[发明专利]一种识别合子型基因激活ZGA基因的方法及装置在审
| 申请号： | 202011288493.5 | 申请日： | 2020-11-17 |
| 公开（公告）号： | CN112382339A | 公开（公告）日： | 2021-02-19 |
| 发明（设计）人： | 李昊;陈河兵;黄昕;孙昱;杜桂芳;王军婷;陶欢;许康;伯晓晨 | 申请（专利权）人： | 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 |
| 主分类号： | G16B25/10 | 分类号： | G16B25/10;G16B30/20;G06K9/62 |
| 代理公司： | 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 | 代理人： | 毕翔宇 |
| 地址： | 100082 *** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本申请提供了一种识别合子型基因激活ZGA基因的方法及装置，其中，所述方法包括：获取胚胎发育过程中细胞基因的基因表达矩阵，其中，基因表达矩阵包括处于不同发育时间点的细胞基因的表达量；对不同发育时间点进行划分，得到胚胎的不同发育阶段；基于得到的不同发育阶段将基因表达矩阵划分为N个基因表达子矩阵，其中，每个基因表达子矩阵包括处于相同发育阶段的细胞基因的表达量；获取与每个基因表达子矩阵对应的表达量特征值；基于各个基因表达子矩阵和获得的表达量特征值确定ZGA基因。这样一来，通过从细胞基因中确定出的各个基因表达子矩阵和获得的表达量特征值确定ZGA基因，误差较小，可靠性较高，从而提高了细胞基因识别的准确率。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 识别 合子 基因 激活 zga 方法 装置 | ||
【主权项】：
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- 苏元帅;薛晨;李兰娟 - 浙江大学医学院附属第一医院
- 2023-03-30 - 2023-08-01 - G16B25/10
- 本发明涉及肝癌领域，尤其是涉及一种巨噬细胞标记基因在肝癌预后中的应用及其风险评估模型。巨噬细胞标记基因在肝癌预后中的应用，该巨噬细胞标记基因包括TPP1、FTL、CXCL8、CD68、ATP6V1F、CSTB、YBX1、LGALS3和APLP2。本申请基于TAM相关标记基因确定了3种分子亚型后，发现三种亚型之间的预后生存率和免疫特征存在着显著性差异。随后，9个基因风险预测模型（TPP1、FTL、CXCL8、CD68、ATP6V1F、CSTB、YBX1、LGALS3和APLP2）被确定为HCC患者的独立预后因素。与风险评分低的患者相比，风险评分高的患者生存率较低，免疫治疗获益较少。本申请构建了一个TAM相关的风险评估模型，该风险评估模型在预测HCC患者的预后生存率和免疫治疗反应方面具有极好的效果。
- 一种基于两组比较的单细胞表达模式差异评估方法、介质和设备-202310223978.3
- 陈哲名 - 杭州联川生物技术股份有限公司
- 2023-03-02 - 2023-08-01 - G16B25/10
- 本发明公开了一种基于两组比较的单细胞表达模式差异评估方法、介质和设备，涉及生物信息分析技术领域。包括以下步骤：S101，合并对照组和处理组的单细胞转录组表达谱；S102，对合并后的单细胞转录组表达谱中的所有细胞进行分群；S103，对各细胞群进行细胞类型的鉴定；S104，筛选出同时存在于对照组和处理组的细胞类型，并提取其表达谱；S105，计算出该细胞类型的差异富集得分；S106，将所述细胞类型按照差异富集得分从大到小进行排名。本发明能够评估两组比较下单细胞表达谱差异大小与差异富集程度的确切指标，为科学选择后续研究方向提供依据。
- 一种基于A星算法的蛋白质序列标签测序方法-202310035764.3
- 李闯;刘纯洋;何典;祝团飞;南苏琴 - 湖南工商大学
- 2023-01-10 - 2023-07-25 - G16B25/10
- 本发明公开了一种基于A星算法的蛋白质序列标签测序方法，包括：获取待测蛋白质的原始质谱数据，对所述原始质谱数据进行预处理；构建谱峰连接图；生成候选序列标签；找出符合母离子质量的候选肽段；从数据库中搜索序列标签并进行匹配打分排序。采用本方法有利于提高从头测序生成候选肽段的速度，生成多个碎裂标签能提高准确率，促进蛋白质序列鉴定的发展，为大数据时代下的大规模蛋白质鉴定识别奠定了基础。
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