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[发明专利]一种重组生物体及生产多种类环孢素氨基酸的方法-CN202211236882.2在审
发明人：王博祥;余俊 -专利权人：深圳市灵蛛科技有限公司
申请日： 2022-10-10 - 公布日： 2023-03-28 - 主分类号： C12N15/81 文献下载
摘要：一种重组生物体及生产多种类环孢素氨基酸的方法，该方法包括生物体构建步骤，包括提供敲除内源基因后的生物体，将木糖代谢基因整合至所述生物体的基因组中，获得可使用木糖生产S7P的生物体；DDGS‑OMT的构建步骤，包括将DDGS基因、OMT基因中的至少一种整合至生物体构建步骤所得的生物体的基因组中，获得可使用木糖生产4DG的生物体。本发明通过敲除内源性基因，显著提高类环孢素氨基酸的产量。
一种重组生物体生产多种类环孢素氨基酸方法

[发明专利]用于同时诠释微生物群落的分类分布和复制速率的方法和系统-CN202180090896.5在审
发明人：阿尼尔班·杜塔;尼肖·库马尔·平娜;舒普洛吉特·巴尔;唐戈蒂·博塞;沙尔米拉•谢卡尔•曼德 -专利权人：塔塔顾问服务有限公司
申请日： 2021-12-09 - 公布日： 2023-09-19 - 主分类号： G16B5/20 文献下载
摘要：本公开一般涉及微生物生物体(例如细菌)的分类学分析领域，更特别地，涉及用于同时诠释构成微生物群落的微生物的分类分布和复制速率的系统和方法。本公开从包含在收集的微生物组样本中的多种细菌生物体中提取细菌基因组DNA。将多个DNA序列片段读段比对到多个所有可用的完全测序的细菌基因组的预先计算的参考序列数据库。根据比对，在系统发育标记基因的基因组位置处测量读段覆盖度，其中，测量到的读段覆盖度用于诠释多种细菌生物体的分类分布。通过拟合线性函数获得多个斜率。本公开诠释了从收集的微生物组样本中识别出的多种细菌生物体中每一种的复制速率。
用于同时诠释微生物群落分类分布复制速率方法系统

[发明专利]发现表达连接基因-CN200980117636.1无效
发明人：安妮·道韦·德布尔;米夏埃尔·约翰内斯·马库斯·埃伯斯坎普;西蒙·阿尔贝图斯·朗格弗尔德;伊沃·拉罗斯;米兰达·德博拉·范德尔赫 -专利权人：表现研究有限公司
申请日： 2009-03-17 - 公布日： 2011-04-20 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明涉及用于分析生物体的基因组区的方法，该方法包括四个主要部分。第一部分涉及从所选生物体分离mRNA，所选生物体用于制备小的单链DNA片段，其具有包含亲和标记的衔接子。这些DNA片段用于第三部分。在第二部分中，从相同或相关生物体分离基因组DNA。该基因组DNA被片段化并连接于衔接子分子。在第三部分中，使这些基因组片段与来自第一部分的单链DNA片段杂交，并且在此过程中形成的杂交体用于DNA片段的合成。这些片段将用于第四部分，该部分涉及利用一种可用的高通量测序方法来对这些片段进行测序。
发现表达连接基因

[发明专利]用于基因组组装、单元型定相以及独立于靶标的核酸检测的方法-CN201680074565.1有效
发明人：理查德·E·格林;保罗·哈特利;克里斯多佛·特罗尔;闵艾艾 -专利权人：多弗泰尔基因组学有限责任公司
申请日： 2016-10-18 - 公布日： 2022-04-08 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本公开内容提供了用于组装真核或原核生物体的基因组的方法。本公开内容提供了用于单元型定相和宏基因组组装的方法。本公开内容还提供了用于从头生成异质宏基因组样品或从多个个体获得的样品中未知生物体的支架信息、连接信息和基因组信息的方法和组合物。所述方法的实施可允许对异质样品中的未培养或未鉴定的生物体的整个基因组进行从头测序，或确定从多个个体获得的包含核酸的样品中的核酸分子的连接信息。
用于基因组组装单元型定相以及立于靶标核酸检测方法

[发明专利]通过应用参考基因组的分层结构使诧异数据最小的方法和系统-CN201380026006.X有效
发明人： J.克雷默;R.弗里德兰德 -专利权人：国际商业机器公司
申请日： 2013-05-15 - 公布日： 2017-04-26 - 主分类号： G06F19/22 文献下载
摘要：一种使诧异数据最小的方法、计算机程序产品、和计算机系统包含在源头上，计算机读取和识别生物体的基因序列的特性；接收生物体的基因序列的至少两种所识别特性的等级的输入；根据生物体的基因序列的至少两种所识别特性的等级生成分级的所识别特性的分层结构；将分级的所识别特性的分层结构与参考基因组的中心库相比较；以及如果来自中心库的至少一个参考基因组与分级的所识别特性的分层结构匹配，则将生物体的基因序列的核苷酸与来自至少一个匹配参考基因组的核苷酸相比较，
通过应用参考基因组分层结构诧异数据最小

[发明专利]在生物体内创制新基因的方法及应用-CN202011190279.6在审
发明人：姜临建;王继尧;莫苏东;陈波;李华荣 -专利权人：青岛清原化合物有限公司
申请日： 2020-10-30 - 公布日： 2021-05-11 - 主分类号： C12N15/29 文献下载
摘要：本发明涉及基因工程和生物信息学技术领域，具体而言，涉及一种在无人工DNA模板的前提下，在生物体内创制新基因的方法及应用。所述方法是通过在生物体基因组中至少两个不同的特定位置上同时产生DNA断裂，其中所述特定位置是能够分割不同基因元件或不同蛋白结构域的基因组位点，所述DNA断裂通过非同源末端连接(NHEJ)或同源修复的方式互相连接，产生所述不同基因元件或不同蛋白结构域之间不同于原始基因组序列的新组合，形成新基因。本发明新基因能够改变生物体的生长、发育、抗性、产量等性状，具有重大应用价值。
生物体内创制基因方法应用

[发明专利]在生物体内创制新基因的方法及应用-CN202210465105.9在审
发明人：不公告发明人 -专利权人：青岛清原化合物有限公司
申请日： 2022-04-29 - 公布日： 2022-11-18 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明涉及基因工程和生物信息学技术领域，具体而言，涉及一种在无人工DNA模板的前提下，在生物体内创制新基因的方法及应用。所述方法是通过在生物体基因组中至少两个不同的特定位置上同时产生DNA断裂，其中所述特定位置是能够分割不同基因元件或不同蛋白结构域的基因组位点，所述DNA断裂通过非同源末端连接(NHEJ)或同源修复的方式互相连接，产生所述不同基因元件或不同蛋白结构域之间不同于原始基因组序列的新组合，形成新基因。本发明新基因能够改变生物体的生长、发育、抗性、产量等性状，具有重大应用价值。
生物体内创制基因方法应用

[发明专利]使用向导RNA/CAS内切核酸酶系统的植物基因组修饰及其使用方法-CN201480058177.5在审
发明人： A.西甘;S.C.法科;H.高;Z.李;Z-B.刘;L.A.赖兹尼克;J.史;S.斯韦塔舍夫;J.K.杨 -专利权人：纳幕尔杜邦公司;先锋国际良种公司
申请日： 2014-08-20 - 公布日： 2016-08-31 - 主分类号： C12N15/82 文献下载
摘要：本发明提供了用于对植物或植物细胞的基因组中的靶序列进行基因组修饰的组合物和方法。所述方法和组合物采用向导RNA/Cas内切核酸酶系统来提供有效系统，用于修饰或改变植物、植物细胞或种子的基因组内的靶位点。本发明还提供了采用向导多核苷酸/Cas内切核酸酶系统的组合物和方法，用于对细胞或生物体的基因组中的核苷酸序列进行基因组修饰、用于编辑基因，和/或用于将目的多核苷酸插入到细胞或生物体的所述基因组中，或使目的多核苷酸从细胞或生物体的所述基因组缺失一旦鉴定基因组靶位点，便可采用多种方法进一步修饰所述靶位点，使得所述靶位点包含多种目的多核苷酸。本发明还公开了育种方法和用于利用向导RNA和Cas内切核酸酶这两种成分来选择植物的方法。还提供了用于编辑细胞的基因组中的核苷酸序列的组合物和方法。
使用向导 rna cas 核酸酶系统植物基因组修饰及其使用方法

[发明专利]离子激流基因组测序-CN201810225084.7在审
发明人： L.T.道姆;G.W.费希尔 -专利权人：长角牛疫苗和诊断有限责任公司
申请日： 2013-05-09 - 公布日： 2018-08-07 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明涉及离子激流基因组测序。公开了用于通过半导体测序，优选离子激流测序快速且成本节约地分析微生物序列的增强方法。这种方法提供了多个基因组的全长分析和多个区域(例如基因)分析。这些方法鉴定负责对抗生素或其它化学化合物赋予抗性或敏感性的特定基因的遗传突变。将特定生物体的多种不同种、株系和/或血清型连同生物体的完整基因组快速且有效筛选并鉴定突变。通过选择产生具有跨越整个基因组的序列的扩增子的相似大小和GC含量的引物对，通过离子激流方法分析的单一PCR反应可以测定完整基因组的序列。方法可用于测序病毒因子(诸如流感病毒)和细菌因子(诸如结核病细菌)的基因组。
离子基因组测序基因组测序完整基因组生物体流感病毒分析微生物化学化合物病毒因子成本节约方法分析方法鉴定细菌因子遗传突变有效筛选基因结核病扩增子血清型抗性可用引物株系优选抗生素半导体突变细菌分析赋予

[发明专利]大突变分析(BMA)-CN200980150525.0无效
发明人： J·斯图尔曼 -专利权人：凯津公司
申请日： 2009-11-17 - 公布日： 2011-11-16 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明涉及鉴别，和任选分离在生物体中表达的并与所述生物体特定表型(特征的性状)相关的核酸序列的新策略。与本领域已知的方法相反，本发明的方法可以有效地鉴别，分离或克隆生物体例如(作物)植物的基因，这些植物没有或只有有限的基因组相关信息。
突变分析 bma

[发明专利]使用探针、探针分子以及包含探针的阵列组合检测基因组序列用于对生物体特异性检测-CN202080059564.6在审
发明人： H·克拉普罗特;S·贝德纳 -专利权人：保障生物系统控股有限公司
申请日： 2020-07-17 - 公布日： 2022-04-01 - 主分类号： C12Q1/6813 文献下载
摘要：利用与来自不同生物体的基因组序列不同地结合的探针组合来鉴定可能存在于样品中的同源基因组序列的方法、用于区分同源基因组序列的阵列、用于区分同源基因组序列的系统以及可用于方法、阵列和系统中的细菌结合探针分子
使用探针分子以及包含阵列组合检测基因组序列用于生物体特异性

[发明专利]下一代基因组测序方法-CN201480071698.4在审
发明人： L.T.道姆;G.W.费希尔 -专利权人：长角牛疫苗和诊断有限责任公司
申请日： 2014-10-29 - 公布日： 2016-11-30 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明公开了增强的用于通过半导体测序，优选地离子激流测序快速和成本有效地分析微生物序列的方法。所述方法提供多个基因组的多个区域(例如基因)的全长分析。这些方法鉴定导致赋予对抗生素或其它化合物的抗性或敏感性的特定基因的基因突变。特定生物体的多个不同种类、菌株和/或血清型被快速和有效地筛查并且突变随同生物体的完整基因组一起被鉴定。通过选择产生具有跨越整个基因组的序列的扩增子的相似大小和GC含量的引物对，通过离子激流方法学分析的单个PCR反应可测定完整基因组的序列。所述方法可用于测序病毒物质例如流感病毒和细菌物质例如结核病细菌的基因组。
下一代基因组方法

[发明专利]离子激流基因组测序-CN201380024174.5在审
发明人： L.T.道姆;G.W.费希尔 -专利权人：长角牛疫苗和诊断有限责任公司
申请日： 2013-05-09 - 公布日： 2015-04-08 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：公开了用于通过半导体测序，优选离子激流测序快速且成本节约地分析微生物序列的增强方法。这种方法提供了多个基因组的全长分析和多个区域(例如基因)分析。这些方法鉴定负责对抗生素或其它化学化合物赋予抗性或敏感性的特定基因的遗传突变。将特定生物体的多种不同种、株系和/或血清型连同生物体的完整基因组快速且有效筛选并鉴定突变。通过选择产生具有跨越整个基因组的序列的扩增子的相似大小和GC含量的引物对，通过离子激流方法分析的单一PCR反应可以测定完整基因组的序列。方法可用于测序病毒因子(诸如流感病毒)和细菌因子(诸如结核病细菌)的基因组。
离子激流基因组

[发明专利]用于基因编辑的组合物和方法-CN201980039136.4有效
发明人： J·陈;L·吉尔伯特;J·努涅斯;J·韦斯曼 -专利权人：加利福尼亚大学董事会
申请日： 2019-04-19 - 公布日： 2023-10-17 - 主分类号： C12N9/22 文献下载
摘要：本文尤其提供用于操纵活生物体的基因组的组合物和方法。
用于基因编辑组合方法

[发明专利]改进的大突变分析-CN201080056670.5无效
发明人： J·斯图尔曼;F·亚尔钦 -专利权人：凯津公司
申请日： 2010-12-17 - 公布日： 2012-11-21 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明涉及鉴别和任选分离在生物体中表达的并与所述生物体特定表型（特征的性状）因果上相关的核酸序列的新策略。与本领域已知的方法相反，本发明的方法有可能高效地富集、鉴别、分离和/或克隆生物体例如（作物）植物的基因，这些植物没有或只有有限的基因组相关的信息是可获得的。
改进突变分析

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