[发明专利]基于G4DNA酶显色的可视化基因鉴别检测试剂的制备方法有效
申请号: | 201010555428.4 | 申请日: | 2010-11-23 |
公开(公告)号: | CN102041317A | 公开(公告)日: | 2011-05-04 |
发明(设计)人: | 王毅;鲁小璐 | 申请(专利权)人: | 成都巨星猪业有限公司;王毅 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/78 |
代理公司: | 成都天嘉专利事务所(普通合伙) 51211 | 代理人: | 赵丽 |
地址: | 611200 四川*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 sub dna 显色 可视化 基因 鉴别 检测 试剂 制备 方法 | ||
1.基于G4DNA酶显色的可视化基因鉴别检测试剂的制备方法,其特征在于:包括如下步骤:
A、目标基因的提取
选取经猪瘟病毒感染后的细胞,经-70℃冻融3次,每次10-30分钟后,取200μl加RNA裂解液1ml混匀,室温静置10-15分钟,加0.2ml氯仿,再室温静置3-5分钟,于4℃ 12000g/min离心10-15分钟,上清液转移到另一个离心管,加0.5ml异丙醇,室温沉淀10-20分钟,再于4℃ 12000g/min离心10分钟,轻轻倒出上清,加1ml 75%乙醇于4℃ 7500g/min离心5分钟,弃上清,RNA沉淀在室温下自然晾干,加DEPC处理过的水20μl得到目标基因RNA;
B、cDNA的制备
采用基因提取试剂盒取步骤A所得到的目标基因RNA 10μl,加入反向引物 W3(-)1μl(20μmol/L)和dNTPs 1μl(10μmol/L),65℃孵育5分钟,再迅速置冰上5分钟,然后加逆转录反应缓冲液4μl(5×buffer),RNA酶抑制剂1μl,DTT 2μl(0.1mol/L),MMLV逆转录酶1μl,于42℃反应50分钟、75℃反应10分钟,即得到cDNA;
C、不对称PCR的扩增
取步骤B制好的cDNA 5μl,加入到100μl的不对称PCR体系中进行反应,循环条件为:95℃预变性2分钟;94℃变性15 秒,53℃退火15秒,72℃延伸15秒,扩增50-100个循环;最后72℃延伸10分钟,得到PCR产物;
D、G4DNA酶显色反应
分别取G4DNA酶显色反应缓冲液20μl、上游探针Prob1L 2μl(20μmol/L)、下游探针Prob1R 2μl(20μmol/L),竞争性探针Prob1C 6μl(20μmol/L),加无菌双蒸水补足为91μl,加入至步骤C所得的含有100μl不对称PCR反应液的200μl PCR管中,95℃变性5 min;30℃ 退火3min,加入Hemin底物0.5μl (50mmmol/L),放置5min,再加入8μl(50 mmol/L)ATBS和0.5μl(1 mol/L)H2O2显色,观察有无肉眼可见的绿色出现。
2.如权利要求1所述基于G4DNA酶显色的可视化基因鉴别检测试剂的制备方法,其特征在于:步骤B所述反向引物W3(-)的序列是5' GTCCAACTGTGGACGTCAGGAA 3'。
3.如权利要求1所述基于G4DNA酶显色的可视化基因检测试剂的制备方法,其特征在于:步骤B所述逆转录反应缓冲液的组成为:250 mmol/L pH 8.3的Tris-HCl,375 mmol/L KCl,15 mmol/L MgCl2。
4.如权利要求1所述基于G4DNA酶显色的可视化基因鉴别检测试剂的制备方法,其特征在于:步骤C所述100μl不对称PCR体系的组成为:正向引物W3(+)2μl(0.4-4μmol/L)和反向引物W3(-)2μl(20μmol/L),PCR溶液10μl (10×buffer),MgCl2 溶液8μl(2.5mmol/L),dNTPs溶液2μl(10mmol/L),Taq DNA聚合酶2μl (2U)以及余量的无菌双蒸水。
5.如权利要求1或5所述基于G4DNA酶显色的可视化基因鉴别检测试剂的制备方法,其特征在于:所述不对称PCR体系中的正向引物W3(+)序列是:5'-gcgcgggtaacccgggat-3' ,反向引物W3(-)序列是:5' - GTCCAACTGTGGACGTCAGGAA - 3'。
6.如权利要求1所述基于G4DNA酶显色的可视化基因鉴别检测试剂的制备方法,其特征在于:步骤D所述G4DNA酶显色反应缓冲液的组成包括:100 mmol/L 的4-羟乙基哌嗪乙磺酸10μl,2 mol/L的氯化钠和0.2mol/L的氯化钾共10μl。
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