[发明专利]与猪生长速度相关分子标记克隆及应用

说明书

技术领域

本发明属于猪的分子标记辅助选择技术领域，具体涉及一种作为猪标记辅助选择的与生长速度相关的分子标记的克隆及应用，该分子标记与COPB1基因有关，利用本发明克隆的分子标记对猪生长速度相关的性状进行关联分析。 

背景技术

20世纪80年代以来，分子标记研究取得飞速发展，形成了以分子标记为核心的分子标记辅助选择和渗入等分子育种技术，这些技术与常规育种方法相结合，大大提高了猪的育种效率。能够应用于分子标记辅助选择的基因或标记必须对目标性状具有较大的遗传贡献，即主效基因或标记，因此寻找这些主效基因和与之连锁的分子标记成为分子标记辅助选择的前提和基础，也是当前和今后一段时间猪分子生物学领域的研究重点和急需解决的问题。 

目前已有多个与生长性状和胴体性状紧密连锁的功能基因分子标记被发现并申请专利：1)Lin等检测到热应激蛋白70.2(hsp70.2)5’侧翼区域的多态能提高猪的生产性能，该基因已被申请专利(专利号为US，US2003104392-A1)；2)Rothschild等发现CAST基因的作用并在猪生长和肉质性状改良中进行标记辅助选择应用(专利号US，WO2003060151-A2)；3)Rothschild等检测了与肌肉生长和肉质性状相关的CKM，SCN4 alpha，LDH alpha三个基因的变异，为育种提供了分子标记(专利号US，WO2004081194-A2)；4)Rothschild等发现猪黑皮质素-4受体(MC4R)基因与生长速度、脂肪含量和饲料消耗相关(专利号US，WO200175161-A2)；5)Rothschild等还揭示了HMGA可用作动物生长、脂肪量、肉质和饲料消耗比的遗传标记(专利号CN，03806119.8)；6)Greger等发现CYP11a1基因与生长和繁殖性状相关(专利号US，WO200069882)；7)Hiendleder等建立了与生长、繁殖和胴体性状相关的INHA和INHBA基因多态的检测方法(专利号DE，DE10121225-A1)；8)Gerbens等发现H-FABP基因的多态与生产性能(体重、肌内脂肪)相关(专利号EP，WO9735878-A)；9)Kojima等发现pLEPR基因的多态能提高猪的遗传性状和肉的产量(专利号US，WO2005017204-A2)；10)李奎等公开了一种猪生产性状相关蛋白及其编码基因CA3及其应用(专利号CN，200610066856.4)；11)李奎等发现了PSMB8基因的变异与生长速度和免疫性状之间的相关(专利号CN，200410096857.4)。 

猪经济性状的遗传基础十分复杂，虽然国际上动物遗传育种领域的科学家和研究人员已经开展了大量的研究工作，但功能基因的鉴定及能用于育种实践的分子标记还十分有限；同时在国际上正在开展基因产权争夺战，一些重要基因已经被国外同行申请了专利，为了使我国宝贵的基因资源手得到保护，需要加快功能基因鉴定和分子标记的研究速度。本实验室处于上述的研究目的开展猪经济性状候选基因的分离、定位、SNP筛查与检测及与性状的关联分析工作。 

本专利中目的基因的研究进展COPB1(coatomer protein complex，subunit beta 1)基因编码外被体蛋白复合体亚基。目前已有小鼠和大鼠COPB1基因组织结构、表达和功能研究报道。人COPB1基因定位在11p15，编码953个氨基酸。小鼠COPB1基因位于7号染色体53.3cM，，cDNA全长为3173bp，编码953个氨基酸。人，小鼠，大鼠COPB1基因都编码953个氨基酸，且序列高度保守。COPB1基因在小鼠的心、肝、脾、肺、肾中都有表达。