本发明涉及分子标记技术领域,具体涉及一种用于预测新疆野生樱桃李抗南方根结线虫的分子标记。本发明提供用于检测所述分子标记的引物,所述引物具有如SEQ ID No.1‑2所示的核苷酸序列。使用本发明提供的引物预测新疆野生樱桃李抗南方根结线虫的方法,包括:提取新疆野生樱桃李叶片RNA并反转成cDNA;使用SEQ ID No.1‑2所示的引物进行PCR扩增;琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物。本发明在不接种南方根结线虫的情况下,进行抗性评估,可以筛选出抗性植株,为抗南方根结线虫优良砧木的鉴定与品种预选提供重要的科学指导意义。