[发明专利]检测含有筛选基因Hpt的转基因植物及产品的基因芯片及其应用

权利要求书

1.一种检测含有筛选基因Hpt的转基因植物及其产品的基因芯片，其特征在于：包括表面醛基化修饰的载玻片和阵列涂布于其上的筛选基因Hpt探针以及核酸固定的阳性对照、杂交阳性对照、阳性质控探针、阴性质控探针和空白对照；

所述阳性质控探针为18S rRNA，其探针序列为：

NH₂-(CH₂)₆-O-Poly(dT)15-ATGGTGGTGACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCG；

所述阴性质控探针为SHDC-人类表达特异蛋白基因，其探针序列为：

NH₂-(CH₂)₆-O-Poly(dT)15-ATTGCCAGAAGACATCCTTACTTTTATGCCCCGGAACTCC；

所述空白对照为点样液为双蒸水；

所述的筛选基因Hpt探针序列为

NH2-(CH2)6-O-Poly(dT)15-ATTTCGATGATGCAGCTTGGGCGCAGG GTCGATGCGACGC。

2.根据权利要求1所述的检测含筛选基因Hpt的转基因植物及其产品的基因芯片，其特征在于，还包括探针对照，探针对照选自转基因玉米Bt176转化体特异性探针、转基因玉米Bt11转化体特异性探针、转基因玉米TC1507转化体特异性探针、转基因玉米Mon810转化体特异性探针、转基因玉米GA21转化体特异性探针。

3.根据权利要求2所述的检测转基因植物及其产品筛选基因Hpt的基因芯片，其特征在于：探针对照的点样浓度为25μmol/L。

4.根据权利要求1或2所述的检测含筛选基因Hpt转基因植物及其产品的基因芯片，其特征在于：所述的阳性对照、杂交阳性对照、阳性质控探针、阴性质控探针、空白对照、筛选基因Hpt探针的点样浓度均为25μmol/L。

5.根据权利要求1或2所述的检测转基因植物及其产品筛选基因Hpt的基因芯片在检测转基因植物及其产品筛选基因Hpt特异性中的应用。

6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，所述基因芯片应用的方法是：提取待测植物的基因组DNA，然后在二重荧光PCR反应体系中扩增；然后取PCR产物，与杂交液混匀后，于PCR仪中95℃热变性10min，冰浴骤冷后加样于芯片上的点样区，盖玻片封片；42C水浴杂交2h；杂交后，芯片分别在42℃的洗液I和洗液II中各清洗4min，500r/min离心甩干，用晶芯LuxScanTM 10K激光共聚焦扫描仪进行扫描，波长532nm；PMT为850V，Power为90V，产生分析精度为10μm的16位TIFF图像；用LuxScan3.0软件进行数据采集和图像分析，分析扫描图像的荧光强度值以确定待测植物是否含有Hpt基因；

所述杂交液包括：3×SSC缓冲液，0.2％SDS，25％甲酰胺，5×Denhart’s，33nmol/L PC杂交阳性对照样品；

所述洗液I包括：2×SSC缓冲液，0.1×SDS；

所述洗液II为0.2×SSC缓冲液。