本发明公开了一种制备(2S,3R)‑2‑苯甲酰氨甲基‑3‑羟基丁酸甲酯的方法,该方法包括:制备含羰基还原酶基因的工程菌和含葡萄糖脱氢酶基因的工程菌;分别制备两种工程菌的静息细胞悬液;将两种静息细胞悬液混合后,再与底物外消旋2‑苯甲酰氨甲基‑3‑羰基丁酸甲酯、氢供体和辅因子混合,进行不对称还原反应,制得(2S,3R)‑2‑苯甲酰氨甲基‑3‑羟基丁酸甲酯;羰基还原酶基因的碱基序列如SEQ ID NO.1所示,该方法可催化底物外消旋2‑苯甲酰氨甲基‑3‑羰基丁酸甲酯反应生成(2S,3R)‑2‑苯甲酰氨甲基‑3‑羟基丁酸甲酯,提高了产物的转化率和纯度。