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[发明专利]SNP rs62065444位点作为靶点在制备检测和/或治疗卵巢癌的产品中的应用-CN202310827357.6在审
发明人：肖景发;路明明;盛欣;康禹;楚亚男;曾瀞瑶;张哲文;卜琮凡 -专利权人：中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）
申请日： 2023-07-06 - 公布日： 2023-09-01 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明涉及生物检测领域，尤其涉及SNP rs62065444位点作为靶点在制备检测和/或治疗卵巢癌的产品中的应用。本发明在人高级别浆液性卵巢癌细胞中转染lncRNA CRHR1‑IT1，并上调其表达，观察不同转染浓度处理的细胞的生长和凋亡情况，并对各组细胞状态进行实时荧光监测和RNA‑Seq转录组测序，探究随lncRNA CRHR1‑IT1表达水平变化而显著改变的差异基因及其功能，构建共表达网络，挖掘lncRNA CRHR1‑IT1所影响的蛋白编码基因和调控网路，从而解释HGSOC风险位点通过调控lncRNA CRHR1‑IT1的表达水平而影响的中间的生物学过程和可能的分子机制。
snp rs62065444 作为制备检测治疗卵巢癌产品中的应用

[发明专利]用于体液细菌与细胞分离的芯片、制作方法及其使用方法-CN201910827091.9有效
发明人：邵长君;康禹;石兴;楚亚男;王建;孟庆仁;于军 -专利权人：中国科学院北京基因组研究所
申请日： 2019-09-03 - 公布日： 2022-11-01 - 主分类号： C12M1/12 文献下载
摘要：本发明涉及生命科学技术领域，尤其涉及一种用于体液细菌与细胞分离的芯片、制作方法及其使用方法；芯片包括：上板、下板以及微孔膜，下板、微孔膜以及上板由下至上依次叠放，下板设有进液通道，上板设有收集通道，进液通道与收集通道通过微孔膜连接，进液通道与收集通道具有突腔结构，收集通道设有升流台；制作方法包括：制备模具，加热，并压制封装；本发明使用方法从进液通道通入体液，从收集通道逆向通入缓冲盐溶液，细菌可以通过微孔膜而被收集，而细胞则不能通过，实现细菌和细胞两者的被动式分离，这种分离方式不会对细胞活性、生物学形状和功能产生不良影响。
用于体液细菌细胞分离芯片制作方法及其使用方法

[发明专利]一种RNA外切酶-纳米孔复合体及其制备方法和应用-CN202011289612.9有效
发明人：康禹;邵长君;于军;陈婧;楚亚男 -专利权人：中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）
申请日： 2020-11-17 - 公布日： 2022-08-26 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：一种RNA外切酶‑纳米孔复合体及其制备方法和应用。该应用为RNA的测序方法，包括以下步骤：采用RNA外切酶‑纳米孔复合体，先利用RNA外切酶将测序样品从一端开始，依次切下单个核苷酸并通过纳米孔，再利用核苷酸通过纳米孔的特征，进行基础核苷酸和修饰核苷酸判定；如判定结果为基础核苷酸，则记录其AUCG的种类及顺序；如判定结果为修饰核苷酸，则记录其位置，并通过其他谱学特征检测其化学修饰的种类；通过上述过程，得到测序样品的核苷酸及其化学修饰的序列信息，实现RNA序列的直读。RNA外切酶‑纳米孔复合体包括：纳米孔结构；固定在纳米孔结构内的RNA外切酶。该RNA外切酶‑纳米孔复合体能够用于RNA直测，测序速度快且能够保障各种修饰核苷酸都能够被测定。
一种 rna 外切纳米复合体及其制备方法应用

[发明专利]标志物及其检测试剂在制备筛查和/或辅助诊断ASD的试剂盒中的应用-CN202210281910.6在审
发明人：康禹;楚亚男;邵长君;王建;陈婧 -专利权人：中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）
申请日： 2022-03-22 - 公布日： 2022-07-29 - 主分类号： C12Q1/6883 文献下载
摘要：本发明提供了标志物及其检测试剂在制备筛查和/或辅助诊断ASD的试剂盒中的应用。本发明研究发现口腔链球菌Streptococcaceae(科)丰度、口腔链球菌噬菌体(Streptococcalphages)丰度以及所携带的毒力因子(virulence factors，VFs)丰度，在ASD与正常儿童口腔中有显著差异，且与ADOS评分和语言交流评分等临床表现的严重程度密切相关，在平行的肠道菌群取样中未观察到这些变化，这表明ASD发病机制与链球菌噬菌体过度富集之间存在一种前所未有的口腔特异性关联，并且与疾病严重程度密切相关。
标志及其检测试剂制备辅助诊断 asd 试剂盒中的应用

[发明专利]一种核酸检测的通用试剂-CN202210262671.X在审
发明人：康禹;邵长君;王建;楚亚男;陈婧 -专利权人：中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）
申请日： 2022-03-17 - 公布日： 2022-06-28 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本发明涉及核酸分子检测技术领域，尤其涉及探针组合及其应用。本发明通过与微球连接的核酸链之间发生的趾托介导的链置换(TMSD，Toehold‑mediated strand displacement)反应，使微球形成凝集块，至肉眼可见。该方法不需要复杂的操作或昂贵的设备，无需生物酶参与，无需扩增待测靶标，能够作为分子检测试剂提供快速、现场的定性及半定量检测。实验表明，本发明设计的探针组合，在对样品进行检测的过程中，能够准确识别含有靶标和不含有靶标的样品，灵敏度可达到100fM。
一种核酸检测通用试剂

[发明专利]核酸检测试剂及其应用-CN202210262743.0在审
发明人：康禹;薛勇彪;邵长君;王建;楚亚男;陈婧 -专利权人：中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）
申请日： 2022-03-17 - 公布日： 2022-06-03 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本发明涉及核酸检测技术领域，尤其涉及核酸检测试剂及其应用。通过与微球连接的DNA链之间发生的趾托介导的链置换(TMSD)反应，使微球形成凝集块，至肉眼可见，实现无需设备的现场结果判读和检测，且显著降低成本。该方法中联合使用检测靶标的捕获、催化探针簇放大，以及多级TMSD反应，和微球凝集反应，实现样品信号106‑8倍放大以及结果的肉眼直接判读。本发明所开发的传感系统具有高灵敏度和高特异性，由于该方法不需要复杂的操作或昂贵的设备，无需生物酶参与，无需扩增待测靶标，成本低廉，是一种在检测条件受限的现场条件下的简单有效的、高灵敏、高特异性的定性及半定量检测手段，具有广泛的用途。
核酸检测试剂及其应用

[发明专利]用于类风湿关节炎炎症状态评估及预后评价的肠道微生物菌群-CN201910626459.5有效
发明人： 楚亚男;康禹;孟庆仁;于军;石兴;邵长君;王建;陈婧 -专利权人：中国科学院北京基因组研究所
申请日： 2019-07-11 - 公布日： 2021-02-02 - 主分类号： C12N1/20 文献下载
摘要：本发明提供用于类风湿关节炎炎症状态评估及预后评价的肠道微生物菌群，所述肠道微生物菌群包括肠道产丁酸菌和肠道非发酵菌两类肠道菌；其中，所述肠道产丁酸菌包括12个产丁酸菌菌属的微生物，所述肠道非发酵菌包括33个非发酵菌菌属的微生物。本发明首次提出肠道菌群中产丁酸菌与非发酵菌通过产生/消耗肠道丁酸，影响肠道丁酸净产量，从而影响RA的炎症状态及预后。对大样本进行验证，结果表明，通过粪便宏基因组检测，获得产丁酸菌与非发酵菌总丰度比值，即可评估RA的炎症状态及预后情况，且具有较高的敏感性和特异性。
用于类风湿关节炎炎症状态评估预后评价肠道微生物

[发明专利]病毒适应人类宿主的突变位点的预测方法及其应用-CN202010733451.1在审
发明人：康禹;于军;孟庆仁;楚亚男;陈婧;邵长君 -专利权人：中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）
申请日： 2020-07-27 - 公布日： 2020-09-15 - 主分类号： C12Q1/70 文献下载
摘要：本发明公开了病毒适应人类宿主的突变位点的预测方法及其应用。具体涉及与病毒适应人体宿主的适应性突变及其作为药物靶标和生物标志物的应用。本发明首次发现动物宿主冠状病毒存在被人肺组织miRNA攻击的靶点，人冠状病毒通过适应性突变丢失这些基因组上的靶点而获得在人类宿主中传播的能力。本发明提供的冠状病毒适应性突变的位点可以用于治疗或预防冠状病毒感染的药物设计靶标，以及检查冠状病毒宿主范围的生物标志物。同时，本发明提供的预测病毒基因组上受宿主miRNA攻击靶点的算法可以用于预测各种病毒的RNAi敏感靶点，开发治疗和预防相应的病毒感染的药物设计靶标以及宿主范围检查生物标志物。
病毒适应人类宿主突变预测方法及其应用

[发明专利]一种痰液微生物的快速提纯试剂及其应用-CN201810745633.3有效
发明人：邵长君;康禹;石兴;于军;林强;王建;楚亚男;付荣荣 -专利权人：中国科学院北京基因组研究所
申请日： 2018-07-09 - 公布日： 2020-08-28 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明提出一种痰液微生物的快速提纯试剂，包括液化液、细胞裂解液、核酸外切酶缓冲液；所述细胞裂解液含有胍盐和表面活性剂，所述胍盐在细胞裂解液中的浓度为1～3mol/L。本发明还提出所述痰液微生物的快速提纯试剂的应用。本发明提出的痰液微生物的快速提纯试剂，采用低浓度盐酸胍与表面活性剂及还原剂相结合，完全裂解人细胞(核)，细胞崩解导致基因组DNA释放到溶液中，大部分在离心获取细菌时而被除去，残余的游离DNA将被DNase进一步消化，而细菌由于细胞壁的保护不受影响或者影响很小。
一种微生物快速提纯试剂及其应用

[发明专利]与自闭症相关的肠道菌群生物标志物及其应用-CN202010183758.9在审
发明人： 楚亚男;康禹;孟庆仁;石兴;于军;邵长君;王建;陈婧 -专利权人：中国科学院北京基因组研究所
申请日： 2020-03-16 - 公布日： 2020-05-26 - 主分类号： C12Q1/6883 文献下载
摘要：本发明涉及微生物组学和医学分子生物学技术领域，具体涉及与自闭症相关的肠道菌群生物标志物及其应用。本发明首次发现肠道菌群可以辅助肠道毒物的降解，减少线粒体因毒物积累带来的损伤以及由此诱发的ASD的发生。本发明提供的与ASD相关的肠道菌群生物标志物包括5条代谢通路，涉及31种酶类，利用该生物标志物进行ASD的诊断和患病风险评估具有较高的准确性、敏感性和特异性，且样本采集便捷、不会造成机体损伤、检测方便快速、可进行定期检测，及早发现肠道毒物降解能力的变化，辅助ASD的早期诊断和筛查，为指导治疗及康复方案的及时调整提供依据。
自闭症相关肠道群生标志及其应用

[发明专利]痰液样品中病原菌的快速提纯装置及快速提纯方法-CN201710288471.0有效
发明人：康禹;罗春雄;邵长君;吴天;于军;林强;王建;楚亚男;付荣荣 -专利权人：中国科学院北京基因组研究所
申请日： 2017-04-27 - 公布日： 2019-06-28 - 主分类号： C12M1/00 文献下载
摘要：本发明提出一种痰液样品中病原菌的快速提纯装置，包括病原菌收集通道和由串联的分离单元构成的主通道，多个串联的分离单元形成串状结构，所述串状结构与病原菌收集通道平行；每个分离单元包括至少有部分凸起朝向所述病原菌收集通道的弧形部分，弧形部分的凸起与所述病原菌收集通道通过栅栏连接。本发明还提出一种痰液样品中病原菌的快速提纯方法。本发明提出的痰液样品中病原菌的快速提纯装置操作方便，操作时只需要简单将样品推过芯片即可。稳定性高，对不同的流速大小，不同粘度的样品，不同细菌比率的样本，分离去除动物细胞的效率稳定在99％以上，收集病原菌能保持接近原样品一半的水平。
病原菌收集通道痰液样品分离单元提纯装置串状结构提纯凸起串联动物细胞细菌比率主通道去除平行样本栅栏芯片

[发明专利]一种痰液液化试剂、含有其的试剂盒及其应用-CN201810161127.X在审
发明人：邵长君;康禹;于军;林强;王建;楚亚男;付荣荣 -专利权人：中国科学院北京基因组研究所
申请日： 2018-02-27 - 公布日： 2018-08-17 - 主分类号： G01N1/28 文献下载
摘要：本发明提出一种痰液液化试剂，包括固定剂、液化液、玻璃珠、核酸外切酶缓冲液；所述固定剂中含有溶剂和聚合物，所述聚合物为聚天冬氨酸钠或聚‑L‑谷氨酸，所述液化液中含有还原剂和pH值为7.0～8.5的缓冲溶液。本发明还提出含有所述痰液液化试剂的试剂盒及其应用。本发明的痰液液化试剂从保留细胞与细菌完整性、提高痰液液化效率以及消除高分子DNA复合物等方面入手对痰液进行液化，液化后的痰液可以更好地满足微米级微流控芯片的分离细菌使用。本发明的试剂优势是能够缩短液化时间、提高液化效率，提高细菌分离效率、降低人细胞基因组DNA含量。
痰液液化试剂液化液化效率聚合物固定剂试剂盒液化液聚天冬氨酸钠谷氨酸核酸外切酶微流控芯片基因组DNA 分离细菌缓冲溶液细菌分离玻璃珠还原剂缓冲液人细胞微米级溶剂应用细菌细胞保留

[实用新型]一种可埋主管式新型滴灌装置-CN201420790655.9有效
发明人：汪永刚;张亚哲;李志维;许海龙;刘冬冬;楚亚男;李喜乐;张青;韩龙龙;潘虎;刘博 -专利权人：河北润田节水设备有限公司
申请日： 2014-12-15 - 公布日： 2015-05-06 - 主分类号： A01G25/02 文献下载
摘要：本实用新型公开了一种可埋主管式新型滴灌装置，它涉及滴灌装置领域，它包含第一滴水毛管、第二滴水毛管、承插三通管、承插直通阀、PE管、承插旁通、PE主管，第一滴水毛管与第二滴水毛管上均设置有承插直通阀第一滴水毛管与第二滴水毛管之间通过承插三通管连接，且承插三通管的两端分别插设在第一滴水毛管与第二滴水毛管的一端，承插三通管的第三端与PE管的一端相插接，PE管的另一端通过承插旁通插设在PE主管内。它结构设计合理，操作简单，使用方便，通过采用特殊连接方式，使滴灌装置的主管部分埋起来，其滴水毛管附在地表，不仅每行滴水毛管都可以单独控制，还能提高管材的使用寿命，满足人们的使用需求。
一种主管新型滴灌装置

[实用新型]一种可埋式抗堵性新型滴灌管-CN201420724959.5有效
发明人：汪永刚;张亚哲;李志维;许海龙;刘冬冬;楚亚男;李喜乐;张青;韩龙龙;潘虎;刘博 -专利权人：河北润田节水设备有限公司
申请日： 2014-11-27 - 公布日： 2015-04-01 - 主分类号： A01G25/06 文献下载
摘要：本实用新型公开了一种可埋式抗堵性新型滴灌管，它涉及滴灌管领域，它包含PE管、迷宫式流道、过滤式进水口、过滤网、迷宫式出水口、调压式硅胶片，PE管内设置有过滤式进水口，迷宫式流道的一端穿过PE管的管壁与过滤式进水口连接，过滤式进水口内设置有过滤网，迷宫式流道的另一端设置有迷宫式出水口，且迷宫式流道与迷宫式出水口之间设置有调压式硅胶片。它结构设计合理，操作简单，使用方便，不仅能使滴灌管可以埋起来使用，还可以根据作物的间距调节滴头的位置，具有更好的调节压力的作用和抗堵性，满足了人们的使用需求。
一种可埋式抗堵性新型滴灌

[实用新型]一种可自控组装式微喷装置-CN201420651755.3有效
发明人：汪永刚;张亚哲;李志维;许海龙;刘冬冬;楚亚男;李喜乐;张青;韩龙龙;潘虎;刘博 -专利权人：河北润田节水设备有限公司
申请日： 2014-11-03 - 公布日： 2015-04-01 - 主分类号： A01G9/24 文献下载
摘要：本实用新型公开了一种可自控组装式微喷装置，它涉及农业供水技术领域，它包含支管、旁通、毛管、重锤、防滴器和喷头；支管上设置有旁通，且旁通与支管垂直设置，旁通的下端与毛管的一端连接，毛管的另一端连接有防滴器，防滴器上连接有喷头，防滴器的上部设置有重锤。它可以根据实际环境的需要选取毛管的长度，提高微喷系统的灌水效果，且整个系统的每个部分都是可以拆卸、更换、组合的，实用性强。
一种自控组装式微装置

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