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[发明专利]鸡β-防御素9酵母工程菌制备及其表达方法-CN201310488740.X无效
发明人：祁克宗;涂健;张永正;彭开松;周秀红;汪雪雁;刘红梅;张明;陈玎玎;付瑞燕;薛秀恒 -专利权人：安徽农业大学
申请日： 2013-10-18 - 公布日： 2014-03-05 - 主分类号： C12N15/12 文献下载
摘要：本发明公开了鸡β-防御素9酵母工程菌制备及表达方法，属于生物技术及基因工程制药技术领域。首先利用毕赤酵母惯用密码子优化鸡β-防御素9基因，在其前端添加Kex2酶切位点编码序列并人工合成该基因，然后将合成的β-防御素9基因序列插入酵母组成型表达载体，通过同源重组整合到甲基营养型毕赤酵母染色体中，经多次筛选得到生产鸡β-防御素9的酵母工程菌。
防御酵母工程制备及其表达方法

[发明专利]优化的谷氨酰胺转氨酶基因、信号肽及发酵方法-CN201810039484.9在审
发明人：李阳源;王建荣;陈稳;陈丽芝;刘金山;唐业;瞿曼;王勇;王平 -专利权人：广东溢多利生物科技股份有限公司
申请日： 2018-01-16 - 公布日： 2019-07-23 - 主分类号： C12N9/10 文献下载
摘要：本发明通过密码子优化技术优化了来源于吸水链霉菌(Streptomyce hygroscopicus)的谷氨酰胺转氨酶基因tg，将优化后的基因tg转化至毕赤酵母获得产TG酶的重组菌，接着，通过筛选比较了不同信号肽对重组菌胞外分泌
信号肽谷氨酰胺转氨酶基因发酵核苷酸序列重组菌优化基因工程领域产业化应用密码子优化吸水链霉菌重组工程菌胞外分泌毕赤酵母高效表达技术优化基因筛选转化

[发明专利]壳聚糖酶基因、壳聚糖酶及其制备方法和应用-CN202010621314.9在审
发明人：王建荣;祝木金;余思;王平;孟建军;刘小慧;曹革 -专利权人：深圳润康生态环境股份有限公司
申请日： 2020-07-01 - 公布日： 2020-11-06 - 主分类号： C12N15/56 文献下载
摘要：本发明壳聚糖酶基因csn的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，其是通过对来源于多枝横梗霉的壳聚糖酶的序列根据毕赤酵母密码子的偏好性进行综合优化得到。
聚糖基因及其制备方法应用

[发明专利]一种优化的葡萄糖氧化酶基因及其应用方法-CN202310529833.6在审
发明人：谢清华;刘兴佳;邵丹;胡晓飞 -专利权人：山东华宜生物科技有限公司
申请日： 2023-05-11 - 公布日： 2023-06-30 - 主分类号： C12N15/53 文献下载
摘要：本申请提供的优化的葡萄糖氧化酶基因提高了对应密码子对毕赤酵母的偏好性，结合本申请提供的上述优化的葡萄糖氧化酶基因的应用方法，提高了葡萄糖氧化酶的表达量，从而能够实现葡萄糖氧化酶的异源高效表达，简化纯化过程
一种优化葡萄糖氧化酶基因及其应用方法

[发明专利]一种去糖基化的纤维二糖脱氢酶、乳糖生物传感器及其应用-CN202211482286.2在审
发明人：公维丽;马耀宏;张振宇;朱思荣;王丙莲;杨艳;孟庆军;刘庆艾 -专利权人：山东省科学院生物研究所
申请日： 2022-11-24 - 公布日： 2023-03-07 - 主分类号： C12N9/04 文献下载
摘要：本发明通过对来源于粗糙脉孢菌(Neurospora crass)的纤维二糖脱氢酶进行密码子优化，从而使其在毕赤酵母中顺利表达，并成功获得纯化蛋白，并经内切糖苷酶Hf和甘露糖苷酶处理后，成功获得去糖基化的纤维二糖脱氢酶
一种去糖基化纤维脱氢酶乳糖生物传感器及其应用

[发明专利]适合于酵母表达的抗菌肽Hepcidin优化基因及其表达载体和应用-CN202010826299.1有效
发明人：姚波;胡媛媛;陈欣;乔子琪;尹华雯 -专利权人：重庆科技学院
申请日： 2020-08-17 - 公布日： 2022-04-01 - 主分类号： C12N15/12 文献下载
摘要：本发明公开了适合于酵母表达的抗菌肽Hepcidin优化基因及其表达载体和应用，通过密码子优化对抗菌肽进行定向改造，提高基因表达的速率和丰度及密码子偏爱性，促进蛋白表达，对鱼类抗新出现的感染性疾病的防御具有重要意义
适合于酵母表达抗菌 hepcidin 优化基因及其载体应用

[发明专利]芸香科多物种密码子使用模式分析方法和系统-CN201910580198.8有效
发明人：万晓华;申泽南;张法;张金智;甘志猛 -专利权人：中国科学院计算技术研究所
申请日： 2019-06-28 - 公布日： 2021-10-08 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明涉及一种芸香科多物种的密码子使用模式分析方法，包括：通过芸香科的多个物种的基因数据，获取每个该物种的密码子序列；提取该密码子序列的第一特征值，以该第一特征值的关系验证该多个物种的进化关系；提取该密码子序列的第二特征值，以该第二特征值绘制特征关系图，以验证该多个物种的进化保守性程度；提取该密码子序列中的高频密码子/密码子对，以该高频密码子/密码子对的关系验证该多个物种的进化保守性相关度；将该密码子序列的密码子RSCU值与植物物种的密码子RSCU值进行聚类，以聚类结果验证该多个物种的所属纲目；获取该密码子序列GC3含量之间的欧式距离，以验证该多个物种的亲缘关系。
芸香物种密码子使用模式分析方法系统

[发明专利]重组新型冠状病毒COVID-19 S蛋白、其制备方法及应用-CN202010594498.4在审
发明人：刘海昌;方凯萍;朱复培;杨乾敏;时乐;刘动 -专利权人：宁波毓昌生物技术有限公司
申请日： 2020-06-24 - 公布日： 2020-09-29 - 主分类号： C12N15/81 文献下载
摘要：该制备方法包括：将经过密码子优化的编码COVID‑19S蛋白的核苷酸序列构建入酵母细胞诱导表达载体中，然后转入酵母细胞进行培养后诱导表达，并进行纯化，从而获得重组COVID‑19S蛋白。另外采用以甲醇毕赤酵母为代表酵母蛋白表达，具有表达量高，可诱导，糖基化机制接近高等真核生物，分泌蛋白易纯化，易实现高密发酵等优点，可应用于大规模工业化发酵生产。
重组新型冠状病毒 covid 19 蛋白制备方法应用

[发明专利]一种基于密码子对使用频度的基因密码子优化方法-CN201610838127.X有效
发明人：李阳 -专利权人：武汉伯远生物科技有限公司
申请日： 2016-09-21 - 公布日： 2019-04-05 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明提出了一种基于密码子对使用频度的基因密码子优化方法，本方案采用密码子对使用频度对目的基因进行优化，不光考虑单个密码子使用频度，同时考虑两个密码子联合使用情况，即：相邻密码子的关系，挑选物种中两个tRNA连用时频度较高的密码子对对目标基因进行优化起到关键作用。
一种基于密码子使用频度基因优化方法

[发明专利]一种密码子序列优化方法、装置、计算机设备及存储介质-CN202211384807.0有效
发明人：胡勇;王瀚宇;严志祥 -专利权人：深圳市瑞吉生物科技有限公司;武汉瑞佶生物科技有限公司
申请日： 2022-11-07 - 公布日： 2023-01-20 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本说明书涉及生物工程技术领域，尤其涉及一种密码子序列优化方法、装置、计算机设备及存储介质。其中密码子序列优化方法包括针对待优化蛋白序列，根据氨基酸与密码子映射表，随机生成多个待优化密码子序列，待优化蛋白序列包括多个氨基酸，待优化密码子序列包括多个密码子；以及利用蒙特卡洛树搜索算法针对多个待优化密码子序列进行处理，确定第一预目标密码子序列。利用本说明书实施例，采用蒙特卡洛树搜索算法，针对待优化蛋白序列生成的多个待优化密码子序列进行处理，得到第一预目标密码子序列，规避了采用遗传算法陷入局部最优的问题。
一种密码子序列优化方法装置计算机设备存储介质

[发明专利]使用ACE-tRNA经由遗传重分配拯救终止密码子的方法-CN201880085141.4在审
发明人： C.阿赫恩;J.D.吕克 -专利权人：衣阿华大学研究基金会
申请日： 2018-11-02 - 公布日： 2020-09-25 - 主分类号： A61K31/7105 文献下载
摘要：在某些实施方案中，本发明提供了修饰的转移RNA（tRNA）及其使用方法，所述修饰的转移RNA包含T臂、D臂、反密码子臂和受体臂，其中所述T臂包含与延伸因子1α蛋白质相互作用的核苷酸。在某些实施方案中，本发明提供了修饰的转移RNA（tRNA），其包含T臂、D臂、反密码子臂和受体臂，（a）其中所述反密码子臂包含三核苷酸反密码子，其中所述反密码子是5'‑UCA‑3'并且识别TGA终止密码子，并且其中所述受体臂与精氨酸、色氨酸或甘氨酸可操作地连接；（b）其中所述反密码子臂包含三核苷酸反密码子，其中所述反密码子是5'‑UUA‑3'并且识别TAA终止密码子，并且其中所述受体臂与谷氨酰胺或谷氨酸可操作地连接；或（c）其中所述反密码子臂包含三核苷酸反密码子，其中所述反密码子是5'‑CUA‑3'并且识别TAG终止密码子，并且其中所述受体臂与色氨酸、谷氨酸或谷氨酰胺可操作地连接。
使用 ace trna 经由遗传分配拯救终止密码子方法

[发明专利]一种酶活性提高的葡萄糖氧化酶突变体GOD-M01及其表达载体和应用-CN201610525903.0在审
发明人：肖志壮;张稳 -专利权人：青岛红樱桃生物技术有限公司
申请日： 2016-07-06 - 公布日： 2016-10-12 - 主分类号： C12N9/04 文献下载
摘要：本发明以根据巴斯德毕赤酵母（Pichia pastoris）的密码子偏好性进行过优化的葡萄糖氧化酶为基础，使用易错PCR 方法对该酶基因进行突变，再通过高通量筛选方法挑选出正突变，获得了酶活提高的葡萄糖氧化酶突变体
一种活性提高葡萄糖氧化酶突变体 god m01 及其表达载体应用

[发明专利]纯化制备抗新型冠状病毒感染的疫苗原液的方法-CN202310406227.5在审
发明人：王海生;杨文魁;叶春辉;郭海凤;张浩;赵佳;马嬴;沈佳恬 -专利权人：长春卓谊生物股份有限公司
申请日： 2023-04-17 - 公布日： 2023-08-11 - 主分类号： C12N15/81 文献下载
摘要：本发明涉及疫苗原液制备技术领域，特别涉及纯化制备抗新型冠状病毒感染的疫苗原液的方法，步骤如下：利用载体pPIC9K将密码子优化后的新型冠状病毒Spike蛋白RBD基因整合到毕赤酵母重组菌株中，通过发酵培养获得新型冠状病毒重组亚单位疫苗发酵液
纯化制备新型冠状病毒感染疫苗原液方法

[发明专利]提高比活和热稳定性的葡萄糖氧化酶突变体及其编码基因和应用-CN201810298434.2有效
发明人：李阳源;聂金梅;黄江;王勇;王平 -专利权人：广东溢多利生物科技股份有限公司
申请日： 2018-03-30 - 公布日： 2021-04-20 - 主分类号： C12N9/04 文献下载
摘要：针对毕赤酵母密码子偏好性对黑曲霉Aspergillus niger GIM 3.452(CICC 2377)的葡萄糖氧化酶(GOD)进行基因优化；采用定点突变技术将优化后的基因进行定点突变，所述突变位点包括
提高热稳定性葡萄糖氧化酶突变体及其编码基因应用

[发明专利]信息处理程序、信息处理方法以及信息处理装置-CN202080102744.8在审
发明人：片冈正弘;松村量;茂栉薰 -专利权人：富士通株式会社
申请日： 2020-07-08 - 公布日： 2023-04-18 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：信息处理装置基于将密码子和代码建立对应的密码子变换表，生成将多个断开基因组数据分别以密码子为单位进行编码的多个断开密码子数据。信息处理装置基于将成为基准的基准基因组数据以密码子为单位进行编码的基准密码子数据、和多个断开密码子数据的每一个断开密码子数据，确定出现在多个断开密码子数据中的代码中的与出现在基准密码子数据中的代码不同的基因变异出现的位置和种类
信息处理程序方法以及装置