[发明专利]一种直接从土壤或其他基质中快速检测鉴定香蕉穿孔线虫的方法无效
申请号: | 201210072011.1 | 申请日: | 2012-03-19 |
公开(公告)号: | CN102703582A | 公开(公告)日: | 2012-10-03 |
发明(设计)人: | 谢辉;徐春玲;刘一帆;李静;李冬丽;赵传波 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 林丽明 |
地址: | 510642 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 直接 土壤 其他 基质 快速 检测 鉴定 香蕉 穿孔 线虫 方法 | ||
1. 一种直接从土壤或其他基质中快速检测鉴定香蕉穿孔线虫的方法,其特征在于步骤如下:
(1)待检样品中DNA提取:
称取待检样品,与等重的直径0.5mm玻璃珠一起移至尖底离心管中,加入体积比为1:1的磷酸缓冲液和SDS缓冲液,翻转3~4次;
再加入体积比为24:1的氯仿和异戊醇,振荡后以3 000 rpm的速度离心,上清转移至一1.5 mL离心管;
加入预冷的醋酸钠,混匀,-20℃静置5min,常温离心,上清转移至另一新1.5 mL离心管;
加入冷异丙醇,静置20min,离心,沉淀加入体积百分含量为70%的乙醇洗涤,离心,弃上清,重复洗涤一次,离心;
沉淀自然风干,加入超纯水静置10min,获得DNA粗提液;
(2)使用Promega公司的Wizard DNA Clean-up Systems试剂盒纯化步骤(1)的DNA粗提液;
(3)PCR检测:以纯化的DNA为模板,SEQ ID NO:1~2所示核苷酸序列为引物,进行PCR扩增,如果扩增出518bp的核苷酸序列,则证明待检样品中有香蕉穿孔线虫。
2. 根据权利要求1所述直接从土壤或其他基质中快速检测鉴定香蕉穿孔线虫的方法,其特征在于步骤(3)所述PCR扩增反应使用的酶为TOYOBO公司的KOD FX酶。
3. 根据权利要求2所述直接从土壤或其他基质中快速检测鉴定香蕉穿孔线虫的方法,其特征在于步骤(3)所述PCR扩增的反应体系为25μL:DNA 模板5 μL,2×PCR buffer 12.5 μL,2mmol/L的 dNTP 5 μL,10 μmol/L的SEQ ID NO:1引物0.75 μL,10 μmol/L的SEQ ID NO:2引物0.75 μL,KOD FX酶 0.5 μL,用三蒸水补足体积;反应程序为:94℃预变性2 min,98℃变性10 s,50℃退火30 s,68℃延伸1 min,从变性到延伸进行35个循环,然后72℃再充分延伸5 min。
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