“上海聚类生物科技有限公司”申请（专利权）人搜索_中国专利权人_发明人_技术持有人_科研专家_钻瓜专利网

钻瓜专利网为您找到相关结果57个，建议您升级VIP下载更多相关专利

[发明专利]一种基于统计显著性能快速识别基因组转录因子结合位点的系统-CN201210157108.2无效
发明人：单杲 -专利权人： 上海聚类生物科技有限公司
申请日： 2012-05-21 - 公布日： 2013-12-04 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：DNA的转录因子结合位点的识别问题是一个传统的模型预测问题，这里，我们开发了一个基于统计显著性原理而进行DNA模体识的系统。一些实验结果显示，我们的预测程序在全基因组序列分析时是一个相当有效的预测工具。它的设计简洁、快速、精确是分析基因组转录因子结合位点的有力工具。
一种基于统计显著性能快速识别基因组转录因子结合系统

[发明专利]预测核酸与蛋白相互作用的新算法-CN201110458951.X无效
发明人：刘极龙 -专利权人： 上海聚类生物科技有限公司
申请日： 2011-12-29 - 公布日： 2013-07-03 - 主分类号： G06F19/18 文献下载
摘要：预测核酸与蛋白相互作用的新算法，本发明根据RNA与蛋白结合的结构特点，用于预测RNA的靶蛋白。可直接针对核糖核酸和蛋白进行锁定，以便于进一步的生物学实验验证。本发明主要包括如下流程：步骤1：提取所有蛋白结构数据；步骤2：筛选阳性和阴性训练集；步骤3：提取训练集数据的特征，包括：RNA的二级结构、蛋白的二级结构、氢键和范德华力；步骤4：建立支持向量机预测模型；步骤5：采用10倍交叉证实验证模型的可靠性；步骤6：筛选部分结果，利用RIP(RNA互作蛋白免疫共沉淀)方法进行实验验证。
预测核酸蛋白相互作用算法

[发明专利]构建细胞代谢产物网络的新算法-CN201110458950.5无效
发明人：刘极龙 -专利权人： 上海聚类生物科技有限公司
申请日： 2011-12-29 - 公布日： 2013-07-03 - 主分类号： G06F19/26 文献下载
摘要：构建细胞代谢产物网络的新算法，本发明根据已知的代谢通路，将其整合生成一个完整的代谢网络。可以全局上观察代谢物之间的关系，对于分析代谢通路之间的互作具有指导意义。本发明主要包括如下流程：步骤1：获得代谢组学实验数据；步骤2：根据筛选标准，选择差异表达的代谢物；步骤3：对代谢物进行代谢通路分析；步骤4：分离每个代谢通路中代谢物之间的关系；步骤5：构建代谢网络；步骤6：使用cytoscape软件生成最终的网络结果。
构建细胞代谢产物网络算法

[发明专利]小RNA has-miR-373抑制剂的筛选方法-CN201110435582.2无效
发明人：曾华宗 -专利权人： 上海聚类生物科技有限公司
申请日： 2011-12-22 - 公布日： 2013-06-26 - 主分类号： G06F19/12 文献下载
摘要：本发明提供一种has-miR-373抑制剂筛选的方法，属于生物技术领域，涉及药物设计方面。本发明主要包括如下流程：步骤1，has-miR-373前体序列三维结构模型的构建及优化；步骤2，小分子化合物的获得；步骤3，分子对接；步骤4，过滤非特异性结合化合物。
rna has mir 373 抑制剂筛选方法

[发明专利]基于高通量测序检测差异表达与可变剪切分析的方法-CN201110435605.X无效
发明人：曾华宗 -专利权人： 上海聚类生物科技有限公司
申请日： 2011-12-22 - 公布日： 2013-06-26 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明基于目前的Solexa测序技术，找到了一种新的可以定义差异表达和转录因子结合位点的分析方法，相对于其他分析方法大幅提高了分析精度。该方法同时适用于转录本高通量测序(RNA-seq)和染色体免疫共沉淀高通量测序(ChlP-seq)两种方法产生的数据进行分析。
基于通量检测差异表达可变剪切分析方法

[发明专利]一种利用高通量测序技术发现新转录本的方法-CN201110435592.6无效
发明人：曾华宗 -专利权人： 上海聚类生物科技有限公司
申请日： 2011-12-22 - 公布日： 2013-06-26 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明旨在提供一种检测基因组中尚末注释的新转录本的方法。该方法对同一样本分别采用mRNA-seq及rmRNA-seq技术获得转录组全基因组数据。比较基因组区域两种技术获得的表达谱结果，做统计分析找出有显著差异的区域。针对其中表达丰度比较高差异区域，设计RT-PCR验证其生物学功能。此发明可以很好的应用于高通量筛选基因组中新转录本。
一种利用通量技术发现转录方法

[发明专利]一种牛的miRNA靶基因预测分析方法-CN201110407322.4无效
发明人：曾华宗 -专利权人： 上海聚类生物科技有限公司
申请日： 2011-12-09 - 公布日： 2013-06-19 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明涉及一种牛miRNA靶基因预测分析方法，适用于牛miRNA靶基因的预测。本发明包括如下流程：步骤1、3’-UTR数据库的建立。步骤2、对于没有3’-UTR序列的物种，获得牛的mRNA序列。步骤3、获得牛的蛋白序列。步骤4、我们通过编写PERL脚本程序从mRNA序列中减除编码蛋白的序列(CDS)从而获得基因的5’-UTR和5’-UTR序列。其中的3’-UTR序列被收集起来，建立其3’-UTR序列数据库。步骤5、对于有公开的3’-UTR的物种，则直接下载相关的数据。步骤6、靶基因预测由多个软件分别进行预测，对于有些无法对应的microRNA，则参考了miRGator软件。我们一般取几种软件预测结果的交集，即overlap部分。步骤7、统计分析，将预测得到的靶基因进行统计，以确定最有可能的靶基因。
种牛 mirna 基因预测分析方法

[发明专利]一种SELDI分析技术在牛酮病诊断中的应用-CN201110407328.1无效
发明人：曾华宗 -专利权人： 上海聚类生物科技有限公司
申请日： 2011-12-09 - 公布日： 2013-06-19 - 主分类号： G01N27/64 文献下载
摘要：本发明涉及生物技术领域，是一种可用于诊断牛酮病的模型，为牛酮病的诊断提供了实验基础。本发明运用SELDI芯片系统，检测奶牛酮病组尿液和奶牛正常组尿液样品，得到原始数据，通过统计学的方法分析不同组之间的差异，找到了检测值显著不同的peak。并用cluster和PCA等方法反映这些差异peak在两组中的分布及相互关系。另外，利用决策树分析建立了分类模型，并达到了较好的预测准确率。可以更细致全面的认识和诊断牛酮病。
一种 seldi 分析技术牛酮病诊断中的应用

[发明专利]一种基因大肠杆菌表达谱芯片的基因网络构建方法-CN201110407359.7无效
发明人：曾华宗 -专利权人： 上海聚类生物科技有限公司
申请日： 2011-12-09 - 公布日： 2013-06-19 - 主分类号： G06F19/24 文献下载
摘要：本发明所述的方法的一大特点便是将大肠杆菌的表达谱基因芯片的数据进行统计学分析处理进行网络构建，用于研究基因之间的相互作用关系，该方法实施的基本流程为：步骤1、待检测样品进行大肠杆菌表达谱芯片检测获得原始数据。步骤2、对原始数据进行预处理及统计学分析并筛查差异表达的基因。步骤3、文档搜索及格式化。步骤4、将文档分离成单个句子，作为后续分析基本单位。步骤5、基因描述的定位。步骤6、统一基因描述中使用的基因符号。步骤7、建立基因互作动词词典。步骤8、生成需要研究基因的同义词字典，并从上述句子中提取出基因的描述。步骤9、统计分析基因名、基因互作动词和需要研究的基因同时出现的句子，整理成列表。步骤10、构建相互作用关系网络。
一种基因大肠杆菌表达芯片网络构建方法

[发明专利]一种预测信号通路组分特异结合的小RNA的方法-CN201110407305.0无效
发明人：曾华宗 -专利权人： 上海聚类生物科技有限公司
申请日： 2011-12-09 - 公布日： 2013-06-19 - 主分类号： G06F19/16 文献下载
摘要：本发明涉及反义药物设计方面，是一种预测信号通路特异的小RNA的方法，为制备反义药物提供重要的指导作用。本发明针对EGF及VEGF通路特异的分子，采用多种microRNA靶基因预测方法，寻找通路相关特异的microRNA；同时，编写计算机程序来模拟设计EGF及VEGF通路特异的长度在9-22nt的siRNA。结果找到两条通路共同特异的microRNA 12个，siRNA 1个。
一种预测信号通路组分特异结合 rna 方法

[发明专利]一种多因素结合法研究基因转录调控机制的模型-CN201110407346.X无效
发明人：曾华宗 -专利权人： 上海聚类生物科技有限公司
申请日： 2011-12-09 - 公布日： 2013-06-19 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明属于基因组学研究领域，是一种从全基因组水平研究表观遗传组及转录组之间关联关系的信息分析技术。把表观遗传方面的因素如核小体占位、DNA甲基化，与DNA序列特征等因素相结合，利用多种分析技术研究这些因素与基因转录水平间的关联关系。最后结果显示核小体占位及GC含量，组蛋白修饰及DNA甲基化等因素能够很好的区分不同表达水平的基因。该结果为进一步研究生物体内表达调控提供技术及理论依据。
一种因素结合研究基因转录调控机制模型

[发明专利]一种基于气相色谱-质谱技术进行血清代谢组学研究的方法-CN201110162895.5无效
发明人：曾华宗 -专利权人： 上海聚类生物科技有限公司
申请日： 2011-06-16 - 公布日： 2012-12-19 - 主分类号： G01N30/88 文献下载
摘要：一种适用于相色谱-质谱技术的血清代谢组学研究的方法，可以根据不同要求，采用气相色谱-质谱代谢组学平台对实验样本进行非目标性的代谢组学分析，并对产出的数据代谢组学数据分析。数据分析内容主要包括：(1)提取代谢组学原始数据；(2)通过多维统计分析可视化地显示不同组之间的代谢谱差异；(3)不同组分之间的代谢谱差异及造成差异的特征性代谢物；(4)不同组分之间的代谢谱差异及造成差异的特征性代谢物。
一种基于色谱技术进行血清代谢研究方法

[发明专利]长的非编码RNA靶基因预测的方法-CN201110162894.0无效
发明人：曾华宗 -专利权人： 上海聚类生物科技有限公司
申请日： 2011-06-16 - 公布日： 2012-12-19 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：一种适用于长的非编码RNA(lncRNA)靶基因预测的方法。可以快速准确的对lncRNA调控的基因进行准确预测。本发明主要包括的内容是：1、LncRNA的基因组定位方法。2、LncRNA两种作用方式：Cis作用方式和trans作用方式的靶基因预测。
编码 rna 基因预测方法

[发明专利]一种RT-PCR检测基因的分析方法-CN201110135637.8无效
发明人：曾华宗 -专利权人： 上海聚类生物科技有限公司
申请日： 2011-05-24 - 公布日： 2012-11-28 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明通过对RT-PCR检测基因进行数据预处理、层次聚类分析、差异基因筛选等生物信息学分析，形成一套用于RT-PCR检测基因的分析方法，其基本流程如下：步骤一：基因检测及原始数据的获取；步骤二：层次聚类分析；步骤三：对原始数据的预处理和均一化；步骤四：差异表达基因的筛选；步骤五：差异表达基因的pathway通路分析。
一种 rt pcr 检测基因分析方法

[发明专利]一种LTQ Orbitrap组合式质谱仪检测数据分析的方法-CN201110135640.X无效
发明人：曾华宗 -专利权人： 上海聚类生物科技有限公司
申请日： 2011-05-24 - 公布日： 2012-11-28 - 主分类号： G01N30/86 文献下载
摘要：本发明对所研究的样品采用shot-gun法lable-free方式做差异蛋白筛选，所用仪器为LTQ Orbitrap组合式质谱仪。目的是能筛选到在样本间差异表达的蛋白，验证后选取相关蛋白做生物学功能研究，应用于疾病鉴别及诊断。其基本流程如下：步骤一：不同样品间差异蛋白的筛选；步骤二：差异蛋白的层次聚类分析；步骤三：Gene ontology分析；步骤四：KEGG pathway分析；步骤五：蛋白的network分析。
一种 ltq orbitrap 组合式质谱仪检测数据分析方法

1
2
3
4
下一页»
尾页
共 57 条