本发明公开了一种与黄瓜株型紧密连锁的InDel分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示，InDel分子标记为如SEQ ID NO：1所示序列自5’端起第2010处碱基存在的一个102bp的缺失还公开了用于扩增InDel分子标记的引物、试剂盒和黄瓜株型的鉴定方法，以及InDel分子标记、引物、试剂盒或鉴定方法在黄瓜株型选育中的应用。采用本发明中的引物能产生黄瓜矮生型材料的特异性标记，且重复性好，特异性强；将本发明中InDel分子标记及引物用于鉴定黄瓜的株型，尤其是用于幼苗期快速鉴定黄瓜的株型，具有准确、快速、成本低、鉴定周期短，操作简便等优点
本发明“朱砂叶螨SCAR标记及其特异性PCR检测方法”，属于植物昆虫鉴定技术，所述朱砂叶螨的SCAR标记，具有Seq ID No.2所示的核苷酸序列；朱砂叶螨的特异性PCR检测方法，其特征在于PCR扩增体系中采用的特异性正反向引物是权利要求1所述的SCAR标记的核苷酸序列设计的，所述特异性正反向引物扩增的区域在所述SCAR标记的核苷酸序列上。此方法与传统鉴定方法相比，简便快速，省时省力，对分类专业和非分类专业人士来说均易于掌握，是一种快速鉴定朱砂叶螨的分子生物学方法。
一种稻瘟病抗性基因Pi9功能特异性分子标记及其应用，命名为Pi9InDel，核酸序列如SEQ ID NO.1所示。该分子标记Pi9InDel是通过引物对F1和R1从携带有稻瘟病抗性基因Pi9的稻瘟病抗性品种的总DNA中扩增出来得到得与稻瘟病抗性基因Pi9呈特异性带型的核苷酸片段I。该分子标记是第一个针对Pi9基因内部序列所开发的Pi9基因特异性InDel标记，具有如下优点：特异性高；在实际应用中，低成本、高通量；能广泛应用于遗传背景不同的群体中。利用该分子标记可以提高该基因在分子标记辅助选择育种、基因聚合育种，以及转基因育种中利用的效率。
本发明提供了一种虾夷扇贝雌性特异性分子标记组合及应用。本发明雌性特异性分子标记组合的核苷酸片段序列为SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:4，上述序列可利用常规PCR扩增进行虾夷扇贝性别鉴定。本发明提供的两对雌性特异性引物，扩增产物大小分别为593bp和477bp。两对引物联合使用，对虾夷扇贝性别鉴定的准确率达100％。
本发明公开了丝栗栲和米槠微卫星标记的特异性引物及检测方法。本发明通过利用公共数据库中现有的丝栗栲核苷酸序列，应用生物信息学方法并进行实验验证，开发出8对适用于米槠的丝栗栲微卫星分子标记的特异性引物，其碱基序列如SEQ ID NO.1‑16所示。本发明还提供了丝栗栲和米槠的EST‑SSR分子标记的检测方法，具有快速、简单、稳定和低成本的优点，为其它栲属植物EST‑SSR分子标记的开发提供了参考，本发明的特异性引物及微卫星标记检测方法为丝栗栲和米槠等栲属植物的群体遗传分化与结构、群体的遗传多样性水平、群体间的基因流及交配系统等研究以及栲属植物的分子辅助育种研究提供了新的工具。
