[发明专利]用于制备DNA文库的DNA接头分子以及生产它们的方法和用途有效

专利信息
申请号: 201480053727.4 申请日: 2014-09-29
公开(公告)号: CN105579592B 公开(公告)日: 2020-12-15
发明(设计)人: 彼得·黑恩;亚历山大·阿扎维;彼得·格吕内费尔德 申请(专利权)人: 凯杰有限公司
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/6806
代理公司: 中原信达知识产权代理有限责任公司 11219 代理人: 杨青;缑正煜
地址: 德国*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 用于 制备 dna 文库 接头 分子 以及 生产 它们 方法 用途
【权利要求书】:

1.一种DNA接头分子,其包含双链分子,其中

a.第一链的5’末端被修饰成使得第一核苷酸不含游离羟基并且在5’位置处没有游离磷酸基团,

b.所述第一链的3’末端被修饰成使得最后一个核苷酸在3’位置处不含游离羟基,

c.反向链的5’末端被修饰成使得第一核苷酸不含游离羟基并且在5’位置处没有游离磷酸基团,

d.所述反向链的3’末端以游离羟基为特点,

其中两条链的5’末端处和第一链的3’末端处的羟基被酯化或醚化。

2.权利要求1的DNA接头分子,其含有条形码序列以及用于扩增引物和测序引物的结合位点。

3.权利要求1的DNA接头分子,其特征在于它具有20至90个碱基对的长度。

4.权利要求1的DNA接头分子,其特征在于它具有40至70个碱基对的长度。

5.权利要求1的DNA接头分子,其特征在于它具有40至60个碱基对的长度。

6.权利要求1至5任一项的DNA接头分子,其特征在于通过附连5’-C3间隔基或5’-D间隔基对所述反向链的5’末端进行修饰。

7.权利要求1至5任一项的DNA接头分子,其特征在于通过附连5’-C3间隔基或5’-O-甲基脱氧核苷酸对所述第一链的5’末端进行修饰。

8.权利要求1至5任一项的DNA接头分子,其特征在于通过3’-C3间隔基或3’-氨基修饰物对所述第一链的3’末端进行修饰。

9.一种用于生产DNA接头分子的方法,所述DNA接头分子包含双链分子,所述方法具有下列步骤:

a.修饰第一链的5’末端,使得没有游离羟基和游离磷酸基团可用,

b.修饰所述第一链的3’末端,使得没有游离羟基可用,

c.修饰反向链的5’末端,使得没有游离羟基和游离磷酸基团可用,

其中两条链的5’末端处和第一链的3’末端处的羟基被酯化或醚化。

10.权利要求9的用于生产DNA接头分子的方法,其中所述第一链的5’末端的修饰通过附连5’-O-甲基脱氧胸苷一磷酸或5’-C3间隔基来实现。

11.权利要求9或10的用于生产DNA接头分子的方法,其中所述第一链的3’末端的修饰通过附连3’-C3间隔基或3’-氨基修饰物来实现。

12.权利要求9或10的用于生产DNA接头分子的方法,其中所述反向链的5’末端的修饰通过附连5’-C3间隔基或5’-D间隔基来实现。

13.一种产生DNA文库的方法,所述方法包括下列步骤:

1)双链DNA的片段化,

2)片段化的双链DNA的末端修复,

3)所述片段化的双链DNA的5’末端的磷酸化,

4)将权利要求1至8任一项的DNA接头分子与片段化的、末端修复且5’磷酸化的双链DNA连接,其中在步骤2之前添加权利要求1至8任一项的DNA接头分子。

14.权利要求13的产生DNA文库的方法,其中所述双链DNA的片段化通过物理或化学或酶学方法或其组合来进行。

15.权利要求13的产生DNA文库的方法,其中所述片段化的双链DNA的末端修复在具有3’→5’核酸外切酶和5’→3’聚合酶活性的DNA聚合酶的帮助下进行。

16.权利要求15的产生DNA文库的方法,其中所述DNA聚合酶为T4-DNA聚合酶。

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