚化。
2.权利要求1的DNA接头分子,其含有条形码序列以及用于扩增引物和测序引物的结合位点。
3.权利要求1的DNA接头分子,其特征在于它具有20至90个碱基对的长度。
4.权利要求1的DNA接头分子,其特征在于它具有40至70个碱基对的长度。
5.权利要求1的DNA接头分子,其特征在于它具有40至60个碱基对的长度。
6.权利要求1至5任一项的DNA接头分子,其特征在于通过附连5’-C3间隔基或5’-D间隔基对所述反向链的5’末端进行修饰。
7.权利要求1至5任一项的DNA接头分子,其特征在于通过附连5’-C3间隔基或5’-O-甲基脱氧核苷酸对所述第一链的5’末端进行修饰。
8.权利要求1至5任一项的DNA接头分子,其特征在于通过3’-C3间隔基或3’-氨基修饰物对所述第一链的3’末端进行修饰。
9.一种用于生产DNA接头分子的方法,所述DNA接头分子包含双链分子,所述方法具有下列步骤:
a.修饰第一链的5’末端,使得没有游离羟基和游离磷酸基团可用,
b.修饰所述第一链的3’末端,使得没有游离羟基可用,
c.修饰反向链的5’末端,使得没有游离羟基和游离磷酸基团可用,
其中两条链的5’末端处和第一链的3’末端处的羟基被酯化或醚化。
10.权利要求9的用于生产DNA接头分子的方法,其中所述第一链的5’末端的修饰通过附连5’-O-甲基脱氧胸苷一磷酸或5’-C3间隔基来实现。
11.权利要求9或10的用于生产DNA接头分子的方法,其中所述第一链的3’末端的修饰通过附连3’-C3间隔基或3’-氨基修饰物来实现。
12.权利要求9或10的用于生产DNA接头分子的方法,其中所述反向链的5’末端的修饰通过附连5’-C3间隔基或5’-D间隔基来实现。
13.一种产生DNA文库的方法,所述方法包括下列步骤:
1)双链DNA的片段化,
2)片段化的双链DNA的末端修复,
3)所述片段化的双链DNA的5’末端的磷酸化,
4)将权利要求1至8任一项的DNA接头分子与片段化的、末端修复且5’磷酸化的双链DNA连接,其中在步骤2之前添加权利要求1至8任一项的DNA接头分子。
14.权利要求13的产生DNA文库的方法,其中所述双链DNA的片段化通过物理或化学或酶学方法或其组合来进行。
15.权利要求13的产生DNA文库的方法,其中所述片段化的双链DNA的末端修复在具有3’→5’核酸外切酶和5’→3’聚合酶活性的DNA聚合酶的帮助下进行。
16.权利要求15的产生DNA文库的方法,其中所述DNA聚合酶为T4-DNA聚合酶。
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