本发明公开了一种鉴定玉祁红芹的ISSR‑SCAR标记及其鉴定方法，通过对玉祁红芹和其它水芹品种进行总DNA提取、PCR扩增、引物筛选和ISSR‑SCAR检测，筛选到鉴定玉祁红芹的ISSR‑SCAR分子标记，并建立分子鉴别方法。SEQ ID NO:1所示引物可以在玉祁红芹样品中扩增得到SEQ ID NO:2所示片段，根据此片段设计SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的引物，成功进行玉祁红芹的品种鉴别。本发明操作简便、稳定可靠，首次应用于玉祁红芹品种的分子鉴定，可用于该品种的选种、育种、种植、采收和品种贸易等各环节的快速鉴定，同时对保护地理标志产品的种质资源具有重要的意义。
本发明公开了一种控制三百草叶片颜色转变的基因ScPEL及其应用。该基因CDS序列如SEQ ID NO.1所示。含有所述的基因ScPEL的重组表达载体。本发明所述的基因ScPEL在调节植物叶片颜色转变中的应用。本发明通过对不同颜色的三百草叶片进行转录组测序，筛选出了在白色苞片中特异性表达的基因PEL(Pseudo‑etiolation in Light)，将该基因在NCBI中进行同源性比对，未发现同源基因，提示ScPEL可能存在功能的特异性。通过设计引物克隆到基因ScPEL，CDS序列如SEQ ID NO.1所示，经功能验证发现该基能够控制三百草叶片颜色转变，为三白草中首次报道。
本发明于分子鉴别和水稻育种领域，公开了一种水稻抗稻瘟病Pi‑d2基因的显性功能分子标记Pi‑d2SNP，所述标记由如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的引物对组成。Pi‑d2基因第1383位核苷酸是A还是G，是区分Pi‑d2抗病还是感病等位基因的标记位点。对18个水稻育成品种进行验证，结果该显性功能分子标记能够精准区分携带Pi‑d2抗、感病等位基因的水稻品种。本发明以PCR技术为基础，操作简单、稳定可靠，不仅能快速区分水稻品种的基因型，而且能够直接地实现Pi‑d2基因在水稻种植资源以及育种后代中的鉴定，为定向育种提供快速有效的辅助分子鉴定技术，加速传统育种进程。
