[发明专利]食源性致病菌多重扩增内标序列及其制备方法有效
申请号: | 201010300888.2 | 申请日: | 2010-01-28 |
公开(公告)号: | CN101717829A | 公开(公告)日: | 2010-06-02 |
发明(设计)人: | 史贤明;何晓华;刘斌;施春雷 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12N15/10 |
代理公司: | 上海交达专利事务所 31201 | 代理人: | 王锡麟;王桂忠 |
地址: | 200240 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 食源性 致病菌 多重 扩增 序列 及其 制备 方法 | ||
1.一种食源性致病菌PCR检测中的多重扩增内标序列,其特征在于,该序列的碱基序列 如下:
1054F--15bp--hlyAF--15bp--PrsF--15bp--PSF--15bp--SA1F--扩增内标序列--SA1R--15bp --hlyAR--15bp--PSR---15bp--PrsR--15bp--1054R;
其中,
所述1054F的碱基序列如SEQ ID NO:8所示;
所述1054R的碱基序列如SEQ ID NO:9所示;
所述hlyAF的碱基序列如SEQ ID NO:10所示;
所述hlyAR的碱基序列如SEQ ID NO:11所示;
所述PrsF的碱基序列如SEQ ID NO:12所示;
所述PrsR的碱基序列如SEQ ID NO:13所示;
所述PSF的碱基序列如SEQ ID NO:14所示;
所述PSR的碱基序列如SEQ ID NO:15所示;
所述SA1F的碱基序列如SEQ ID NO:16所示;
所述SA1R的碱基序列如SEQ ID NO:17所示;
所述15bp为由如SEQ ID NO:18所示的的碱基序列随机重排后得到的任一序列;
所述多重扩增内标序列的碱基序列如SEQ ID NO:2所示。
2.一种根据权利要求1所述的食源性致病菌PCR检测中的多重扩增内标序列的制备方法, 其特征在于,包括如下步骤:
步骤一,随机重排SEQ ID NO:1所示的碱基序列,得到相应的核酸,选取与所要检测的 五种目的基因无同源性的任一核酸作为扩增内标序列;所述五种目的基因具体为碱基序列分别 如SEQ ID NO:3~7所示的基因;
随机重排碱基序列ATTTCCAAGGTGAGC,选择任一序列作为长度为15bp的序列;
步骤二,采用常规多重扩增内标构建方法,利用步骤一所得的扩增内标序列、长度为15bp 的序列以及碱基序列如SEQ ID NO:8~17所示的10条序列构建如下的多重扩增内标:
1054F--15bp--hlyAF--15bp--PrsF--15bp--PSF--15bp--SA1F--扩增内标序列--SA1R--15bp --hlyAR--15bp--PSR--15bp--PrsR--15bp--1054R。
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