[发明专利]竞争性交替结合猝灭探针环介导等温扩增快速检测方法无效

专利信息
申请号: 200910040402.3 申请日: 2009-06-19
公开(公告)号: CN101575642A 公开(公告)日: 2009-11-11
发明(设计)人: 石磊;常彦磊;姜晓冰;王秋艳;闫鹤;鲁曦 申请(专利权)人: 华南理工大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;G01N21/64;C12R1/19
代理公司: 广州粤高专利商标代理有限公司 代理人: 何淑珍
地址: 510640广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 竞争性 交替 结合 探针 环介导 等温 扩增 快速 检测 方法
【权利要求书】:

1、一种竞争性交替结合猝灭探针环介导等温扩增的快速检测方法,其特征在于,按如下步骤进行:

(1)将细胞悬浮于生理盐水中,离心,去掉上清,然后用磷酸缓冲液冲洗细胞,加入样品预处理液200~500μl,剧烈震荡混匀;

(2)将震荡混匀后的细胞溶液在100℃加热10~20分钟,冰浴10~20分钟,离心,取上清作为模板DNA;

(3)在PCR反应管中加入模板DNA,目标DNA序列的上游引物和下游引物,dNTPs,rTaq酶,10×PCR反应缓冲液,加双蒸水,进行反应,PCR产物即为目标DNA;

(4)竞争DNA序列上游序列的扩增,在PCR反应管中加入模板DNA,竞争DNA上游序列的上游引物和下游引物,dNTPs,rTaq酶,10×PCR反应缓冲液,加双蒸水,进行反应,PCR产物即为竞争DNA序列的上游序列;

(5)竞争DNA序列下游序列的扩展,在PCR反应管中加入模板DNA、竞争DNA序列下游序列的上游引物和下游引物,dNTPs,rTaq酶,10×PCR反应缓冲液,加双蒸水,进行反应,PCR产物即为竞争DNA序列的下游序列;

(6)竞争DNA的获得,分别回收纯化竞争DNA序列的上游序列和下游序列,混合后稀释,取5μl作为模板加入到PCR反应管中,然后依次加入上游序列的上游引物和下游序列的下游引物,dNTPs,Taq Plus扩增酶,10×PCR反应缓冲液,加双蒸水,进行反应,PCR产物即为竞争DNA,稀释后,通过分光光度计测定竞争DNA的浓度C;

(7)在PCR管加入交替结合淬灭探针,环介导等温扩增引物混合物,反应缓冲液,BstDNA聚合酶,竞争DNA,加水,65~70℃反应45~50分钟,测定反应前Fb和反应后的荧光强度Fe,计算FC,FC=Fe/Fb

(8)在PCR管加入交替结合淬灭探针,环介导等温扩增引物混合物,反应缓冲液,Bst DNA聚合酶,目标DNA,加水,65~70℃反应45~50分钟,测定反应前Fb和反应后的荧光强度Fe,计算FT,FT=Fe/Fb

(9)在PCR管加入交替结合淬灭探针,环介导等温扩增引物混合物,反应缓冲液,BstDNA聚合酶,浓度为X的模板DNA,加水,65~70℃反应45~50分钟,测定反应前Fb和反应后的荧光强度Fe

(10)根据以下公式计算模板DNA的浓度

Fe/Fb=FT[X/(X+C)]+FC[C/(X+C)]=[C(FC-FT)/(X+C)]+FT

2、根据权利要求1所述的快速检测方法,其特征在于所述的进行反应为95~100℃预变性10~15min;94~100℃变性30~35s,50~60℃退火30~35s,72~75℃延伸30~35s,进行30个循环;最后于72~75℃延伸5~10min。

3、根据权利要求1所述的快速检测方法,其特征在于,所述交替结合淬灭探针的3’末端由氟硼荧光染料进行标记,5’末端为磷酸化处理。

4、根据权利要求3所述的快速检测方法,其特征在于所述的荧光为氟硼荧光染料。

5、根据权利要求1所述的快速检测方法,其特征在于所述的Bst DNA聚合酶的浓度为8000U/ml,dNTPs浓度为10mmol/L,Taq Plus扩增酶浓度为5000U/ml,rTaq酶浓度为5000U/ml;所述的磷酸缓冲液冲洗细胞的次数为2~3次;步骤(1)中所述的每1L样品预处理液含有1mol盐酸、0.5molpH为8.0的Tris-盐酸和20ml曲拉通100。

6、根据权利要求1所述的快速检测方法,其特征在于步骤(7)、(8)、(9)中所述的环介导等温扩增引物混合物包括上游外引物、下游外引物、上游内引物、下游内引物。

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