[发明专利]检测胰腺癌的基因芯片及其应用

权利要求书

1.一种检测胰腺癌的基因芯片，包括固相载体和探针，其特征在于，所述探针与待测胰腺癌相关基因的核苷酸序列和/或其互补序列进行杂交，所述待测胰腺癌相关基因包括P21，smad4，P16，c-Myc，bcl-2，Fas，CA19-9，SERPINB9，RHOT1和P53基因。

2.如权利要求1所述的基因芯片，其特征在于，所述探针为DNA、RNA、DNA-RNA嵌合体、PNA或其衍生物。

3.如权利要求2所述的检测芯片，其特征在于，所述探针为DNA，包括：

(1)与待测P21基因杂交的(a)SEQ ID NO：1所示序列，(b)SEQ ID NO：1所示序列的互补链，(c)与SEQ ID NO：1所示序列有至少70％同源性的序列；

(2)与待测smad4基因杂交的(a)SEQ ID NO：2所示序列，(b)SEQ ID NO：2所示序列的互补链，(c)与SEQ ID NO：2所示序列有至少70％同源性的序列；

(3)与待测P16基因杂交的(a)SEQ ID NO：3所示序列，(b)SEQ ID NO：3所示序列的互补链，(c)与SEQ ID NO：3所示序列有至少70％同源性的序列；

(4)与待测c-Myc基因杂交的(a)SEQ ID NO：4所示序列，(b)SEQ ID NO：4所示序列的互补链，(c)与SEQ ID NO：4所示序列有至少70％同源性的序列；

(5)与待测bcl-2基因杂交的(a)SEQ ID NO：5所示序列，(b)SEQ ID NO：5所示序列的互补链，(c)与SEQ ID NO：5所示序列有至少70％同源性的序列；

(6)与待测Fas基因杂交的(a)SEQ ID NO：6所示序列，(b)SEQ ID NO：6所示序列的互补链，(c)与SEQ ID NO：6所示序列有至少70％同源性的序列；

(7)与待测CA19-9基因杂交的(a)SEQ ID NO：7所示序列，(b)SEQ ID NO：7所示序列7的互补链，(c)与SEQ ID NO：7所示序列有至少70％同源性的序列；

(8)与待测SERPINB9基因杂交的(a)SEQ ID NO：8所示序列，(b)SEQ ID NO：8所示序列8的互补链，(c)与SEQ ID NO：8所示8序列有至少70％同源性的序列；

(9)与待测RHOT1基因杂交的(a)SEQ ID NO：9所示序列，(b)SEQ ID NO：9所示序列的互补链，(c)与SEQ ID NO：9所示序列有至少70％同源性的序列；

(10)与待测P53基因杂交的(a)SEQ ID NO：10所示序列，(b)SEQ ID NO：10所示序列的互补链，(c)与SEQ ID NO：10所示序列有至少70％同源性的序列。

4.如权利要求3所述的检测芯片，其特征在于，所述探针选自：SEQ ID NO：1～SEQ ID NO：10所示序列。

5.一种应用权利要求1所述基因芯片对胰腺癌进行检测的方法，其特征在于，包括如下步骤：

(1)在固相载体表面点载权利要求1所述的探针；

(2)抽提待测样品的总RNA，纯化总RNA；

(3)反转录合成cDNA，标记cRNA合成，纯化cRNA；

(4)标记cRNA样品，纯化标记的cRNA样品；

(5)cRNA样品片段化；

(6)芯片杂交；

(7)芯片洗涤，芯片扫描，检测杂交反应的结果。

6.如权利要求5所述的方法，其特征在于，步骤(3)和步骤(4)中所述的标记采用荧光素标记、生物素标记、电化学发光标记、放射性元素标记或酶标记。

7.如权利要求5所述的方法，其特征在于，步骤(6)中所述的芯片杂交的杂交温度为63～68℃，杂交时间为15～20小时。