[发明专利]一种MICB基因分型的PCR-SBT方法及试剂盒有效

专利信息
申请号: 201110229780.3 申请日: 2011-08-11
公开(公告)号: CN102321749A 公开(公告)日: 2012-01-18
发明(设计)人: 余平;龚拯;罗奇志;林琳;霍治;杜昆 申请(专利权)人: 中南大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 长沙市融智专利事务所 43114 代理人: 袁靖
地址: 410083 湖南*** 国省代码: 湖南;43
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摘要:
搜索关键词: 一种 micb 基因 pcr sbt 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种MICB基因分型的PCR-SBT方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)、提取待测基因组DNA,使用PCR扩增引物扩增所要分析的目的基因片段MICB的2-5外显子及之间的内含子;

所述的扩增引物对为MICB-F和MICB-R

MICB-F:5’-GGACAGCAGACCTGTGTGTTA-3’

MICB-R:5’-GGAGATGGGAAAGCTCCTTT-3’;

所述PCR扩增反应条件依次为:

1)95℃5min;

2)重复以下19个循环:

94℃45s→65℃45s,每循环降低0.5℃→72℃2min;

3)重复以下13个循环:

94℃45s→55℃45s→72℃2min;

4)72℃10min;

5)4℃保持;

所述PCR反应体系为20μl,其组成如下:

浓度4ng/μl的DNA 10μl

1.49μl PCR缓冲液,所述的PCR缓冲液配制方法:10ml PCR缓冲液含:0.8g氨基丁三醇,0.22g硫酸氨,0.67ml 1M氯化镁,用盐酸调节pH到8.8;

1.49μl 5mM dNTP;

0.5μl 10μM上游引物MICB-F;

0.5μl 10μM下游引物MICB-R;

0.49μl 10%牛血清蛋白;

5.32μl 28%蔗糖/甲酚红染料;

0.12μl 5U/μl TaqDNA聚合酶;

加双蒸水补足体积;

(2)、使用测序引物对步骤(1)所得PCR产物进行扩增,然后对扩增出的各序列进行测序,并将测序结果与数据库中的标准序列进行比较,从而确定基因分型结果;

所述的用于测序分析的4条寡核苷酸测序引物;

MICB-CF1:5’-GGACAGCAGACCTGTGTGTTA-3’

MICB-CR2:5’-CCCTGTGCTATGGATGCA-3’

MICB-CF3:5’-CAGGAGTCCACCCTTGACAT-3’

MICB-CR4:5’-GGAGATGGGAAAGCTCCTTT-3’。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:

所述测序反应体系为10μl,其组成如下:

2μl PCR产物;

3μl Big Dye测序缓冲液;

1μl Big Dye测序末端;

0.25μl 10μM的测序引物;

3.75μl双蒸水;

所述测序扩增反应条件依次为:

1)重复以下24个循环:

96℃10s→50℃5s→60℃4min;

2)4℃5min。

3.一种权利要求1所述的方法配套的试剂盒,其特征在于,包括扩增所要分析的目的基因片段MICB的2-5外显子及之间的内含子的引物:

MICB-F:5’-GGACAGCAGACCTGTGTGTTA-3’

MICB-R:5’-GGAGATGGGAAAGCTCCTTT-3’;

以及用于测序分析的4条引物:

MICB-CF1:5’-GGACAGCAGACCTGTGTGTTA-3’

MICB-CR2:5’-CCCTGTGCTATGGATGCA-3’

MICB-CF3:5’-CAGGAGTCCACCCTTGACAT-3’

MICB-CR4:5’-GGAGATGGGAAAGCTCCTTT-3’。

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