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[发明专利]USP48基因突变在ACTH型垂体腺瘤分子诊断中的应用-CN201710183235.2有效
发明人： 师咏勇;黄传新;赵曜;陈剑华;马增翼;宋智建;张启麟;间学敏;彭虹;阎海;叶钊;何文强;沈明;王镛斐;李士其;史之峰;宋剑平 -专利权人：上海交通大学;复旦大学附属华山医院
申请日： 2017-03-24 - 公布日： 2023-01-03 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明提供了USP48基因突变在ACTH型垂体腺瘤分子诊断中的应用,具体地本发明提供了一类在ACTH型垂体腺瘤患者体内特异的基因突变，即，USP48基因的突变，实验结果表明，通过对USP48基因的突变的检测能够诊断ACTH型垂体腺瘤患者，为后续的特异性、靶向性治疗提供了诊断基础。本发明还提供了此类突变的基因作为垂体腺瘤治疗靶点的应用。
usp48 基因突变 acth 垂体腺瘤分子诊断中的应用

[发明专利]基于空间交错编码多组学芯片及其制备方法与应用-CN202211046021.8在审
发明人： 师咏勇;张满仓;陈建;陈兴华 -专利权人：上海交通大学;上海迪赢生物科技有限公司
申请日： 2022-08-30 - 公布日： 2022-11-25 - 主分类号： C40B50/06 文献下载
摘要：本发明公开了基于空间交错编码多组学芯片及其制备方法与应用。本发明基于3D喷墨原位DNA合成技术利用空间交错编码策略制作高分辨率的大尺度空间多组学芯片，进而使用空间原位捕获策略对组织切片进行高通量的原位转录组分析、原位表观组分析、原位非编码RNA分析和原位蛋白组分析；实现了单细胞分辨率、大尺度空间覆盖，同时兼顾高的基因数目检出率；可用于器官或组织的三维全覆盖精确转录图谱或时空图谱构建。
基于空间交错编码多组学芯片及其制备方法应用

[发明专利]整合多组学与必需基因的肿瘤细胞系药物响应预测方法-CN202211032553.6在审
发明人：王卓;师咏勇;吴沛柯 -专利权人：上海交通大学
申请日： 2022-08-26 - 公布日： 2022-11-01 - 主分类号： G16H70/40 文献下载
摘要：本发明公开了一种整合多组学与必需基因信息的肿瘤细胞系药物响应预测方法，涉及肿瘤药物响应预测领域，该预测方法为DROEG预测方法(Drug Response basedon Omics and Essential Genes)，通过纳入基因表达数据、拷贝数变异数据、甲基化数据、体细胞突变数据四种组学数据，以及CRISPR基因效应数据(CERES Score)构建药物响应模型，并通过定性评价方法和定量评价方法全面评价模型的效果。本发明引入CRISPR必需基因信息，建立药物响应预测模型，比现有方法更加准确；同时具备定量与定性预测评估的功能，适用性更广，操作更灵活。
整合多组学必需基因肿瘤细胞系药物响应预测方法

[发明专利]一种用于氯氮平个体化用药指导的基因检测试剂、试剂盒、检测方法及应用-CN202010981604.4有效
发明人：李志强;师咏勇;陈剑华;高成文;陈瑞瑞 -专利权人：青岛大学附属医院;上海市精神卫生中心（上海市心理咨询培训中心）
申请日： 2020-09-17 - 公布日： 2022-08-23 - 主分类号： C12Q1/6883 文献下载
摘要：本发明提供一种用于氯氮平个体化用药指导的基因检测试剂、试剂盒、检测方法及应用，基因检测试剂包括用于检测rs377360、rs4773794、rs10512698、rs116982346、rs73482673、rs9808117、rs373695、rs7501702、rs8024434基因多态性检测位点的特异性引物及探针。该用于氯氮平个体化用药指导的基因检测试剂、试剂盒、检测方法及应用，可快速、准确、特异性的对氯氮平药物个体化用药相关基因多态性的进行测定，实现氯氮平个体化用药指导，以降低临床氯氮平药物常见用药的不良反应，降低医疗成本，节约社会资源。
一种用于氯氮平个体化用药指导基因检测试剂试剂盒方法应用

[发明专利]一种基于暗探针技术的NGS靶向捕获方法及其在差异深度测序中的应用-CN202210242595.6在审
发明人： 师咏勇;张满仓 -专利权人：上海交通大学
申请日： 2022-03-11 - 公布日： 2022-05-27 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于暗探针技术的NGS靶向捕获方法及其在差异深度测序中的应用。本发明提供了一种同时检测全基因组目的区域范围内外显子和SNP位点的靶向捕获高通量测序方法，包括：根据所述目的区域的核苷酸序列设计能够捕获所述目的区域内全部外显子和全部SNP位点的两组原始探针；两组原始探针中有一组同时存在标记和不标记的两种形式，另一组只存在标记形式；将两组探针按照标记探针比例不同进行配比组合然后与待测基因组文库杂交，得到捕获文库；高通量测序。本发明的暗探针捕获法比标准的外显子测序操作相同的单管反应下根据不同区域的需求控制测序覆盖度，显著提高NGS的数据利用率。本发明的暗探针方法可以作为WGS的高性价比的替代方案。
一种基于暗探技术 ngs 靶向捕获方法及其差异深度中的应用

[发明专利]一种基于核酸杂交的DNA分子逻辑门-CN202111619361.0在审
发明人：王志敏;师咏勇;潘敦;孙伯宁;温燕勤;虞修简 -专利权人：上海产业技术研究院;上海交通大学
申请日： 2021-12-27 - 公布日： 2022-05-13 - 主分类号： G16B30/20 文献下载
摘要：本发明涉及一种基于核酸杂交的DNA分子逻辑门。本发明具体提供一种基于核酸杂交的DNA分子逻辑门，包括：输入信号、信号转化单元和输出信号，所述输入信号包括：至少两种DNA输入链；所述信号转化单元包括：底物链；所述输出信号包括：核酸扩增结果。本发明基于DNA自组装，为DNA计算机基本原理的构建提供了一种简单可行的方案。
一种基于核酸杂交 dna 分子逻辑

[发明专利]一种基于有机薄膜晶体管阵列的尿酸传感器及控制方法-CN201910053174.7有效
发明人：潘敦;师咏勇;郭小军;唐伟;温燕勤 -专利权人：上海交通大学
申请日： 2019-01-21 - 公布日： 2022-03-11 - 主分类号： G01N27/26 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于有机薄膜晶体管阵列的尿酸传感器，涉及尿酸技术领域，包括若干传感单元，任意所述传感单元包括有机薄膜晶体管和活性电极；其特征在于，所有传感单元构成N行和M列的传感单元阵列；任意所述列的所有行的所述传感单元相同，且某所述列中的所有行的所述传感单元均用于测试所述待测溶液中尿酸的浓度，其余M‑1所述列中的所有行的所述传感单元的每列分别用于测试待测溶液中M‑1种所述尿酸干扰物质浓度。本发明还公开了所述尿酸传感器的控制方法，通过一次测试快速获取所有N×M列所有传感单元的测试数据，原理简单，方法快捷方便，特别适用于准确检测人体血液和其他体液中的尿酸浓度。
一种基于有机薄膜晶体管阵列尿酸传感器控制方法

[发明专利]CDH23基因突变在垂体腺瘤分子诊断中的应用-CN201710067907.3有效
发明人：赵曜;黄传新;师咏勇;张启麟;宋智建;马增翼;陈剑华;寿雪飞;叶钊;王镛斐;李士其;张逸超;宋剑平;陈峻叡;沈越;王晔 -专利权人：复旦大学附属华山医院;上海交通大学
申请日： 2017-02-07 - 公布日： 2021-11-02 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明提供了CDH23基因突变在垂体腺瘤分子诊断中的应用，具体地，本发明提供了一种CDH23基因、或其蛋白或其检测试剂的用途，用于制备一检测试剂或试剂盒，所述检测试剂或试剂盒用于检测垂体腺瘤和/或其易感性，并且预测肿瘤生长趋势。通过对CDH23基因或其蛋白的突变的检测能够诊断垂体腺瘤患者和/或其易感性，并且预测肿瘤生长趋势。本发明还提供了此类突变的基因或其蛋白作为垂体腺瘤治疗靶点的应用。
cdh23 基因突变垂体腺瘤分子诊断中的应用

[发明专利]抗精神病药物相关代谢综合征的易感基因及其应用-CN201510363820.1有效
发明人：陈剑华;徐一峰;师咏勇;杨琳;李岩;王琰;梁世桥 -专利权人：上海市精神卫生中心
申请日： 2015-06-26 - 公布日： 2021-10-08 - 主分类号： C12Q1/6883 文献下载
摘要：本发明提供了一种抗精神病药物相关代谢综合征的易感基因及其应用。具体地，涉及一种分离的含单核苷酸多态性即SNP位点的多核苷酸、或其检测试剂的用途，用于制备检测抗精神病药物相关代谢综合征易感性的试剂盒，其中，所述的多核苷酸中的SNP位点对应于：人染色体17p11.2区域(chr17:17708129(GRCh37/hg19))，rs11654081，C→T。通过检测该基因及SNP，能够辅助性判断个体对于抗精神病药物相关代谢综合征的易感性，为该综合征的诊断和相应治疗提供了新的途径；此外，该基因及SNP的发现，还提供了开发治疗相关代谢性综合征的药物新靶点，并可作为用于该综合征患者转归、预后的分子标志。
精神病药物相关代谢综合征基因及其应用

[发明专利]基于个体化代谢模型的肿瘤分型与潜在靶标预测方法-CN202110704567.7在审
发明人：王卓;师咏勇;孙仁梁;戴阳 -专利权人：王卓
申请日： 2021-06-24 - 公布日： 2021-09-07 - 主分类号： G16H50/50 文献下载
摘要：本发明公开的基于个体化代谢模型的肿瘤分型与潜在靶标预测方法，其包括如下步骤：步骤一：构建肿瘤病人个体化代谢网络模型；步骤二：基于步骤一所述的肿瘤病人个体化代谢网络模型的代谢特征进行精准分子分型；步骤三：基于步骤一所述的肿瘤病人个体化代谢网络模型预测对肿瘤细胞生长具有重要影响的基因作为潜在靶标。本发明具有如下优点：1.本发明建立的分子分型方案对应的生存曲线差异更为显著。2.基于代谢层次发现的预后标志物能够通过体液或血液进行检测，更加方便、易推广。3.本发明预测的潜在靶标是基于肿瘤细胞生长的定量模拟得到的，不同分型的病人具有个性化靶标，能够提高药物有效性响应。
基于个体化代谢模型肿瘤潜在靶标预测方法

[发明专利]用于微量DNA超低频突变检测的双分子自校验文库制备及杂交捕获的二代测序方法-CN201711073031.X有效
发明人： 师咏勇;周娟;沈佳薇 -专利权人：上海交通大学
申请日： 2017-11-03 - 公布日： 2021-08-24 - 主分类号： C12Q1/6827 文献下载
摘要：本发明公开了用于微量DNA超低频突变检测的双分子自校验文库制备及杂交捕获的二代测序方法。该方法包括如下步骤：血浆游离DNA提取，DNA化学错误修复，自校验双分子识别码发夹型接头制备，血浆游离DNA修复，DNA与接头连接，Pre‑PCR扩增，超量杂交捕获，Post‑PCR扩增，上机测序，数据纠错校正，突变分析与注释。本发明的方法可以高效实现血浆循环游离DNA的低频突变检测。DNA错误修复和双重冗余校验技术使得该方法在检测微量样本时具有超低的假阳性率和高灵敏度，避免了现有血浆循环游离DNA检测方法的缺陷，不仅可以实现癌症突变检测和靶向用药指导，也可实现胎儿遗传和出生缺陷早期筛查。
用于微量 dna 低频突变检测分子校验文库制备杂交捕获二代方法

[发明专利]Choriogonadotropin alfa在治疗多囊卵巢综合征中的应用-CN201911147826.X在审
发明人： 师咏勇;李志强;宋智健;郑辰翔;王卓 -专利权人：上海交通大学
申请日： 2019-11-21 - 公布日： 2020-02-28 - 主分类号： A61K38/24 文献下载
摘要：本发明公开了Choriogonadotropin alfa在治疗多囊卵巢综合征中的应用。本发明应用基因‑基因相互作用分析、蛋白质相互作用分析等系统生物学策略，并结合药物靶标数据TTD中17816种药物和DrugBank数据库共收录了7678种药物数据以及自主构建的药物分子‑蛋白质相互作用数据库，开展了PCOS基因网络和药物作用机制分析。通过构建的基因调控网络，发现9个易感基因是已知临床用PCOS治疗药物的直接或间接作用靶点，进一步发现Choriogonadotropin alfa在PCOS中具有潜在治疗作用。本发明为PCOS的治疗开启了新的药物研究方向。
choriogonadotropin alfa 治疗卵巢综合征中的应用

[发明专利]抗FNDC4的IgG抗体作为胃癌血清标志物的应用及其试剂盒-CN201710629386.6有效
发明人：李胜;王靖方;贺林;陈培华;秦胜营;蒋太交;宓现强;师咏勇;彭超;李兴旺;周育天;陈登宇 -专利权人：上海浦东解码生命科学研究院
申请日： 2017-07-28 - 公布日： 2019-07-05 - 主分类号： G01N33/68 文献下载
摘要：本发明公开了检测血清中抗FNDC4‑IgG抗体的试剂在制备诊断和预示胃癌的试剂盒中的应用，本发明利用抗FNDC4的IgG抗体作为胃癌血清标志物，定性测定人血清中抗蛋白质FNDC4的IgG抗体的水平，检测胃癌的特异性为90%，敏感性为92%，可以作为辅助胃癌早期诊断的一种手段，以提高胃癌早期诊断的敏感性和特异性。利用检测血清中抗FNDC4‑IgG抗体的试剂制作的胃癌诊断试剂盒，灵敏、安全、可靠、易操作。
fndc4 igg 抗体作为胃癌血清标志应用及其试剂盒

[发明专利]Etonogestrel在制备抗B细胞淋巴瘤产品中的应用-CN201610156842.5有效
发明人： 师咏勇;宋智健 -专利权人：上海交通大学
申请日： 2016-03-18 - 公布日： 2019-01-22 - 主分类号： A61K31/567 文献下载
摘要：本发明公开了Etonogestrel在制备抗B细胞淋巴瘤产品中的应用。本发明提供了Etonogestrel在制备治疗B细胞淋巴瘤产品中的应用。本发明的实验证明，本发明对FDA,CFDA已获批准的药物Etonogestrel进行肿瘤药物重定位，根据肿瘤不同的细胞系(组织类型)以及突变位点对适应症不是抗肿瘤的药物进行筛选，发现Etonogestrel抗B细胞淋巴瘤这种新用途，实现旧药新用。
etonogestrel 制备细胞淋巴瘤产品中的应用

[发明专利]Nicardipine在制备抗肺癌产品中的应用-CN201510385948.8有效
发明人： 师咏勇;宋智健 -专利权人：上海交通大学
申请日： 2015-06-30 - 公布日： 2019-01-08 - 主分类号： A61K31/4422 文献下载
摘要：本发明公开了Nicardipine在制备抗肺癌产品中的应用。本发明提供了Nicardipine在制备治疗非小细胞肺癌产品中的应用。本发明的实验证明，本发明对FDA,CFDA已获批准的药物Nicardipine进行肿瘤药物重定位，根据肿瘤不同的细胞系(组织类型)以及突变位点对适应症不是抗肿瘤的药物进行筛选，发现Nicardipine抗小细胞肺癌和/或非小细胞肺癌这种新用途，实现旧药新用。
nicardipine 制备肺癌产品中的应用

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