[发明专利]通过细菌宏基因组分析来诊断头颈癌的方法

说明书

本发明涉及通过细菌宏基因组分析诊断头颈癌的方法，并且更具体地涉及通过使用来源于正常个人和受试者的样品执行细菌宏基因组分析经由分析来源于特定细菌的细胞外囊泡的含量的增加或减少来诊断头颈癌的方法。从环境中存在的细菌分泌的细胞外囊泡引起局部慢性炎症或吸收到人体中，因此可直接影响癌症的发生，且难以在其症状发作前及早诊断出头颈癌，因此难以有效治疗。因此，根据本发明，可通过使用来源于人体的样品对来源于细菌的细胞外囊泡进行宏基因组分析诊断头颈癌的风险，且因此使得能够及早诊断并预测头颈癌的风险群，从而通过适当治疗延迟头颈癌发作或预防头颈癌发作，并且甚至在头颈癌发作后能够实施对头颈癌的早期诊断，从而降低头颈癌的发生率并提高治疗效果。

技术领域

本发明涉及通过细菌宏基因组分析诊断头颈癌的方法，更具体地，涉及通过使用来源于正常个体的样品和来源于受试者的样品进行细菌宏基因组分析以分析来源于特定细菌的细胞外囊泡的含量的增加或减少来诊断头颈癌的方法等。

背景技术

头颈部是指从大脑到上胸部的部分，并且包括口腔、喉、咽、鼻腔等，并且在这些器官中发生的癌症称为头颈癌。其中，口腔癌是发生在口腔中的癌症，其主要起源于构成口腔周围粘膜的鳞状细胞。作为口腔癌的危险因素，吸烟、口腔清洁卫生、持续的慢性刺激等是已知的。咽癌是发生在咽粘膜中的恶性肿瘤，并且吸烟、饮酒、病毒感染等是已知的危险因素。根据韩国中央癌症登记处(Korea Central Cancer Registry)公布的数据，除甲状腺癌外，每年头颈癌患者的数量为3,000，其发生频率在癌症中排名第八。头颈癌的诊断是通过在怀疑患有癌症时从肿瘤中切除组织进行活检来确定的。另外，为了确定癌症的程度，进行了诸如计算机断层摄影、磁共振成像检查和正电子发射断层摄影之类的测试。

同时，众所周知，在人体内共生的微生物数量为100万亿，是人类细胞数的10倍，微生物的基因数超过人类基因数的100倍。微生物群(microbiota)是一种微生物群落，其包括在给定栖息地中存在的细菌、古细菌和真核生物。已知肠道微生物群在人类的生理现象中起着至关重要的作用，并通过与人类细胞的相互作用对人体健康和疾病产生重大影响。共存于人体内的细菌分泌纳米级的囊泡，以与其他细胞交换关于基因、蛋白质、低分子量的化合物等的信息。粘膜形成不允许尺寸为200nm或以上的粒子通过的物理阻隔膜，因此共生在粘膜中的细菌不能通过，但来源于细菌的细胞外囊泡具有大约为100nm或更小的尺寸，因此相对自由地通过粘膜并被吸收到人体内。

宏基因组学(也称为环境基因组学)可以是针对从自环境中收集的样品获得的宏基因组数据的分析学(韩国专利公开No.2011-073049)。最近，使用基于16s核糖体RNA(16srRNA)碱基序列的方法列出了人类微生物群的细菌组成，并且使用下一代测序(NGS)平台分析了16s rDNA碱基序列，其是16s核糖体RNA的基因。然而，关于头颈癌的发生，没有关于通过分析来源于细菌的囊泡中存在的基因组来从来源于人的材料(例如唾液)中鉴定出头颈癌的病因以及诊断头颈癌的方法的报道。

发明内容

[技术问题]

本发明人从作为来源于正常个体的样品和来源于受试者的样品的唾液中存在的来源于细菌的细胞外囊泡中提取基因，并在这方面进行了宏基因组分析，以便提前诊断出头颈癌的病因和风险，并且结果，鉴定出可用作头颈癌的致病因子的来源于细菌的细胞外囊泡，从而基于此完成本发明。

因此，本发明的目的是提供一种通过对来源于细菌的细胞外囊泡的宏基因组分析提供用于诊断头颈癌的信息的方法，诊断头颈癌的方法，预测头颈癌发作的风险的方法等等。

然而，本发明的技术目标不限于上述目标，本领域普通技术人员根据下面的描述将清楚地了解其它未提及的技术目标。

[技术方案]

为了实现本发明的上述目的，提供了一种提供用于头颈癌诊断的信息的方法，该方法包括以下过程：