[发明专利]一种基于ITS2序列快速鉴定地肤子与其混伪品的方法在审
申请号: | 201910951567.X | 申请日: | 2019-10-09 |
公开(公告)号: | CN111349711A | 公开(公告)日: | 2020-06-30 |
发明(设计)人: | 陈镜安;黄遵楠;刘镛;李斯璐;李琳;吕思敏;成雪梅;谢静怡;叶子欣;尹晓晴 | 申请(专利权)人: | 广东医科大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6869 |
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地址: | 523808 广东省东莞市*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 its2 序列 快速 鉴定 与其 伪品 方法 | ||
本发明公开了一种DNA水平快速鉴定地肤子与其混伪品的方法,包括如下步骤:1)提取样品地肤子DNA;2)以待测样品DNA为模板,PCR扩增ITS2序列的片段;3)将PCR产物正向测序,经过ITS2 database剪切获得地肤子ITS2序列;4)进行NJ系统发育树构建、种内及种间平均遗传距离分析、二级结构特征比较。结果表明地肤子ITS2序列聚类成一支独立进化枝,地肤子种内平均遗传距离显著小于地肤子与其混伪品种间平均遗传距离,且地肤子ITS2二级结构与混伪品的差异明显,说明ITS2序列作为快速准确鉴定地肤子与其混伪品。本发明方法操作简单、分辨率高,客观性、适用性和重复性强,能够实现可快速准确鉴定地肤子与其混伪品。
技术领域
本发明涉及一种基于ITS2序列快速鉴定地肤子与其混伪品的方法。
背景技术
地肤子为藜科地肤属植物地肤 (
目前,传统的中药材鉴定主要通过经验鉴别的方法,从形态色泽、种子的外观形态以及颜色、气味、切片等来鉴定药材的真伪与纯度;通过基原鉴定、性状鉴定和显微鉴定方法主要利用中药的外观性状和显微特征进行鉴定。如车光迅等通过性状和理化性质鉴别了地肤子与其混伪品藜、天仙子。刘媛文通过性状和理化性质鉴别了地肤子与其混伪品土荆芥。但此类传统鉴别方法要求鉴定员必须具有丰富而扎实的分类学知识和鉴别经验。与传统中药鉴定技术相比,DNA条形码技术是根据一段公认的、标准的短序列进行物种鉴定的分子诊断技术,摆脱了传统形态鉴定方法依赖长期经验的束缚,打破传统形态学物种鉴定的局限性,不受鉴定对象环境、个体发育和人为因素影响等优点,能直接从基因水平上提供鉴定依据,将有助于非药物分类学家对药用植物快速、准确的鉴定,是传统鉴定方法的有效补充。DNA条形码技术具有操作简单、分辨率高、准确高效、客观性、适用性和重复性强等的特点。近年来DNA条形码技术及其相关领域应用研究已成为生物学活跃的研究领域和新的热点话题之一,是未来物种鉴定的发展趋势。
中药鉴定的常用序列有matK、rbcL、psbA-trnH和ITS2。不同DNA条形码优缺点各不相同,例如matK引物通用性差,难以进行序列扩增和测序;rbcL序列虽然具有通用性、易扩增、易比对的优点, 但变异性不显著,鉴定效率较低;psbA-trnH比较容易设计通用引物,但序列重复结构较多,且测序的成功率较低;ITS2具有较好的稳定性与准确性优点,能快速鉴定物种。陈士林等比较了7种DNA条形码片段(psbA-trnH, matK, rbcL, rpoC1, ycf5,ITS2, and ITS)后发现核糖体DNA的ITS2为最合适的DNA条形码且验证ITS2在物种鉴定中的鉴定效率高达92.7%,并提出以ITS2为鉴定植物类群的核心识别条形码。
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