[发明专利]竞争性交替结合猝灭探针环介导等温扩增快速检测方法无效
申请号: | 200910040402.3 | 申请日: | 2009-06-19 |
公开(公告)号: | CN101575642A | 公开(公告)日: | 2009-11-11 |
发明(设计)人: | 石磊;常彦磊;姜晓冰;王秋艳;闫鹤;鲁曦 | 申请(专利权)人: | 华南理工大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64;C12R1/19 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 | 代理人: | 何淑珍 |
地址: | 510640广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 竞争性 交替 结合 探针 环介导 等温 扩增 快速 检测 方法 | ||
1、一种竞争性交替结合猝灭探针环介导等温扩增的快速检测方法,其特征在于,按如下步骤进行:
(1)将细胞悬浮于生理盐水中,离心,去掉上清,然后用磷酸缓冲液冲洗细胞,加入样品预处理液200~500μl,剧烈震荡混匀;
(2)将震荡混匀后的细胞溶液在100℃加热10~20分钟,冰浴10~20分钟,离心,取上清作为模板DNA;
(3)在PCR反应管中加入模板DNA,目标DNA序列的上游引物和下游引物,dNTPs,rTaq酶,10×PCR反应缓冲液,加双蒸水,进行反应,PCR产物即为目标DNA;
(4)竞争DNA序列上游序列的扩增,在PCR反应管中加入模板DNA,竞争DNA上游序列的上游引物和下游引物,dNTPs,rTaq酶,10×PCR反应缓冲液,加双蒸水,进行反应,PCR产物即为竞争DNA序列的上游序列;
(5)竞争DNA序列下游序列的扩展,在PCR反应管中加入模板DNA、竞争DNA序列下游序列的上游引物和下游引物,dNTPs,rTaq酶,10×PCR反应缓冲液,加双蒸水,进行反应,PCR产物即为竞争DNA序列的下游序列;
(6)竞争DNA的获得,分别回收纯化竞争DNA序列的上游序列和下游序列,混合后稀释,取5μl作为模板加入到PCR反应管中,然后依次加入上游序列的上游引物和下游序列的下游引物,dNTPs,Taq Plus扩增酶,10×PCR反应缓冲液,加双蒸水,进行反应,PCR产物即为竞争DNA,稀释后,通过分光光度计测定竞争DNA的浓度C;
(7)在PCR管加入交替结合淬灭探针,环介导等温扩增引物混合物,反应缓冲液,BstDNA聚合酶,竞争DNA,加水,65~70℃反应45~50分钟,测定反应前Fb和反应后的荧光强度Fe,计算FC,FC=Fe/Fb;
(8)在PCR管加入交替结合淬灭探针,环介导等温扩增引物混合物,反应缓冲液,Bst DNA聚合酶,目标DNA,加水,65~70℃反应45~50分钟,测定反应前Fb和反应后的荧光强度Fe,计算FT,FT=Fe/Fb;
(9)在PCR管加入交替结合淬灭探针,环介导等温扩增引物混合物,反应缓冲液,BstDNA聚合酶,浓度为X的模板DNA,加水,65~70℃反应45~50分钟,测定反应前Fb和反应后的荧光强度Fe;
(10)根据以下公式计算模板DNA的浓度
Fe/Fb=FT[X/(X+C)]+FC[C/(X+C)]=[C(FC-FT)/(X+C)]+FT。
2、根据权利要求1所述的快速检测方法,其特征在于所述的进行反应为95~100℃预变性10~15min;94~100℃变性30~35s,50~60℃退火30~35s,72~75℃延伸30~35s,进行30个循环;最后于72~75℃延伸5~10min。
3、根据权利要求1所述的快速检测方法,其特征在于,所述交替结合淬灭探针的3’末端由氟硼荧光染料进行标记,5’末端为磷酸化处理。
4、根据权利要求3所述的快速检测方法,其特征在于所述的荧光为氟硼荧光染料。
5、根据权利要求1所述的快速检测方法,其特征在于所述的Bst DNA聚合酶的浓度为8000U/ml,dNTPs浓度为10mmol/L,Taq Plus扩增酶浓度为5000U/ml,rTaq酶浓度为5000U/ml;所述的磷酸缓冲液冲洗细胞的次数为2~3次;步骤(1)中所述的每1L样品预处理液含有1mol盐酸、0.5molpH为8.0的Tris-盐酸和20ml曲拉通100。
6、根据权利要求1所述的快速检测方法,其特征在于步骤(7)、(8)、(9)中所述的环介导等温扩增引物混合物包括上游外引物、下游外引物、上游内引物、下游内引物。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于华南理工大学,未经华南理工大学许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/200910040402.3/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇:茶假山盆景
- 下一篇:流产布鲁氏菌疫苗株S19标记重组菌及其应用