[发明专利]可逆终端及其合成和在DNA合成测序中的用途有效
申请号: | 201310015235.3 | 申请日: | 2013-01-15 |
公开(公告)号: | CN103087131A | 公开(公告)日: | 2013-05-08 |
发明(设计)人: | 沈玉梅;赵小东;邵志峰;龚兵;汤道年;李小卫;彭丽娜;邢宇洋;庄园;黎庆;伍新燕 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C07H19/10 | 分类号: | C07H19/10;C07H1/00;C12Q1/68 |
代理公司: | 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 | 代理人: | 郭国中;陈少凌 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 可逆 终端 及其 合成 dna 中的 用途 | ||
1.一种可逆终端,其结构式如式(I)所示:
其中R1为荧光素,R2为连接单元。
2.如权利要求1所述的可逆终端,其特征在于,所述可逆终端的结构式如式(II)所示:
3.如权利要求2所述的可逆终端,其特征在于,所述可逆终端是通过如下步骤合成的:
A、化合物F2的合成:在冰水浴搅拌条件下,摩尔比为1.0∶(1.2~2)的丙炔胺与三氟乙酸甲酯反应,得化合物F2
B、化合物F3的合成:在CuI、Pd(PPh3)4和TEA存在的条件下,化合物F2和F1反应,得化合物F3所述F1、F2、CuI、Pd(PPh3)4和TEA的摩尔比为1∶(2~3)∶0.072∶0.025∶(1.5~2);
C、化合物dUTP-NH2的合成:化合物F3与三正丁胺焦磷酸盐、2-氯-4H-1,3,2-苯并二氧磷-4-酮在三乙胺和碘存在下反应,反应产物去保护,得化合物dUTP-NH2所述三正丁胺焦磷酸盐、2-氯-4H-1,3,2-苯并二氧磷-4-酮和F3的摩尔比为2∶2∶1;
D、化合物dUTP-SPDP的合成:在TEA存在的条件下,化合物dUTP-NH2在碳酸钠碳酸氢钠缓冲液中,与以无水乙腈为溶剂的SPDP反应,得化合物dUTP-SPDP所述的dUTP-NH2和SPDP的摩尔比为1∶(1.5~3);
E、化合物RDM-SH的合成:在DTT存在的条件下,半胱胺在碳酸钠碳酸氢钠缓冲液中与化合物TAMRA(5/6)避光反应,得化合物RDM-SH所述TAMRA(5/6)、半胱胺和DTT的摩尔比为1∶(10~50)∶(40~70);
F、化合物dUTP-T的合成:以Na3PO4-EDTA缓冲液和乙腈为溶剂,化合物dUTP-SPDP与RDM-SH反应,得化合物dUTP-T;所述RDM-SH、dUTP-SPDP的摩尔比为1∶(1~2);所述化合物dUTP-T即具有式(II)所示结式的可逆终端。
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