[发明专利]一种MICB基因分型的PCR-SBT方法及试剂盒有效
申请号: | 201110229780.3 | 申请日: | 2011-08-11 |
公开(公告)号: | CN102321749A | 公开(公告)日: | 2012-01-18 |
发明(设计)人: | 余平;龚拯;罗奇志;林琳;霍治;杜昆 | 申请(专利权)人: | 中南大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 长沙市融智专利事务所 43114 | 代理人: | 袁靖 |
地址: | 410083 湖南*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 micb 基因 pcr sbt 方法 试剂盒 | ||
1.一种MICB基因分型的PCR-SBT方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)、提取待测基因组DNA,使用PCR扩增引物扩增所要分析的目的基因片段MICB的2-5外显子及之间的内含子;
所述的扩增引物对为MICB-F和MICB-R
MICB-F:5’-GGACAGCAGACCTGTGTGTTA-3’
MICB-R:5’-GGAGATGGGAAAGCTCCTTT-3’;
所述PCR扩增反应条件依次为:
1)95℃5min;
2)重复以下19个循环:
94℃45s→65℃45s,每循环降低0.5℃→72℃2min;
3)重复以下13个循环:
94℃45s→55℃45s→72℃2min;
4)72℃10min;
5)4℃保持;
所述PCR反应体系为20μl,其组成如下:
浓度4ng/μl的DNA 10μl
1.49μl PCR缓冲液,所述的PCR缓冲液配制方法:10ml PCR缓冲液含:0.8g氨基丁三醇,0.22g硫酸氨,0.67ml 1M氯化镁,用盐酸调节pH到8.8;
1.49μl 5mM dNTP;
0.5μl 10μM上游引物MICB-F;
0.5μl 10μM下游引物MICB-R;
0.49μl 10%牛血清蛋白;
5.32μl 28%蔗糖/甲酚红染料;
0.12μl 5U/μl TaqDNA聚合酶;
加双蒸水补足体积;
(2)、使用测序引物对步骤(1)所得PCR产物进行扩增,然后对扩增出的各序列进行测序,并将测序结果与数据库中的标准序列进行比较,从而确定基因分型结果;
所述的用于测序分析的4条寡核苷酸测序引物;
MICB-CF1:5’-GGACAGCAGACCTGTGTGTTA-3’
MICB-CR2:5’-CCCTGTGCTATGGATGCA-3’
MICB-CF3:5’-CAGGAGTCCACCCTTGACAT-3’
MICB-CR4:5’-GGAGATGGGAAAGCTCCTTT-3’。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:
所述测序反应体系为10μl,其组成如下:
2μl PCR产物;
3μl Big Dye测序缓冲液;
1μl Big Dye测序末端;
0.25μl 10μM的测序引物;
3.75μl双蒸水;
所述测序扩增反应条件依次为:
1)重复以下24个循环:
96℃10s→50℃5s→60℃4min;
2)4℃5min。
3.一种权利要求1所述的方法配套的试剂盒,其特征在于,包括扩增所要分析的目的基因片段MICB的2-5外显子及之间的内含子的引物:
MICB-F:5’-GGACAGCAGACCTGTGTGTTA-3’
MICB-R:5’-GGAGATGGGAAAGCTCCTTT-3’;
以及用于测序分析的4条引物:
MICB-CF1:5’-GGACAGCAGACCTGTGTGTTA-3’
MICB-CR2:5’-CCCTGTGCTATGGATGCA-3’
MICB-CF3:5’-CAGGAGTCCACCCTTGACAT-3’
MICB-CR4:5’-GGAGATGGGAAAGCTCCTTT-3’。
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