本发明属于猪的遗传标记制备技术领域，具体涉及HBEGF基因片段作为猪繁殖性状相关的遗传标记，该遗传标记从猪HBEGF基因中筛选得到，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列274位碱基处发生一个本发明的步骤为：从猪血液中提取基因组DNA，设计引物，PCR扩增，PCR产物克隆、测序，序列比较分析，SNP检测，标记与猪繁殖性状间相关性分析。公开了猪HBEGF基因内含子区内的SNP分型检测技术，发现该T/C突变位点与初生窝重和弱仔数等繁殖性状极显著相关。本发明为猪标记辅助选择提供了新的标记资源。
本发明属于家畜分子标记制备技术领域，具体涉及一种作为猪标记辅助选择的与猪免疫性状相关的分子标记制备与应用。所述的分子标记以猪MHCIITA基因mRNA序列为模板设计引物，PCR扩增、PCR产物纯化测序，获得如序列表SEQ ID NO：2所示的核苷酸序列，在SEQ ID NO：2所示的核苷酸序列中发现了9个单链核苷酸多态位点(SNP)，并开发了PCR-PvuII-RFLP方法检测其位于第188bp处的分子标记即碱基突变C188-T188。本发明公开了扩增的猪MHCIITA基因部分编码区和非翻译区的序列以及PCR扩增所用的引物和用于分子标记的检测方法。
本发明公开了一种利用CART基因单核苷酸多态性来预测猪脂肪沉积性能的方法，通过测定SEQ ID NO:1的5′端第425位核苷酸，以及SEQ ID NO:2的5′端第311位核苷酸，确定猪的基因型，来判断猪的脂肪沉积性能本发明可用于检测猪的活体背膘厚、胴体背膘厚、板油重、眼肌面积、瘦肉率等反映猪脂肪沉积性能的性状，从而为通过标记辅助选择或分子育种减少背膘厚、板油重，增加眼肌面积从而提高猪的瘦肉率提供新的重要遗传标记，并将在猪的育种中发挥重要作用
本发明属于猪分子标记筛选与应用领域，涉及一种猪精液品质性状关联的SNP遗传标记及应用。该遗传标记克隆自SPAG6基因第7外显子，所述猪精液品质性状为猪精液量、精子密度、精子活力和精子畸形率，所述猪的品种为杜洛克猪、大白猪和长白猪的公猪，所述遗传标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，在该序列的395位存在一个T或C的碱基替换，该替换导致ClaI‑RFLP多态性，该位点分别是检测杜洛克猪、大白猪和长白猪的精子活力的位点；检测长白猪和大白猪的精子密度的位点；检测长白猪的精液量的位点。本发明还提供了一种引物组合在猪精液品质性状辅助选择中的应用。
本发明属于家畜分子分子生物学技术领域，具体涉及猪SLC13A5基因的分子克隆及应用。本发明所述的分子标记由SLC13A5基因克隆得到，其SLC13A5分子标记的序列如SEQ ID NO1所示。SLC13A5基因的多态性是利用比较基因组学方法根据人的SLC13A5基因序列设计引物，以猪的基因组DNA为模板扩增，扩增片段利用测序筛选SNP，并利用PCR－RFLP进行基因分型，发现第251bp处有一个T/C的碱基突变，导致PCR‑RFLP‑Bsu36I多态性，并利用该标记检测了中外猪种的情况。本发明为猪标记辅助选择提供了新的分子标记。
本发明属于家畜分子分子生物学技术领域，具体涉及猪NR1H4基因的分子克隆及应用。本发明所述的分子标记由NR1H4基因克隆得到，其NR1H4分子标记的序列如SEQ ID NO：1所示。NR1H4基因的多态性是利用比较基因组学方法根据人的NR1H4基因序列设计引物，以猪的基因组DNA为模板扩增，扩增片段利用测序筛选SNP，并利用PCR－RFLP进行基因分型，发现第709bp处有一个A/G的碱基突变，导致PCR-RFLP-Mwo I多态性，并利用该标记检测了中外猪种的情况。本发明为猪标记辅助选择提供了新的分子标记。
