[发明专利]抑制乙型肝炎病毒复制的CpG甲基化寡聚脱氧核苷酸无效

专利信息
申请号: 200910023333.5 申请日: 2009-07-15
公开(公告)号: CN101613699A 公开(公告)日: 2009-12-30
发明(设计)人: 郭晏海;颜真 申请(专利权)人: 中国人民解放军第四军医大学
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;A61P31/20;C12R1/93
代理公司: 西安新思维专利商标事务所有限公司 代理人: 李 罡
地址: 710032*** 国省代码: 陕西;61
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摘要:
搜索关键词: 抑制 乙型肝炎 病毒 复制 cpg 甲基化 脱氧 核苷酸
【说明书】:

技术领域

发明涉及2条可以提高HBV cccDNA甲基化程度并可抑制HBV cccDNA复制的CpG甲基化的寡聚脱氧核苷酸,具体而言,是一种可用于抑制细胞内乙型肝炎病毒复制的CpG甲基化的寡聚脱氧核苷酸。

技术背景

我国是乙型肝炎高发区,约有3000多万乙型肝炎患者,寻找有效抗HBV感染的新方法是亟待解决的重大问题。

乙型肝炎病毒(HBV)感染宿主细胞后,病毒松弛环状DNA(rcDNA)进入细胞核,在宿主酶的作用下,形成共价闭合环状DNA(cccDNA)。cccDNA在肝细胞核内与组蛋白等生物分子结合形成病毒微染色体,它是乙型肝炎病毒基因转录与复制的模板。因此,抑制HBV cccDNA的形成及其转录活性是治疗慢性乙型肝炎的关键,然而目前尚没有能进入细胞核干扰cccDNA的形成并抑制其转录的药物。

目前研究发现,HBV cccDNA序列中存在CpG岛,而且CpG甲基化可以抑制HBV cccDNA的转录与复制。在HBV cccDNA序列中共发现3个CpG岛(见图1),其中的CpG岛2(1178nt-1349nt)处于HBV基因转录调控元件“密集”区,与增强子I下游/X启动子重叠,我们以及国外的研究均证明CpG岛2甲基化可抑制增强子I/X启动子的活性,抑制X基因以及C、S等基因转录,从而抑制HBV cccDNA的基因转录与复制。因此,CpG岛2可以成为抗病毒治疗的靶点,通过特异甲基化该CpG岛,可以达到抑制病毒复制的目的,但是,目前还没有可以特异诱导HBV cccDNA CpG岛甲基化的方法。

研究证明DNA CpG岛甲基化是可遗传的,即随着双链DNA半保留复制,单链模板DNA的甲基化可以被复制到新合成的子代DNA上。这个过程主要是由DNA甲基转移酶1(DNA methyltransferases1,DNMT1)完成的。DNMT1的主要作用是维持基因组DNA的甲基化,它是哺乳动物中唯一对半甲基化的位点有强偏好性的DNA甲基转移酶,当它与半甲基化的双链DNA CpG位点结合后,可催化互补链上未甲基化的CpG的胞嘧啶甲基化。因此,在双链DNA中,如果一条链上的CpG的胞嘧啶发生甲基化,在DNMT1酶的作用下,互补链上的CpG胞嘧啶也会被甲基化。

发明内容

本发明的目的是提供一种可以提高HBV cccDNA互补序列的甲基化程度,抑制乙型肝炎病毒复制的CpG甲基化的寡聚脱氧核苷酸。

为解决上述的技术问题,本发明采取的技术方案:

抑制肝细胞内乙型肝炎病毒复制的CpG甲基化寡聚脱氧核苷酸,其特殊在于:以HBV cccDNA序列中CpG岛2为靶点,设计并合成序列长度在15个~30个碱基,可以抑制乙型肝炎病毒基因复制的CpG甲基化的寡聚脱氧核苷酸。

上述的抑制肝细胞内乙型肝炎病毒复制的CpG甲基化寡聚脱氧核苷酸,其特征在于:从HBV cccDNA序列中CpG岛2区域中选择含两个以上CpG的正链序列或接近HBV X基因起始码的含CpG的正链序列做为寡聚脱氧核苷酸序列,体外人工合成所选寡聚脱氧核苷酸链并使其中的CpG胞嘧啶甲基化,即制成CpG甲基化的寡聚脱氧核苷酸。

上述的抑制肝细胞内乙型肝炎病毒复制的CpG甲基化寡聚脱氧核苷酸,其特征在于:以HBV GenBank:U95551.1毒株的DNA CpG岛2序列作为靶点,从该区域正链序列中选择两段含CpG的正链序列,并人工合成CpG甲基化的寡聚脱氧核苷酸,其序列为:

MX1:5’catcagm5cgm5cgtgm5cgtggaa 3’        (1227-1245nt)

MX2:5’gtcctctccm5cgcaaatatacatm5cgt 3’    (1347-1371nt)

其中m5CG表示CpG二核苷酸中的胞嘧啶甲基化。MX1含3个甲基化CpG;MX2的3’端靠近HBV X基因起始码。

上述的抑制肝细胞内乙型肝炎病毒复制的CpG甲基化寡聚脱氧核苷酸,其特征在于:以HBV A基因型毒株的DNA CpG岛2序列作为靶点,从该区域正链序列中选择两段含CpG的正链序列,并人工合成CpG甲基化的寡聚脱氧核苷酸,其序列为:

MX1:5’catcagm5cgcatgm5cgtggaa3’              (1225-1243nt)

MX2:5’gtcctctm5cgm5cggaaatatacatm5cgt3’      (1345-1369nt)

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