[发明专利]一种肿瘤预后预测的方法和系统

权利要求书

1.一种肿瘤预后预测装置，应用于骨肉瘤，其特征在于，包括获取模块、预测模块和训练模块，其中，

所述获取模块用于获取骨肉瘤患者的特征信息，所述特征信息至少反映所述骨肉瘤患者在骨肉瘤病变部位的基因突变信息，所述基因突变信息包括DNA上的肿瘤预后预测相关基因及其突变丰度，基因的突变丰度为该基因上位点突变丰度大于设定值的一个或多个位点突变丰度的累加和，所述基因突变信息包括至少一种以下基因的突变信息：KMT2C、SOX9、LRP1B、NF-1、PRKDC、FAT1、STAG2、SLIT2、NOTCH1、EPHA7、ATRX、KDM6A、APC、RANBP2、RARA.AS1、C11orf30、ROS1、ARID2、TAF1、DICER1、MSH2、MSH6、TP53、KDM5A、JAK2、ALK、RB1、NOTCH2和RICTOR；

所述预测模块用于基于所述骨肉瘤患者的特征信息，根据肿瘤预后预测模型，确定所述骨肉瘤患者的预后预测结果，所述肿瘤预后预测模型为支持向量机模型；

所述训练模块用于利用多名骨肉瘤患者的特征信息及其预后信息训练初始模型获得所述肿瘤预后预测模型；

所述训练模块还用于：

根据多名骨肉瘤患者的特征信息中各基因突变信息对支持向量机模型的贡献值，确定至少部分基因为肿瘤预后预测相关基因；

利用多名骨肉瘤患者的所述肿瘤预后预测相关基因的基因突变信息及其预后信息训练所述初始模型获得所述肿瘤预后预测模型。

2.如权利要求1所述的肿瘤预后预测装置，其特征在于，所述基因突变信息还包括DNA上发生突变的基因及其突变丰度。

3.如权利要求1所述的肿瘤预后预测装置，其特征在于，所述特征信息还包括所述骨肉瘤患者的以下信息中的至少一条：年龄、性别、吸烟史、受教育年限、工作年限、治疗方案和样本保存时间。

4.如权利要求1所述的肿瘤预后预测装置，其特征在于，所述训练模块还用于去除所述多名骨肉瘤患者的基因突变信息中突变丰度小于某设定阈值的突变基因信息。

5.如权利要求1所述的肿瘤预后预测装置，其特征在于，所述训练模块还用于去除所述多名骨肉瘤患者的基因突变信息中的冗余基因突变信息。

6.如权利要求1所述的肿瘤预后预测装置，其特征在于，

所述训练模块还用于利用粒子群算法或网格划分法优化所述支持向量机模型的参数。

7.如权利要求1所述的肿瘤预后预测装置，其特征在于，

所述预后预测结果包括：疾病进展、疾病稳定、部分缓解和完全缓解；或者，

所述预后预测结果包括：治疗效果好和治疗效果不好。