[发明专利]一种大肠杆菌O1、O2、O18、O78血清型检测试剂盒及其检测方法有效
申请号: | 201310297964.2 | 申请日: | 2013-07-16 |
公开(公告)号: | CN103305627A | 公开(公告)日: | 2013-09-18 |
发明(设计)人: | 于圣青;王少辉;孟庆美;韩先干;丁铲 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院上海兽医研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/19 |
代理公司: | 上海百一领御专利代理事务所(普通合伙) 31243 | 代理人: | 马育麟 |
地址: | 200241 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 大肠杆菌 o1 o2 o18 o78 血清 检测 试剂盒 及其 方法 | ||
1.一种用于检测大肠杆菌O1、O2、O18、O78血清型的引物组,其特征在于,包括以下引物,其核苷酸序列分别为:
ECO-F:5’-CGATGTTGAGCGCAAGGTTG-3’(SEQ ID NO.1)
O1-R:5’-CATTAGGTGTCTCTGGCACG-3’(SEQ ID NO.2)
O2-R:5’-GATAAGGAATGCACATCGCC-3’(SEQ ID NO.3)
O18-R:5’-AGAAGCATTGAGCTGTGGAC-3’(SEQ ID NO.4)
O78-R:5’-TAGGTATTCCTGTTGCGGAG-3’(SEQ ID NO.5);
正向引物ECO-F为高度保守的大肠杆菌O抗原合成相关基因序列,反向引物O1-R、O2-R、O18-R、O78-R分别为O1、O2、O18、O78血清型大肠杆菌O抗原合成相关基因的血清型特异性序列。
2.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,大肠杆菌O1、O2、O18、O78血清型特异性引物扩增的目的片段大小分别为:263bp、355bp、459bp和623bp。
3.权利要求1或2所述引物组在制备检测大肠杆菌O1、O2、O18、O78血清型试剂盒中的应用。
4.一种含权利要求1或2所述引物组的大肠杆菌O1、O2、O18、O78血清型检测试剂盒。
5.根据权利要求4所述的大肠杆菌O1、O2、O18、O78血清型检测试剂盒,其特征在于,其还含有10×Taq Buffer、Taq DNA聚合酶、MgCl2及dNTP。
6.根据权利要求5所述的大肠杆菌O1、O2、O18、O78血清型检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:10×Taq Buffer2.5μL、Taq DNA聚合酶(2.5U/μL)1.0μL、MgCl2(25mM)2.0μL、dNTPs混合溶液(每种为2.5mM)4.0μL、引物ECO-F和O1-R、O2-R、O18-R、O78-R各0.5μL。
7.一种检测大肠杆菌O1、O2、O18、O78血清型的方法,其特征在于,先将待测大肠杆菌菌液或待测大肠杆菌的DNA提取物作为模板,用权利要求1或2所述的正向引物ECO-F和反向引物O1-R、O2-R、O18-R、O78-R作为扩增引物,进行PCR扩增,对扩增产物进行检测,若电泳结果出现263bp条带为大肠杆菌O1血清型;出现355bp条带为大肠杆菌O2血清型;出现459bp条带为大肠杆菌O18血清型;出现623bp条带为大肠杆菌O78血清型。
8.根据权利要求7所述试剂盒在用于检测大肠杆菌O1、O2、O18、O78血清型的方法,其特征在于,PCR反应体系为25μL时含有:10×Taq Buffer2.5μL、Taq DNA聚合酶(2.5U/μL)1.0μL、MgCl2(25mM)2.0μL、dNTPs混合溶液(每种为2.5mM)4.0μL、引物ECO-F和O1-R、O2-R、O18-R、O78-R各0.5μL、模板1.0μL、超纯水12.0μL。
9.根据权利要求7或8所述试剂盒在用于检测大肠杆菌O1、O2、O18、O78血清型的方法,其特征在于,PCR反应参数:95℃预变性5min;95℃40s,55℃40s,72℃1min,30个循环;72℃10min。
10.根据权利要求7所述试剂盒在用于检测大肠杆菌O1、O2、O18、O78血清型的方法,其特征在于,包括下列步骤:
1)大肠杆菌模板的制备
将大肠杆菌菌株接种至LB液体培养基,37℃摇菌,至OD600=1.0,取1mL菌液12000r/min离心1min,去上清,灭菌超纯水洗3次,1mL灭菌超纯水重悬,制成模板备用;
2)特异性引物的制备
权利要求1所述的引物ECO-F和O1-R、O2-R、O18-R、O78-R的使用浓度为10pM;引物稀释液置于-20℃保存备用,避免反复冻融;
3)PCR反应体系的建立和扩增
取PCR管,分别加10×Taq Buffer2.5μL、Taq DNA聚合酶(2.5U/μL)1.0μL、MgCl2(25mM)2.0μL、dNTPs混合溶液(每种为2.5mM)4.0μL、引物ECO-F和O1-R、O2-R、O18-R、O78-R各0.5μL、模板1.0μL、超纯水12.0μL,混匀;PCR反应参数:95℃预变性5min;95℃40s,55℃40s,72℃1min,30个循环;72℃10min;
4)PCR检测结果判定与表述
取10μL PCR产物,点样于2.0%琼脂糖凝胶电泳板孔中,100V电压,电泳40min,于凝胶成像系统下拍照判定,判定前提条件为阴性对照无任何条带出现,具体判定方法:电泳结果出现263bp条带为大肠杆菌O1血清型;出现355bp条带为大肠杆菌O2血清型;出现459bp条带为大肠杆菌O18血清型;出现623bp条带为大肠杆菌O78血清型。
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