[发明专利]检测HIV-1病毒非核苷类抑制剂耐药突变法及试剂盒有效

专利信息
申请号: 201310088721.8 申请日: 2013-03-19
公开(公告)号: CN103215377A 公开(公告)日: 2013-07-24
发明(设计)人: 张琼;李兰娟;项春生;吴南屏 申请(专利权)人: 浙江大学
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93
代理公司: 杭州中成专利事务所有限公司 33212 代理人: 金祺
地址: 310058 浙江*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 检测 hiv 病毒 核苷 抑制剂 耐药 突变 试剂盒
【权利要求书】:

1.检测人类免疫缺陷病毒非核苷类逆转录酶抑制剂耐药突变的特异性探针,其特征是:包括以下8类特异性探针中的至少一类:

检测逆转录酶基因L100I突变的特异性探针,为SEQ ID NO:1~6中的任意一种或任意一种的互补序列;

检测逆转录酶基因K103N突变的特异性探针,为SEQ ID NO:7~12中的任意一种或任意一种的互补序列;

检测逆转录酶基因V106A和V106M突变的特异性探针,为SEQ ID NO:13~21中的任意一种或任意一种的互补序列;

检测逆转录酶基因V108I突变的特异性探针,为SEQ ID NO:22~27中的任意一种或任意一种的互补序列;

检测逆转录酶基因Y181C和Y181I突变的特异性探针,为SEQ ID NO:28~36中的任意一种或任意一种的互补序列;

检测逆转录酶基因Y188L 、Y188H和Y188C突变的特异性探针,为SEQ ID NO:37~50中的任意一种或任意一种的互补序列;

检测逆转录酶基因G190A突变的特异性探针,为SEQ ID NO:51~56中的任意一种或任意一种的互补序列;

检测逆转录酶基因P225H突变的特异性探针,为SEQ ID NO:57~65中的任意一种或任意一种的互补序列。

2.根据权利要求1所述的检测人类免疫缺陷病毒非核苷类逆转录酶抑制剂耐药突变的特异性探针,其特征是:

所述检测逆转录酶基因L100I突变的特异性探针中, SEQ ID NO:1~3中的任意一种为针对第100位氨基酸残基为L的HIV-1逆转录酶基因,SEQ ID NO:4~6中的任意一种为针对第100位氨基酸残基为I的HIV-1逆转录酶基因;

所述检测逆转录酶基因K103N突变的特异性探针中, SEQ ID NO:7~9中的任意一种为针对第103位氨基酸残基为K的HIV-1逆转录酶基因,SEQ ID NO:10~12中的任意一种针对第103位氨基酸残基为N的HIV-1逆转录酶基因;

所述检测逆转录酶基因V106A和V106M突变的特异性探针中, SEQ ID NO:13~15中的任意一种为针对第106位氨基酸残基为V的HIV-1逆转录酶基因,SEQ ID NO:16~18中的任意一种为针对第106位氨基酸残基为A的HIV-1逆转录酶基因,SEQ ID NO:19~21中为针对第106位氨基酸残基为M的HIV-1逆转录酶基因;

所述检测逆转录酶基因V108I突变的特异性探针中,SEQ ID NO:22~24中的任意一种为针对第108位氨基酸残基为V的HIV-1逆转录酶基因,SEQ ID NO:25~27中的任意一种为针对第108位氨基酸残基为I的HIV-1逆转录酶基因。

所述检测逆转录酶基因Y181C和Y181I突变的特异性探针中,SEQ ID NO:28~30中的任意一种为针对第181位氨基酸残基为Y的HIV-1逆转录酶基因,SEQ ID NO:31~33中的任意一种为针对第181位氨基酸残基为C的HIV-1逆转录酶基因,SEQ ID NO:34~36中的任意一种为针对第181位氨基酸残基为I的HIV-1逆转录酶基因;

所述检测逆转录酶基因Y188L 、Y188H和Y188C突变的特异性探针中, SEQ ID NO:37~39中的任意一种为针对第188位氨基酸残基为Y的HIV-1逆转录酶基因,SEQ ID NO:40~42中的任意一种为针对第188位氨基酸残基为L的HIV-1逆转录酶基因,SEQ ID NO:43~45中的任意一种为针对第188位氨基酸残基为H的HIV-1逆转录酶基因,SEQ ID NO:46~50中的任意一种为针对第188位氨基酸残基为C的HIV-1逆转录酶基因;

所述检测逆转录酶基因G190A突变的特异性探针中, SEQ ID NO:51~53中的任意一种为针对第190位氨基酸残基为G的HIV-1逆转录酶基因,SEQ ID NO:54~56中的任意一种为针对第190位氨基酸残基为A的HIV-1逆转录酶基因;

所述检测逆转录酶基因P225H突变的特异性探针中,SEQ ID NO:57~59中的任意一种为针对第225位氨基酸残基为P的HIV-1逆转录酶基因,SEQ ID NO:60~65中的任意一种为针对第225位氨基酸残基为H的HIV-1逆转录酶基因。

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