[发明专利]对多重核酸扩增中的光谱串扰的补偿有效
| 申请号: | 201080040425.5 | 申请日: | 2010-08-31 |
| 公开(公告)号: | CN102482720A | 公开(公告)日: | 2012-05-30 |
| 发明(设计)人: | 彼得·D·陆德外斯 | 申请(专利权)人: | 3M创新有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 中原信达知识产权代理有限责任公司 11219 | 代理人: | 梁晓广;关兆辉 |
| 地址: | 美国明*** | 国省代码: | 美国;US |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 多重 核酸 扩增 中的 光谱 补偿 | ||
1.一种方法,包括:
利用检测探针执行核酸样品的核酸扩增,其中所述核酸扩增发生于多个询问周期内;
对于所述多个询问周期的每一个从所述核酸扩增采集指示核酸存在量的扩增数据;
基于所述扩增数据,确定与所述检测探针的光谱邻近者相关的串扰校正值,以减少来自所述光谱邻近者的光谱串扰;以及
将所述串扰校正值应用于从核酸样品的核酸扩增收集的扩增数据。
2.根据权利要求1所述的方法,
其中执行所述核酸扩增包括将所述检测探针应用于所述核酸样品;以及
扫描多个通道的每一个以检测所述通道上能够归因于所述检测探针的扩增数据,其中所述多个通道中的一个被构造为检测由所述检测探针引起的扩增数据,并且其中所述多个通道中的其他通道被构造为不检测由所述检测探针引起的扩增数据;
其中确定所述串扰校正值包括基于所识别的扩增数据来确定所述串扰校正值,所述识别的扩增数据与被构造为不检测由所述检测探针引起的扩增数据的多个通道中的一个相关。
3.根据权利要求1或2所述的方法,还包括:
从所述扩增数据生成扩增曲线,所述扩增曲线表示所述核酸样品的生长对询问周期的曲线;以及
在确定与所述光谱邻近者相关的所述串扰校正值之前,基于阈值距离来确定所述光谱邻近者,所述阈值距离为用于被构造为检测由所述检测探针引起的扩增数据的通道的峰值荧光与用于所述光谱邻近者的峰值荧光之间的阈值距离。
4.根据权利要求1或2所述的方法,其中所述核酸扩增使用多个光学模块,每一光学模块与用于不同荧光染料的光学检测的不同通道相关。
5.根据权利要求1或2所述的方法,还包括:用所确定的串扰校正值来校准执行所述核酸扩增的核酸扩增装置。
6.根据权利要求1或2所述的方法,还包括:
从所述探针所检测的所述扩增数据减去背景信号,以获得所述探针的经背景校正的信号;
对于多个选择的询问周期的每一个,计算所述光谱邻近者的信号与所述探针的经背景校正的信号的比率;
对所述多个选择的询问周期上计算出的比率取平均;以及
将所述计算出的比率的平均值识别为所述探针的所述串扰校正值。
7.根据权利要求6所述的方法,其中所述选择的询问周期包括选自发生于阈值循环Ct之后的那些询问周期的询问周期。
8.一种方法,包括:
执行核酸样品的多重核酸扩增,其中所述多重核酸扩增包括多个询问周期;
对于所述多个询问周期的每一个从所述核酸扩增采集指示核酸存在量的扩增数据;
将串扰校正值应用于所述扩增数据,以产生减少了来自光谱邻近者的光谱串扰信号的修正扩增数据,其中所述串扰校正值基于第二核酸样品的多重核酸扩增而得到;以及
显示所述修正扩增数据。
9.根据权利要求8所述的方法,其中将所述串扰校正值应用于所述扩增数据包括:
从所述扩增数据减去背景信号以获得经背景校正的信号;以及
从所述经背景校正的信号减去所述串扰校正值与所述光谱邻近者所检测的信号的乘积。
10.根据权利要求9所述的方法,其中所述串扰校正值通过对于多个选择的询问周期的每一个计算所述光谱邻近者的信号与所述探针的经背景校正的信号的比率,并对所述多个选择的询问周期上计算出的比率取平均来确定。
11.根据权利要求8所述的方法,其中应用所述校正因子包括将所述校正因子应用于执行所述多重核酸扩增的多重核酸扩增装置。
12.根据权利要求8所述的方法,其中应用所述串扰校正因子包括将所述校正因子应用于与执行所述多重核酸扩增的多重核酸扩增装置通信的扩增装置。
13.根据权利要求8所述的方法,其中所述核酸扩增使用多个光学模块,每一光学模块与用于不同荧光染料的光学检测的不同通道相关。
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