[发明专利]一种单克隆表面展示核酸适体快速筛选方法有效
申请号: | 201410076295.0 | 申请日: | 2014-03-04 |
公开(公告)号: | CN103911432A | 公开(公告)日: | 2014-07-09 |
发明(设计)人: | 杨朝勇;朱志;宋彦龄;李聪;邹远;朱玲;安源 | 申请(专利权)人: | 厦门大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/115 |
代理公司: | 厦门市首创君合专利事务所有限公司 35204 | 代理人: | 张松亭 |
地址: | 361000 *** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 单克隆 表面 展示 核酸 快速 筛选 方法 | ||
1.一种单克隆表面展示核酸适体快速筛选方法,将DNA文库单克隆展示于微球表面,实现分子识别可视化监测;所述方法包括如下步骤:(1)将氨基修饰的正向引物通过NHS-氨基反应偶联到NHS修饰的微球表面;(2)将寡核苷酸文库通过液滴单分子微乳PCR以单克隆的形式扩增到偶联有正向引物的微球表面,每个微球上仅展示一种核酸序列;(3)通过单克隆微球库与靶标相关作用,可视化地考察表面展示序列与靶标的结合程度;(4)直接挑选获得能和靶标分子结合的单克隆微球,获取微球上的DNA序列,获得高质量核酸适体。
2.如权利要求1和权利要求2所述单克隆表面展示核酸适体快速筛选方法,其特征在于:步骤(2)中,利用振荡、搅拌或微流控芯片方式生成含有微球的油包水液滴,每个液滴中至多包含一条寡核苷酸模板。
3.如权利要求2所述单克隆表面展示核酸适体快速筛选方法,其特征在于:步骤(2)中,采用振荡方式生成含有微球的油包水液滴,其以筛选所需的寡核苷酸文库为PCR扩增模板,加入偶联有正向引物的微球和PCR所需试剂作为水相,油相的组成为40%(w/w)道康宁5225C,30%(w/w)道康宁749,30%(w/w)硅油Ar20。
4.如权利要求1所述单克隆表面展示核酸适体快速筛选方法,其特征在于:步骤(2)中将这些连有核酸的微球破乳、回收,并对双链DNA进行变性单链化,最终获得用于筛选的核酸展示单克隆微球。
5.如权利要求1所述单克隆表面展示核酸适体快速筛选方法,其特征在于:靶标为细胞、蛋白质或小分子,如靶标为小分子或蛋白质时,将靶标偶联于固相载体表面便于观察和分离。
6.如权利要求1所述单克隆表面展示核酸适体快速筛选方法,其特征在于:步骤(4)中核酸展示单克隆微球与靶标孵育,去除不结合的微球,在显微镜下挑出结合的微球。
7.如权利要求1所述单克隆表面展示核酸适体快速筛选方法,其特征在于:步骤(4)中挑选出来的结合微球在试管内进行PCR扩增,获得高亲和性的核酸适体,直接进行测序,获得序列信息。
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