本发明公开了与茄子果实颜色紧密连锁的SNP分子标记及应用，属于分子遗传育种技术领域，其技术方案要点是：SNP分子标记包括SNP分子标记Ⅰ和SNP分子标记Ⅱ；SNP分子标记Ⅰ包含SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列，且SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列自5’端起第51位碱基是SNP位点Ⅰ；SNP分子标记Ⅱ包含SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列，且SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列自5’端起第51位碱基是SNP位点Ⅱ；SNP位点Ⅰ和SNP位点Ⅱ分别位于茄子10号染色体的第95538422位碱基和第98266374位碱基，第95538422位碱基为C或T；第98266374位碱基为C或T；SEQ ID NO.1为TACATCAGTGCATAGTTTCATTTGAGTTGATATTTCGTATACAGTGTTTC[C/T]TGCCTTATATATTCAATACATTATCTCGTACTGATGTCCCTTACGGGGGA；SEQ ID NO.2为GATTATAATATGAGAAATCGAACATTCATTAATAATAATAAATAAAAGTT[C/T]AAATAATCAACTGATTAAACTATTAAGAAAGTTGATTTAGCCTATTACAA。本发明主要用于减少育种工作量，提高育种效率的优点。
