本发明公开了一种基于人类Y‑STR基因座的复合扩增体系及其应用。该复合扩增体系包括34个引物,34个引物的核苷酸序列依次如SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:34所示。采用该复合扩增体系可一次扩增17个Y‑STR基因座,共22个基因座拷贝,扩增效率高;可对现有Y‑STR检验试剂盒形成有效补充,进一步提升Y‑STR的系统检验效能,满足男性家系精细化排查的要求。同时采用该复合扩增检测体系扩增获得的PCR扩增产物片段小,更适合微量降解检材的扩增检测;且该复合扩增检测体系采用五色荧光标记技术,具有更强的检测平台适配性。本发明具有重要的应用价值。
本发明公开了一种用于进行族源推断的复合体系及其推断方法和应用。该复合体系包括用于扩增20个AIMs位点的复合引物,以及与上述20个AIMs位点一一对应的单碱基延伸引物;复合引物具体序列如SEQ ID NO.1~40所示,单碱基延伸引物具体序列如SEQ ID NO.41本发明采用20个特异性AIMs位点的组合构成了能对未知个体进行有效的复合扩增的检测体系。
本发明公开了一种SNP‑SNP标记的复合体系及其检测不平衡混合样本的方法和应用。该复合体系包括扩增以下17个复合遗传标记SNP‑SNP的复合扩增引物、单碱基延伸引物以及测序引物;复合扩增引物中每个位点均包括两条正向引物和一条反向引物,其序列如SEQ ID NO.1~51所示,单碱基延伸引物具体序列如本发明中17个新型复合遗传标记SNP‑SNP的复合体系的检测方法包括ARMS‑PCR、SNaPshot和CE技术的结合应用,并且所使用的仪器设备均为可以很容易地在法医实验室中操作,而无需对额外设备进行任何投资
本发明涉及分子生物学技术领域,尤其涉及21个微单倍型位点的复合扩增体系、下一代测序分型试剂盒及分型方法。该复合扩增体系中的21个微单倍型位点来自于21个常染色体,等位基因频率均衡,位点间相互独立,具有多态性、突变率低等优势。该试剂盒中包含如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.53所示的53条PCR扩增单端特异性引物,能够在同一反应体系中检测上述21个微单倍型位点。本发明所提供的复合扩增体系和试剂盒以及分型方法能够解决目前STR分型技术无法获得理想的分型结果、SNP位点数过多位可能出现等位基因丢失的技术问题。