本发明公开了一种与猪胴体性状相关的分子标记及其应用，属于猪分子标记制备领域。所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，该序列的第371bp处存在A/G碱基突变；SEQ ID NO:1所示序列的第371bp处存在AA、AG或GG三种基因型，其中A等位基因为优势等位基因。本发明还提供了用于检测该位点的引物对，并建立了相应的检测方法，为猪胴体品质的遗传改良提供了新的分子标记，实现了对猪胴体性状进行早期选择；检测方法高效、准确，从而加速了猪遗传改良的进程，提高了猪育种的经济效益。
本发明公开了一种与猪肌肉pH值和瘦肉率性状相关的分子标记及其应用，属于猪遗传标记制备技术领域。SNP分子标记的核苷酸如SEQ ID NO:1所示，是从猪NT5C1A基因3′UTR克隆得到的一段特异的核苷酸片段，在SEQ ID NO:1的479bp处存在一个T/C碱基突变。本发明提供了用于检测该位点的引物对，并建立了相应的检测方法，为猪肉质性状标记辅助选择提供了新的分子标记。本发明可实现对猪肌肉pH值和瘦肉率相关性状进行早期选择，且检测方法高效、准确，从而能加速猪肉质改良的进程，提高猪育种的经济效益。
本发明公开了一种ATP11A基因中与公猪精液质量性状相关的SNP分子标记、引物对及其应用，涉及猪分子标记技术领域。所述公猪精液品质性状为精液量、精子密度和精子活率等性状；所述分子标记位于猪ATP11A基因启动子区域中，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，在该序列的第421bp处存在一处A421‑G421碱基突变。本发明还提供了一种用于扩增上述分子标记的引物对以及利用上述分子标记进行公猪精液性状筛选和/或猪育种的方法。本发明首次发掘了猪ATP11A基因中的一个SNP分子标记与公猪精液品质性状相关，因此可用于猪标记辅助选择育种，即提供了猪ATP11A基因中一个SNP分子标记在公猪精液品质性状的标记辅助育种的新用途，实现了对公猪繁殖性状的早期筛选，筛选方法简单快速。
本发明公开了一种猪SNP分子标记在猪乳头数性状筛选和猪育种中的应用，其中所述乳头数性状为左侧乳头数性状、右侧乳头数性状和总乳头数性状；所述分子标记的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，在该序列的第356bp处存在一处CT碱基突变。本发明还提供了一种用于扩增上述分子标记的引物对以及利用上述分子标记进行选育的方法。本发明首次发掘了猪ENSSSCG00000002825基因中的一个SNP分子标记与猪的左侧乳头数性状、右侧乳头数性状和总乳头数性状相关，因此可用于猪标记辅助选择育种，即提供了猪ENSSSCG00000002825基因中一个SNP分子标记在猪乳头数性状的标记辅助育种的新用途，实现了对猪乳头数性状的早期筛选，筛选方法简单快速。
本发明公开了一种与猪繁殖性状和猪育种相关的SNP分子标记及其应用，涉及猪分子标记技术领域。所述繁殖性状为总产仔数和健仔数；所述分子标记位于猪PCCB基因的部分DNA序列中，所述分子标记的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，该序列长度为713bp；所述分子标记包括rs345310133位点的SNP；在所述序列的第387bp处存在一处C/T碱基突变。本发明首次发掘了猪PCCB基因中的一个SNP分子标记与猪的总产仔数和健仔数性状相关，因此可用于猪标记辅助选择育种，即提供了猪PCCB基因中一个SNP分子标记在猪繁殖性状的标记辅助育种的新用途，实现了对猪繁殖性状的早期筛选，筛选方法简单快速。
本发明公开了一种与猪繁殖性状基因NCK1相关的SNP分子标记、引物对及其应用，涉及猪分子标记技术领域。所述繁殖性状为总产仔数、产活仔数和健仔数性状；所述分子标记位于猪NCK1基因第1号内含子中，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，在该序列的第109bp处存在一处A109‑G109碱基突变。本发明还提供了一种用于扩增上述分子标记的引物对以及利用上述分子标记进行选育的方法。本发明首次发掘了猪NCK1基因中的一个SNP分子标记与猪的总产仔数、产活仔数和健仔数性状相关，因此可用于猪标记辅助选择育种，即提供了猪NCK1基因中一个SNP分子标记在猪繁殖性状的标记辅助育种的新用途，实现了对猪繁殖性状的早期筛选，筛选方法简单快速。
本发明公开了一种基于SASH1基因的猪繁殖性状相关的InDel分子标记、引物及应用，涉及猪分子标记技术领域。其中，所述InDel分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，在该序列的第95和96bp之间的等位基因上存在一段8bp插入，所述8bp插入的核苷酸序列为GAAATCGG。本发明还提供了一种用于扩增上述分子标记的引物对以及利用上述分子标记进行选育的方法。本发明首次发现猪SASH1基因第四内含子中存在与猪的繁殖性状相关的多态性位点，该突变位点主要与猪繁殖性状的总产仔数、产活仔数和健仔数性状相关，从而，本发明根据该突变位点提供了一种与猪繁殖性状相关的分子标记，可将该分子标记用于筛选猪繁殖性状和选育，实现了对猪繁殖性状的早期筛选，筛选方法简单快速。
本发明公开了一种猪SNP分子标记及其在猪产仔数性状筛选和/或猪育种中的应用，涉及猪分子标记技术领域。所述母猪产仔数性状为总产仔数、产活仔数和健仔数；所述分子标记位于猪SRRM3基因第三内含子序列中，该序列长度为447bp，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，在该序列的第217bp处存在一处G217‑T217碱基突变。本发明还提供了一种用于扩增上述分子标记的引物对以及利用上述分子标记进行选育的方法。本发明首次发掘了猪SRRM3基因中的一个SNP分子标记与母猪的总产仔数、产活仔数和健仔数性状相关，因此可用于猪标记辅助选择育种，即提供了猪SRRM3基因中一个SNP分子标记在母猪产仔数性状的标记辅助育种的新用途，实现了对母猪产仔数性状的早期筛选，筛选方法简单快速。
本发明公开了SYK基因中与猪肌内脂肪性状相关的单倍型分子标记及应用，所述单倍型分子标记位于猪SYK基因第十五外显子中且序列如SEQ ID NO.1所示，所述单倍型分子标记包括：SEQ ID NO.1所示序列的第399bp处的G/C多态位点，第400bp处的C/A多态位点。本发明首次发掘了猪SYK基因中与猪肌内脂肪性状相关的单倍型分子标记，为猪肌内脂肪性状的标记辅助育种提供了一个新的分子育种标记。
本发明公开了一种与猪肌内脂肪性状相关的SNP分子标记及其应用，所述SNP分子标记为对应于猪AOPEP基因第四外显子中序列如SEQ ID NO.1所示DNA分子第373bp处的核苷酸，为G/A多态。实验证明，本发明提供的SNP分子标记与猪的肌内脂肪性状显著相关，说明本发明的分子标记与其检测物质可以鉴定或检测猪肌内脂肪性状，对于筛选或预测具备优良肌内脂肪性状的猪品种具有重要意义。
