[发明专利]致病性嗜水气单胞菌的LAMP检测试剂盒及检测方法有效
| 申请号: | 201010611571.0 | 申请日: | 2010-12-29 |
| 公开(公告)号: | CN102140512A | 公开(公告)日: | 2011-08-03 |
| 发明(设计)人: | 潘晓艺;沈锦玉;郝贵杰;姚嘉赟;徐洋;尹文林 | 申请(专利权)人: | 浙江省淡水水产研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 | 代理人: | 梁寅春 |
| 地址: | 313001 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 致病性 水气 单胞菌 lamp 检测 试剂盒 方法 | ||
1.致病性嗜水气单胞菌的LAMP检测试剂盒,包括细菌DNA提取试剂和LAMP反应试剂,所述LAMP反应试剂中含有用于检测致病性嗜水气单胞菌的LAMP扩增用核酸引物组,该引物组包含引物AH.PV-FIP、引物AH.PV-BIP、引物AH.PV-F3、引物AH.PV-B3,其特征是所述引物AH.PV-FIP、引物AH.PV-BIP、引物AH.PV-F3、引物AH.PV-B3分别为:
AH.PV-FIP:
GTTTCCCCCATCAGATCCGTGGTTTACGCCACCCAGTTTCTTG
AH.PV-BIP:
TCCGGCCTGTATACCTGTATCAGGTTAAACCAGGGTGTCATCGCT
AH.PV-F3:TGATGGCACGAGACATCCA
AH.PV-B3:TGCTTGATCCCCTTGCTACT
所述LAMP反应试剂包括以下组分:
(1)LAMP预反应液:20~25mM pH为8.2~9.0的Tris-HCl、6~10mM硫酸镁、10~12mM氯化钾、8~12mM硫酸按、0.1~0.2%Triton X-100(或是0.1~0.2%Tween 20)、1~1.6mM dNTP、0.6~1.0M甜菜碱、1.5~2.2uM所述引物AH.PV-FIP、1.5~2.2uM所述引物AH.PV-BIP、0.15~0.3uM所述引物AH.PV-F3、0.15~0.3uM所述引物AH.PV-B3;
(2)聚合酶:每微升含8个活性单位的Bst DNA聚合酶;
(3)LAMP反应稳定液:由矿物油或液体石蜡油组成;
(4)LAMP反应显色液:含有10%SYBR Green工的荧光染料;
所述细菌DNA提取试剂包含以下组分:TE缓冲液,5-15mM Tris,0.5-1.5mM EDTA,pH 8.0;溶菌酶,浓度10-20mg/mL,pH8.0;蛋白酶K溶液,浓度10-20mg/mL,pH8.0;Tris饱和酚,pH8.0;乙酸钠,浓度2-5mol/L;乙醇,浓度95%。
2.如权利要求1所述的试剂盒,其特征是所述LAMP预反应液还含有0.6~1.2uM引物AH.PV-LB和0.6~1.2uM引物AH.PV-LF,所述引物AH.PV-LB和引物AH.PV-LF分别为:
AH.PV-LF:GACCGGCTGCCAGAAGGAG
AH.PV-LB:GTGCGCTATGACAACGATGAA。
3.如权利要求1或2所述的试剂盒,其特征还具有阳性对照试样和阴性对照试样,所述阳性对照试样为致病性嗜水气单胞菌基因组DNA,所述的阴性对照试样为非致病性嗜水气单胞菌基因组DNA。
4.致病性嗜水气单胞菌的LAMP检测方法,其特征是按以下步骤:
(1)DNA抽提:
挑取纯化的菌落若干加入到pH8.0的100μL TE缓冲液中振荡混匀,加入100μL溶菌酶溶液,37℃保温10分钟,再加蛋白酶K溶液10μL于55℃保温1-2小时,加同体积Tris饱和酚,pH8.0,强烈振荡,12000rpm离心5分钟,取上清液,重复酚抽提;取上清液,加入0.1倍体积的乙酸钠(3mol/L),混匀,再加等体积的冰乙醇,混匀后低温静置30分钟,12000rpm离心5分钟,弃上清,加70%冷乙醇洗涤一次,室温下12000rpm离心5分钟,弃上清,加入100μL TE溶液,得到待检基因组DNA溶液;
(2)致病性嗜水气单胞菌的LAMP扩增:
①.根据待检测样品的数目,设置所需LAMP反应管数N,N=样品数+2(其中1管为阳性对照,1管为阴性对照);
②.吸取权利要求1所述LAMP预反应液的体积为N×23uL,加入一洁净的1.5mL离心管中,然后加入N u L Bst DNA聚合酶,混合均匀,1500~2000转/分钟离心10秒,取上清之混合液;
③.向设定的N个反应管中分别加入24u L②步所述混合液,向上述N个PCR反应管内按顺序依次分别加入阴性对照DNA、待检模板DNA和阳性对照DNA各1uL;
④.然后在上述每个反应管中再分别加入30u L LAMP反应稳定液,盖紧管盖并做好标记,2000转/分钟离心5秒;
⑤.在61℃~67℃下恒温反应40~70分钟;
(3)显色检测:
取出LAMP反应管,冷却至室温,2000转/分钟离心5秒,按照阴性对照、待检样品和阳性对照的顺序依次分别加入1uL显色液,轻轻混匀,直接用肉眼观察颜色变化。
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