本发明涉及与栽培种来源抗桃绿蚜性状紧密连锁的分子标记、引物、应用及品种选育方法。本发明在对一类栽培种来源的新抗蚜类型QMR类抗蚜材料的研究过程中发现了与一种与抗桃绿蚜性状紧密连锁的分子标记,该分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,5’端起第72‑91位插入或缺失。该分子标记与桃抗蚜性状紧密连锁,当SEQ ID NO.1所示序列的5’端起第72‑91位为插入纯合基因型时,待测样本为感蚜性状;当SEQ ID NO.1所示序列的5’端起第72‑91位为缺失纯合基因型或插入/缺失杂合基因型时,待测样本为抗蚜性状。对该分子标记的基因型进行检测能够早期、有效的预测待测植株是否具有抗蚜性状,本发明还提供了检测上述分子标记的引物及桃抗蚜品种选育方法。