[发明专利]基于陆地棉转录组序列开发的EST-SSR标记引物与应用有效
申请号: | 201410284580.1 | 申请日: | 2014-06-23 |
公开(公告)号: | CN104017896A | 公开(公告)日: | 2014-09-03 |
发明(设计)人: | 张军;高阳;王芙蓉;刘国栋;张传云;张景霞;周娟 | 申请(专利权)人: | 山东棉花研究中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 济南金迪知识产权代理有限公司 37219 | 代理人: | 朱家富 |
地址: | 250100 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 陆地棉 转录 序列 开发 est ssr 标记 引物 应用 | ||
1.一种陆地棉Coker312的EST-SSR标记SCRC056的引物,其特征在于,该引物为一对,核苷酸序列分别为SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2。
2.权利要求1所述的EST-SSR标记SCRC056的引物在遗传多样性分析和高密度遗传图谱构建方面的应用,标记SCRC056定位于chr.16(D7)上20.4cM处,位于chr.16(D7)上15.4cM的标记BNL2734与chr.16(D7)上24.4cM的标记CGR6280之间,与标记BNL2734相距5cM,与标记CGR6280相距4cM。
3.一种陆地棉Coker312的EST-SSR标记SCRC371的引物,其特征在于,该引物为一对,核苷酸序列分别为SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4。
4.权利要求3所述的EST-SSR标记SCRC371的引物在棉花遗传多样性分析和高密度遗传图谱构建方面的应用,标记SCRC371定位于chr.18(D13)上63.2cM处,位于chr.18(D13)上52.7cM的标记SHIN1403与chr.18(D13)上78.4cM的标记CGR5021之间,与标记SHIN1403相距10.5cM。
5.一种陆地棉Coker312的EST-SSR标记SCRC878的引物,其特征在于,该引物为一对,核苷酸序列分别为SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6。
6.权利要求5所述的EST-SSR标记SCRC878的引物在棉花遗传多样性分析和高密度遗传图谱构建方面的应用,标记SCRC878定位于chr.2(A2)上42.5cM处,位于连锁群末端,与位于chr.2(A2)上35.5cM的标记HAU880距离最近,相距7.0cM。
7.一种陆地棉Coker312的EST-SSR标记SCRC1022的引物,其特征在于,该引物为一对,核苷酸序列分别为SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8。
8.权利要求7所述的EST-SSR标记SCRC1022的引物在棉花遗传多样性分析和高密度遗传图谱构建方面的应用,标记SCRC1022定位于chr.23(D9)上19.5cM处,位于chr.23(D9)上16.6cM的标记CGR5392与chr.23(D9)上24.4cM的标记HAU2017之间,与标记CGR5392相距2.9cM,与标记HAU2017相距4.9cM。
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