本发明涉及一种单质粒系统的CRISPRi载体及其制备方法,dCas9载体的序列如SEQ ID NO.6所示,图谱如附图2所示,CRISPRi载体通过将含有sgRNA启动子和sgRNA scaffold的基因片段重组到经酶切的dCas9载体中获得。发明利用CRISPRi技术,将dCas9蛋白和sgRNA scaffold构建到一个质粒系统中,实现在一个质粒中同时表达sgRNA和dCas9蛋白。该系统仅需要一次构建、一次转化即可实现sgRNA和dCas9蛋白的表达,该法过程简单、高效、快捷,大大简化质粒构建流程,缩短实验周期,提高工作效率。