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[发明专利]一种受扰动代谢通路确定方法及系统-CN202010008409.3有效
发明人：董继扬;张璇;邓伶莉;许晶晶 -专利权人：厦门大学
申请日： 2020-01-06 - 公布日： 2023-03-14 - 主分类号： G16B40/10 文献下载
摘要：本发明涉及一种受扰动代谢通路确定方法及系统，包括：获取待测生物样本；采用高通量分析技术和谱数据处理方法对生物样本进行分析和处理，得健康和异常生物样本代谢物的浓度集合；计算健康生物样本代谢物集合中任意两种代谢物的健康生物样本浓度比值对数，得健康生物样本浓度比值对数集；同理得异常生物样本浓度比值对数集；根据上述浓度比值对数集确定偏离系数集；根据偏离系数集确定代谢物的扰动矩阵；获取通路隶属矩阵；根据代谢物的扰动矩阵和通路隶属矩阵确定代谢通路扰动矩阵；采用单边T检验对代谢通路扰动矩阵分析，确定受扰动代谢通路。通过本发明上述方法能准确获取显著受扰动的疾病代谢通路，降低生物样品的个体间差异对于通路识别的影响。
一种扰动代谢通路确定方法系统

[发明专利]一种风湿宁干预类风湿关节炎大鼠的代谢标志物和通路-CN202210787400.6在审
发明人：马艳苗;彭涛;陈富丽;刘明燃;宋博;王轩;郝慧琴;赵子苇;肖楷楠 -专利权人：山西中医药大学
申请日： 2022-07-04 - 公布日： 2022-10-18 - 主分类号： G01N30/02 文献下载
摘要：本发明公开了一种风湿宁干预类风湿关节炎大鼠的代谢标志物和通路，属于代谢组学技术领域。本发明通过采用UHPLC‑Q‑Exactive Orbitrap‑MS技术检测了风湿宁复方用药前后大鼠的血清中活性化合物的变化，筛选了其治疗类风湿关节炎的关键代谢通路，探讨了风湿宁发挥疗效的机制，筛选出D－半乳糖、胆酸、脱氧胆酸等21种差异代谢物，以及牛磺酸和次牛磺酸代谢通路、初级胆汁酸生物合成代谢通路、类固醇激素生物合成代谢通路、半乳糖代谢通路等9条代谢通路，对该疾病的病理生理学理解以及生物学意义的解释
一种风湿干预类风湿关节炎大鼠代谢标志通路

[发明专利]构建细胞代谢产物网络的新算法-CN201110458950.5无效
发明人：刘极龙 -专利权人：上海聚类生物科技有限公司
申请日： 2011-12-29 - 公布日： 2013-07-03 - 主分类号： G06F19/26 文献下载
摘要：构建细胞代谢产物网络的新算法，本发明根据已知的代谢通路，将其整合生成一个完整的代谢网络。可以全局上观察代谢物之间的关系，对于分析代谢通路之间的互作具有指导意义。本发明主要包括如下流程：步骤1：获得代谢组学实验数据；步骤2：根据筛选标准，选择差异表达的代谢物；步骤3：对代谢物进行代谢通路分析；步骤4：分离每个代谢通路中代谢物之间的关系；步骤5：构建代谢网络；步骤
构建细胞代谢产物网络算法

[发明专利]一种基于代谢物关联网络的受扰动通路分析方法-CN202111301560.7在审
发明人：董继扬;吴昕玥;邓伶莉 -专利权人：厦门大学
申请日： 2021-11-04 - 公布日： 2022-02-11 - 主分类号： G16B45/00 文献下载
摘要：一种基于代谢物关联网络的受扰动通路分析方法，属于分析技术领域。包括步骤：1)对生物样品中的代谢物组进行分析，数据预处理后得到代谢组学数据矩阵；2)构造代谢物‑代谢通路二部图；3)将代谢组学数据矩阵进行代谢物关联网络建模，得到实验组和对照组之间的差异网络；4)计算差异网络在二部图上的富集度；5)基于两组样本间的差异代谢物网络，结合通路数据库的信息，对通路按重要性进行排序，识别潜在扰动通路；6)对潜在扰动通路进行显著性检验，获得显著扰动的代谢通路。利用差异网络的相关理论分析生物机体不同生理状态之间的差异，所筛选出与实验组相关的受扰动代谢通路更为可靠，为理解生物机体背后的发生机制提供新的研究思路。
一种基于代谢物关联网络扰动通路分析方法

[发明专利]一种可以调控微藻生长和其它功能的生长调节剂及其鉴定方法和应用-CN201410115383.7在审
发明人：路延笃;徐健 -专利权人：中国科学院青岛生物能源与过程研究所
申请日： 2014-03-26 - 公布日： 2015-09-30 - 主分类号： C12N1/12 文献下载
摘要：本发明涉及生物代谢工程技术领域，具体的说是一种微藻生长调节剂的代谢和信号通路及其鉴定方法和应用。通过代谢物组学手段鉴定微藻激素，再通过功能基因组学手段阐释微藻激素的代谢通路、信号传递通路和调控网络；再通过转录组学手段鉴定在微藻抗逆和油脂合成过程中关键的激素代谢和信号传递相关的酶和蛋白；再通过代谢工程和化学工程手段调控激素代谢和信号通路本发明提供用于鉴定微藻激素及其代谢通路和信号通路的方法。利用该方法可以阐释与藻类生理密切相关的激素代谢的酶、信号蛋白和相关调控机理，并用于改良生物的农艺性状。
一种可以调控生长其它功能调节剂及其鉴定方法应用

[发明专利]甲羟戊酸代谢通路抑制剂和甲病毒在制备抗肿瘤药物的应用-CN201711483000.1有效
发明人：颜光美;梁剑开;朱文博;张海鹏;林园;蔡静;龚守芳 -专利权人：广州威溶特医药科技有限公司
申请日： 2017-12-29 - 公布日： 2022-07-29 - 主分类号： A61K45/06 文献下载
摘要：本发明属于生物医药领域，涉及甲羟戊酸代谢通路抑制剂和甲病毒在制备抗肿瘤药物的应用。本发明首次发现甲羟戊酸代谢通路抑制剂可以用于制备甲病毒抗肿瘤增效剂。本发明同时涉及一种包含甲羟戊酸代谢通路抑制剂以及甲病毒的药物组合物，包含甲羟戊酸代谢通路抑制剂及甲病毒的药品套装，以及甲羟戊酸代谢通路抑制剂与甲病毒在治疗肿瘤，特别是对所述甲病毒不敏感的肿瘤中的用途。
甲羟戊酸代谢通路抑制剂病毒制备肿瘤药物应用

[发明专利]一种特定代谢通路中代谢物的仪器检测方法-CN201911135981.X在审
发明人：张保琴;罗云;耿柠波;宋肖垚;张海军;陈吉平 -专利权人：中国科学院大连化学物理研究所
申请日： 2019-11-19 - 公布日： 2021-06-04 - 主分类号： G01N30/72 文献下载
摘要：本发明公开了一种特定代谢通路中代谢物的仪器检测方法。通过寻找KEGG特定代谢通路中的代谢产物，通过CAS号检索及METLIN数据库获得其相关参数，定性分析—超高效液相色谱‑四级杆串联飞行时间质谱(UPLC‑Q/TOF)结束后建立定量分析‑‑超高效液相色谱三重四级杆质谱(UPLC‑QQQ)方法，构建特定代谢通路的检测方法，进而建立全代谢网络的代谢组检测平台。与已报道的细胞小分子代谢产物的仪器分析方法相比较，该方法既能最大限度的覆盖各代谢通路的细胞代谢物，达到全景检测的目的，同时又能定性代谢物并对其进行定量分析，是有效的代谢组学检测方法。
一种特定代谢通路代谢物仪器检测方法

[发明专利]一种基于质谱代谢组学的通路分析建模方法-CN202110277077.3有效
发明人：邓伶莉;马磊;韩碧荣 -专利权人：东华理工大学
申请日： 2021-03-15 - 公布日： 2022-11-22 - 主分类号： G01N27/62 文献下载
摘要：本发明提供一种质谱代谢组学的代谢通路分析建模方法，包括如下步骤：S1：采集正常生物和患病生物的生物样本，对采集样本得到的质谱转化成mzML文件，对质谱文件进行中心化、去噪以及对齐处理，得到样本的代谢物的二维数据矩阵；S2：对样本的代谢物的二维数据矩阵以及样本类别矢量矩阵，做中心化和Unite Variance归一化处理；S3：获取代谢物‑通路映射关系，并通路权重系数进行优化；S4：进行通路排序，调整惩罚因子并确定通路被选频率，利用通路的被选频率对通路进行排序；本发明提供的方法，通过将代谢物分组为相互之间有重叠的通路，将偏最小二乘法和Group Lasso相结合建立回归模型，并引入通路权重系数和惩罚因子，实现基于“分组稀疏”
一种基于代谢通路分析建模方法

[发明专利]一种核桃青皮多酚提取物降脂的潜在标志物及代谢通路的获得方法-CN202111572448.7在审
发明人：赵声兰;王小双;陈丹;马雅鸽;张希;赵庆宇婧;林玉萍 -专利权人：云南中医药大学
申请日： 2021-12-21 - 公布日： 2022-05-03 - 主分类号： G01N30/02 文献下载
摘要：本发明公开了一种核桃青皮多酚提取物降脂的肝脏潜在代谢标志物及其代谢通路获得方法，所述标志物被核桃青皮多酚提取物显著影响的从肝脏代谢物中筛选到18种潜在标志物，肝脏代谢产物中获得代谢指纹图谱；通过MetPA分析两组差异代谢物的相关代谢通路，得到12条被核桃青皮多酚提取物干预后肝脏代谢通路。利用UPLC/Q‑TOF‑MS技术检测高脂饮食诱导的高脂血症大鼠肝脏代谢产物，获得核桃青皮多酚提取物降脂的相关肝脏潜在标志物，并通过该技术分析核桃青皮多酚提取物降脂的肝脏潜在标志物的含量变化，对潜在标志物进行代谢通路分析，得到核桃青皮多酚提取物降脂的代谢通路。
一种核桃青皮提取物潜在标志代谢通路获得方法

[发明专利]与健康老龄相关的关键通路及其外周血DNA甲基化位点标志物和应用-CN202010235853.9在审
发明人：孔庆鹏;王昊天;肖富辉 -专利权人：中国科学院昆明动物研究所
申请日： 2020-03-31 - 公布日： 2020-06-05 - 主分类号： C12Q1/6876 文献下载
摘要：本发明公开了一种与健康老龄相关的关键通路及其外周血DNA甲基化位点和应用。所述的与健康老龄相关的关键通路，包括：蛋白质合成与质量控制通路：核糖体通路，蛋白酶体通路；自噬通路：溶酶体通路；能量代谢通路：氧化磷酸化通路，三羧酸循环通路；NAD+代谢通路：烟酸和烟酰胺代谢通路。本发明可直接应用于判断普通老龄人当前状态下健康老龄相关通路的变化特征，从机制上评价健康老龄状态，其社会影响及潜在经济价值巨大。
健康老龄相关关键通路及其外周血 dna 甲基化标志应用

[发明专利]胡椒碱在制备调节免疫细胞AMPK免疫代谢通路药物中的应用-CN201610565937.2在审
发明人：何贤辉;欧阳东云;梁译丹;徐丽慧;李陈广;魏红霞;潘浩 -专利权人：暨南大学
申请日： 2016-07-15 - 公布日： 2017-01-04 - 主分类号： A61K31/4525 文献下载
摘要：本发明属于药物领域，公开了胡椒碱在制备调节免疫细胞AMPK免疫代谢通路药物中的应用。其中，调节免疫细胞AMPK免疫代谢通路药物以胡椒碱为活性成分。免疫细胞在细菌感染等炎症刺激下，细胞AMPK代谢信号通路发生改变，在ATP等第二信号刺激下，AMPK代谢信号平衡被打破，其活性急剧上调，而经胡椒碱处理的细胞，上述AMPK活性受到抑制，细胞因而免于焦亡性死亡胡椒碱具有明确的AMPK免疫代谢通路调节活性，对于修复细胞免疫代谢，防止其功能耗竭具有重要意义。
胡椒制备调节免疫细胞 ampk 代谢通路药物中的应用

[发明专利]一种生物标志物代谢通路及分析方法与应用-CN201910567765.6有效
发明人：高耀;秦雪梅;田俊生;令狐婷 -专利权人：山西大学
申请日： 2019-06-27 - 公布日： 2021-07-27 - 主分类号： G01N33/68 文献下载
摘要：本发明属于疾病代谢生物标志物功能分析方法技术领域，提供一种生物标志物代谢通路及分析方法。所述代谢生物标志物为：硬脂酸、植物鞘氨醇、甘氨酸、谷氨酰胺和磷脂；所述代谢生物标志物的作用靶点为与抑郁症疾病神经系统、免疫应答和内分泌有关的目标蛋白；所述代谢通路为PI3K‑Akt信号通路、mTOR信号通路、MAPK信号通路、erbB信号通路、神经营养素信号通路、Rap1信号通路和Ras信号通路。
一种生物标志代谢通路分析方法应用

[发明专利]基于代谢组学建立阿莫西林浓度对嗜酸乳杆菌影响的方法-CN202010306613.3有效
发明人：苏志恒;郭玥;刘西;黄慧敏;宋慧;郑华;梁永红;冯氏岁;蒙明薇 -专利权人：广西医科大学
申请日： 2020-04-17 - 公布日： 2023-02-07 - 主分类号： G01N30/88 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于代谢组学建立阿莫西林浓度对嗜酸乳杆菌影响的方法，包括：以不同浓度阿莫西林给药后的嗜酸乳杆菌胞内代谢物进行液质联用分析，得到代谢物的碎片信息；通过建立正交偏最小二乘法判别分析模型对代谢物的碎片信息进行筛选，得到潜在的生物标志物；其中，筛选条件为变量重要性投影值大于1、差异倍数绝对值大于1、p值小于0.05；对潜在的生物标志物进行代谢通路富集，得到不同浓度阿莫西林引起嗜酸乳杆菌代谢紊乱发生发展的相关重要代谢通路；将重要的代谢通路里的潜在生物标志物通过代谢通路连接起来，得到综合代谢网络。本发明建立阿莫西林通过影响嗜酸乳杆菌代谢而造成损伤的方法，得到在阿莫西林用于嗜酸乳杆菌时，嗜酸乳杆菌的代谢物以及代谢通路之间的联系，以便对阿莫西林诱导的嗜酸乳杆菌损伤的作用机理进一步的研究。
基于代谢建立阿莫西林浓度酸乳杆菌影响方法

[发明专利]一种基于代谢组学技术的有机污染物低剂量联合暴露毒性效应评估方法-CN201711275619.3在审
发明人：王菲迪;陈吉平;张海军;耿柠波;张保琴;任晓倩 -专利权人：中国科学院大连化学物理研究所
申请日： 2017-12-06 - 公布日： 2019-06-14 - 主分类号： C12Q1/02 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于代谢组学技术的有机污染物低剂量联合暴露毒性效应评估方法，首先通过两种有机污染物对HepG2细胞的单独暴露和联合暴露，基于拟靶向代谢组分析能得到无偏且精确的代谢物信息，多重比较分析和代谢通路富集分析能直观地揭示有机污染物对细胞代谢物和代谢通路的影响通过计算代谢影响水平指数能够定量描述联合暴露对整体代谢和专一代谢通路的联合暴露效应类型。利用生物学检测方法能进一步对代谢路径限速酶活性进行测定，确认代谢通路的变化方向以及混合物中主要风险驱动化合物。
有机污染物代谢通路暴露代谢组学技术毒性效应低剂量联合代谢物信息驱动化合物生物学检测细胞代谢物代谢路径代谢影响多重比较水平指数效应类型整体代谢混合物分析代谢组灵敏度限速酶评估靶向富集信息量直观检测

[发明专利]巩膜脂代谢通路干预调节剂或脂代谢调节药物作为抑制近视屈光变负和眼轴延长药物的应用-CN202010976517.X在审
发明人：周翔天;潘妙珍;瞿佳 -专利权人：温州医科大学
申请日： 2020-09-17 - 公布日： 2020-12-11 - 主分类号： A61K31/20 文献下载
摘要：巩膜脂代谢通路干预调节剂或脂代谢调节药物作为抑制近视屈光变负和眼轴延长药物的应用，通过近视眼小鼠RNA‑seq实验发现巩膜脂代谢通路明显下调，脂代谢通路中多个关键酶基因表达下调。近视眼巩膜电镜观察发现脂滴沉积，进一步说明近视眼巩膜中脂代谢异常，并通过ω‑3调节眼巩膜脂质代谢，可以有效地抑制近视屈光度变负和眼轴延长。
巩膜代谢通路干预调节剂调节药物作为抑制近视屈光变负延长应用

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