[发明专利]检测胰腺癌的基因芯片及其应用

说明书

技术领域

本发明涉及一种基因芯片，尤其涉及一种检测胰腺癌的基因芯片及其应用。

背景技术

胰腺癌是常见恶性肿瘤之一，近年来发病率呈升高趋势，且缺乏有效的诊断方法和治疗措施，因此造成胰腺癌病人发现晚、预后差、死亡率高。对普通和高危人群进行定期筛查，是提高早期诊断率并及时发现疾病的有效措施之一。

事实上，胰腺癌的发生发展涉及多个基因表达改变。如果在胰腺癌发生早期就从基因水平对癌症进行诊断，检测重要相关基因的表达变化，将有利于癌症的早期发现和早期治疗，提高病人的生存率。

基因芯片是人类基因组计划带来的最具应用价值的科研成果，它融合了生命科学、化学、微电子技术、计算机科学、统计学和生命信息学等多种学科的最新技术。随着微加工技术的发展，高密度寡核苷酸芯片最高密度可达上百万个探针，因此基因芯片通量水平并不受芯片技术本身制约，而是受样本的处理和基因芯片设计方法的限制。基因芯片作为一种高通量的、先进的分子生物学技术，可应用于疾病基因表达变化的检测，其具有高度的灵敏性和准确性、快速便捷、并可同时检测多个基因表达变化等优点。

目前有关胰腺癌的免疫学诊断产品及PCR产品单一标志物检测灵敏度和特异性存在不能兼顾的缺点，鉴于目前检测胰腺癌的传统方法效果不佳，有必要利用基因芯片技术开发一种检测胰腺癌的基因芯片，从而能够在胰腺癌发生发展早期即进行有效诊断，以提高治愈率降低死亡率。

发明内容

本发明要解决的技术问题是提供一种检测胰腺癌的基因芯片，能够在胰腺癌发生发展早期即进行有效检测，以提高治愈率降低死亡率。为此，本发明还要提供应用该基因芯片检测胰腺癌的方法。

为了解决上述技术问题，本发明通过如下技术方案实现：

在本发明的一个方面，提供了一种检测胰腺癌的基因芯片，包括固相载体和探针，所述探针与待测胰腺癌相关基因的核苷酸序列和/或其互补序列进行杂交，所述待测胰腺癌相关基因包括P21，smad4，P16，c-Myc，bcl-2，Fas，CA19-9，SERPINB9，RHOT1和P53基因。

本发明中所述固相载体可选用领域周知的载体，只要所述载体与所述反应物相容，不会影响检测结果就可以。优选的，本发明所述固相载体选材为玻片、硅片、硝酸纤维素膜、尼龙膜和高分子材料中的一种或它们的任意组合。

所述探针可以是DNA、RNA、DNA-RNA嵌合体、PNA或其衍生物。所述探针的长度没有限制，只要能完成与目的核苷酸序列特异性结合。由于不同的探针长度对杂交效率、信号特异性有不同的影响，所述探针的长度通常至少是14个碱基对，最长一般不超过30个碱基对，与目的核苷酸序列互补的长度以15-25个碱基对之间的为最佳。所述探针的自身互补序列最好少于6个碱基对，以免影响杂交效率。

本发明基因芯片的探针为DNA，包括：

(1)与待测P21基因杂交的(a)SEQ ID NO：1所示序列，(b)SEQ ID NO：1所示序列的互补链，(c)与SEQ ID NO：1所示序列有至少70％同源性的序列；

(2)与待测smad4基因杂交的(a)SEQ ID NO：2所示序列，(b)SEQ ID NO：2所示序列的互补链，(c)与SEQ ID NO：2所示序列有至少70％同源性的序列；

(3)与待测P16基因杂交的(a)SEQ ID NO：3所示序列，(b)SEQ ID NO：3所示序列的互补链，(c)与SEQ ID NO：3所示序列有至少70％同源性的序列；

(4)与待测c-Myc基因杂交的(a)SEQ ID NO：4所示序列，(b)SEQ ID NO：4所示序列的互补链，(c)与SEQ ID NO：4所示序列有至少70％同源性的序列；

(5)与待测bcl-2基因杂交的(a)SEQ ID NO：5所示序列，(b)SEQ ID NO：5所示序列的互补链，(c)与SEQ ID NO：5所示序列有至少70％同源性的序列；

(6)与待测Fas基因杂交的(a)SEQ ID NO：6所示序列，(b)SEQ ID NO：6所示序列的互补链，(c)与SEQ ID NO：6所示序列有至少70％同源性的序列；

(7)与待测CA19-9基因杂交的(a)SEQ ID NO：7所示序列，(b)SEQ ID NO：7所示序列7的互补链，(c)与SEQ ID NO：7所示序列有至少70％同源性的序列；