[发明专利]通过细菌宏基因组分析来诊断头颈癌的方法在审
申请号: | 201880067793.5 | 申请日: | 2018-04-26 |
公开(公告)号: | CN111406116A | 公开(公告)日: | 2020-07-10 |
发明(设计)人: | 金润根 | 申请(专利权)人: | MD保健株式会社 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895 |
代理公司: | 上海胜康律师事务所 31263 | 代理人: | 李献忠;张华 |
地址: | 韩国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 通过 细菌 宏基 组分 诊断 头颈 方法 | ||
1.一种提供用于诊断头颈癌的信息的方法,该方法包括:
(a)从分离自正常个体的样品和受试者的样品的细胞外囊泡中提取DNA;
(b)使用包含SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2的成对的引物对所述提取的DNA进行聚合酶链式反应(PCR);以及
(c)通过对所述PCR的产物进行测序,与来源于正常个体的样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量比较并确定来源于所述受试者样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。
2.根据权利要求1所述的方法,其中过程(c)包括比较并确定:
来源于选自由蓝细菌门(Cyanobacteria)和梭杆菌门(Fusobacteria)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。
3.根据权利要求1所述的方法,其中过程(c)包括比较并确定:
来源于选自由盐细菌纲(Halobacteria)、叶绿体纲(Chloroplast)、梭杆菌纲(Fusobacteriia)和ε-变形菌纲(Epsilonproteobacteria)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。
4.根据权利要求1所述的方法,其中过程(c)包括比较并确定:
来源于选自由嗜盐杆菌目(Halobacteriales)、双歧杆菌目(Bifidobacteriales)、木霉菌目(Streptophyta)、假单胞菌目(Pseudomonadales)、海洋螺菌目(Oceanospirillales)、梭杆菌目(Fusobacteriales)和弯曲菌目(Campylobacterale)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。
5.根据权利要求1所述的方法,其中过程(c)包括比较并确定:
来源于选自由假单胞菌科(Pseudomonadaceae)、盐杆菌科(Halobacteriaceae)、草酸杆菌科(Oxalobacteraceae)、盐单胞菌科(Halomonadaceae)、丛毛单胞菌科(Comamonadaceae)、乳杆菌科(Lactobacillaceae)、帕拉普氏菌科(Paraprevotellaceae)、梭杆菌科(Fusobacteriaceae)和弯曲菌科(Campylobacteraceae)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。
6.根据权利要求1所述的方法,其中过程(c)包括比较并确定:
来源于选自由贪铜菌属(Cupriavidus)、色盐杆菌属(Chromohalobacter)、假单胞菌属(Pseudomonas)、不动杆菌属(Acinetobacter)、水栖菌属(Enhydrobacter)、乳酸杆菌属(Lactobacillus)、韦荣氏球菌属(Veillonella)、梭杆菌属(Fusobacterium)、放线菌属(Actinomyces)、普雷沃氏菌属(Prevotella)、巨球形菌属(Megasphaera)、弯曲杆菌属(Campylobacter)和奥里杆菌属(Oribacterium)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。
7.根据权利要求1所述的方法,其中,所述正常个体的样品和受试者的样品是唾液。
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