本发明涉及分子标记技术领域,具体涉及一种快速鉴定中华鳖遗传性别的SNP标记及其引物和应用,所述SNP标记为P9655,SNP标记为SEQ ID NO:1所示序列自5’端起第290位碱基为A/G,所述SNPs标记为AG基因型的个体为雌性中华鳖,SNP标记为AA基因型的个体为雄性中华鳖。本发明所述的分子标记的应用可解决中华鳖在性腺发育成熟之前,其性别通过肉眼难以准确、稳定判别的问题,可用于单性苗种培育,有助于中华鳖单性育种研究的开展。本发明所述的快速鉴定中华鳖遗传性别的方法,其仅需对1个SNP位点进行鉴定即可快速、准确确认性别,应用前景广阔。