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[发明专利]一种用于预测原发性乳腺癌发生风险的DNA甲基化标记物及其筛选方法和应用-CN202010181207.9在审
发明人：张红雨;全源;佟馨宇;李姜;黄清 -专利权人：武汉百药联科科技有限公司;华中农业大学
申请日： 2020-03-16 - 公布日： 2020-07-24 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于预测原发性乳腺癌发生风险的DNA甲基化标记物及其筛选方法和应用。所述方法包括以下步骤：(1)对样本数据进行甲基化分析，获得与预测原发性乳腺癌发生风险相关的甲基化位点；(2)获得针对所述甲基化位点的甲基化Beta值；(3)基于所述甲基化位点的甲基化Beta值构建原发性乳腺癌发生风险预测模型，并通过计算比值比验证该模型的可行性；(4)采用机器学习方法构建基于所述甲基化位点的原发性乳腺癌发生风险预测模型，计算比值比、AUC、召回率、精确率和F1值，与步骤(3)的预测模型进行相互验证；(5)所述预测模型中甲基化探针对应的甲基化位点即为DNA甲基化标记物。
一种用于预测原发性乳腺癌发生风险 dna 甲基化标记及其筛选方法应用

[发明专利]一种检测EBV中C启动子甲基化水平的试剂盒及方法-CN202110519092.4有效
发明人：曹素梅;林冬丰;左志向;李雪琪;谢尚杭;陈志航 -专利权人：中山大学肿瘤防治中心（中山大学附属肿瘤医院、中山大学肿瘤研究所）
申请日： 2021-05-12 - 公布日： 2022-07-12 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明公开了一种检测EBV中C启动子甲基化水平的试剂盒和方法。本发明结合甲基化PCR技术中的MSP和MS‑HRM技术，开发了一种能进行实时荧光定量和定性检测的甲基化PCR(qMSP‑HRM)方法，并引入了甲基化定量阳性对照质粒及未甲基化定量阳性对照质粒。通过本发明所述qMSP‑HRM方法，既可以定量定性检测EBV C启动子的甲基化，也可定量定性其他基因的甲基化。
一种检测 ebv 启动子甲基化水平试剂盒方法

[发明专利]一种氯甲基化聚醚醚酮及其合成方法-CN201110193418.5无效
发明人：贺高红;焉晓明;吴雪梅;杜立广;胡正文;王文佳 -专利权人：大连理工大学
申请日： 2011-07-11 - 公布日： 2012-02-15 - 主分类号： C08G8/28 文献下载
摘要：一种新的氯甲基化聚醚醚酮及其合成方法。200,000，氯甲基化程度x＝0.1-3.0。其合成方法是采用浓度为80-100％的硫酸代替传统的含氯烷烃作为溶剂和催化剂，氯甲基烷基醚为氯甲基化试剂，合成氯甲基化聚醚醚酮。并通过反应温度、反应时间以及硫酸浓度调节氯甲基化聚醚醚酮的氯甲基化程度。所制备的氯甲基化聚醚醚酮材料的分子量为10,000-200,000，常压空气中玻璃化温度为100-160℃，氯甲基化程度为0.1-3.0。本发明解决了聚醚醚酮溶解性差及其导致的难以氯甲基化改性的难题，成功合成了氯甲基化聚醚醚酮，反应条件温和、操作方便、环境污染小。
一种氯甲基化聚醚醚酮及其合成方法

[发明专利]一种Hemi-M甲基化修饰引物及其应用-CN201810638121.7有效
发明人：张晓妮;屈宏越;许明炎;陈实富 -专利权人：深圳市海普洛斯生物科技有限公司
申请日： 2018-06-20 - 公布日： 2020-05-12 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本发明提供了一种Hemi‑M甲基化修饰引物及其应用，所述引物至少含有一个被甲基化修饰的胞嘧啶，其中，所述甲基化修饰包括甲基化和/或羟甲基化修饰；本发明通过设计特异性的甲基化修饰引物，巧妙地与dCTP被mdCTP替代的dNTP相结合，对样本DNA进行胞嘧啶保护，创造性地将其应用于甲基化文库的构建，辅佐以特定的标签，适用于多种应用领域和场景，从而解决文库DNA自身对比分析的问题，实现更准确的甲基化位点分析，具备广阔的应用前景和巨大的市场价值
一种 hemi 甲基化修饰引物及其应用

[发明专利]经由甲基化转化苯和/或甲苯的方法-CN202080021362.2在审
发明人： S·M·瓦士布恩;H·蒋;陈诞仁 -专利权人：埃克森美孚化学专利公司
申请日： 2020-03-18 - 公布日： 2021-10-29 - 主分类号： C07C2/86 文献下载
摘要：本公开提供经由用甲醇/二甲基醚甲基化，来将苯/甲苯转化以生产例如对二甲苯的改进的方法。在一种实施方案中，方法包括将甲基化剂进料与芳烃进料在增加的压力下在甲基化反应器中在甲基化催化剂存在下接触。使用所述甲基化反应器中增加的压力可以实现甲基化催化剂失活的减少。
经由甲基化转化甲苯方法

[发明专利]一种非抗体依赖的蛋白质甲基化修饰富集分析方法-CN201811397614.2在审
发明人：张丽华;孙明伟;梁振;单亦初;赵宝锋;杨开广;张玉奎 -专利权人：中国科学院大连化学物理研究所
申请日： 2018-11-22 - 公布日： 2020-05-29 - 主分类号： G01N30/88 文献下载
摘要：本发明涉及一种非抗体依赖的蛋白质甲基化修饰富集分析新方法及应用，包括Lys‑C/Trypsin/Arg‑C连续酶切、酶切肽段N段氨基的固定、甲基化修饰肽段的选择性释放及LC‑MS/MS分析及数据解析甲基化修饰位点信息首先对含有蛋白质甲基化修饰的样本进行Lys‑C/Trypsin/Arg‑C多种酶切消化，然后将连续酶切得到的肽段与氨基反应活性材料反应，实现肽段的固定，最后利用特异性酶对固定肽段中含有甲基化修饰的赖氨酸和精氨酸本发明的优点是实现了多种类型低丰度蛋白质甲基化修饰的同时富集，包括赖氨酸二甲基化修饰、赖氨酸三甲基化修饰、精氨酸单甲基化修饰以及精氨酸二甲基化修饰。
一种抗体依赖蛋白质甲基化修饰富集分析方法

[发明专利]一种甲基化位点识别方法及装置-CN202111136225.6在审
发明人：邹权;李静;杜军平 -专利权人：电子科技大学长三角研究院（衢州）
申请日： 2021-09-27 - 公布日： 2021-12-21 - 主分类号： G16B40/20 文献下载
摘要：本发明提供一种甲基化位点识别方法及装置，方法包括：导入甲基化位点识别序列数据文件，并从甲基化位点识别序列数据文件中获取待处理的原始甲基化位点数据集；从原始甲基化位点数据集中提取数据特征，得到特征矩阵；对所述特征矩阵进行特征选择，选择得到多个特征和与其关联的实例类别，根据多个特征和与其关联的实例类别得到特征子集基于所述特征子集中的多个目标特征分别生成对应的基分类器；将多个基分类器进行集成，得到可识别甲基化位点的甲基化位点识别模型本发明能够实现对甲基化位点的准确识别，为相应药物开发提供了理论基础，通过对基分类器进行集成进而构建甲基化位点识别模型，提升了甲基化位点识别精度。
一种甲基化识别方法装置

[发明专利]一种预测微生物DNA甲基化调控基因表达的方法以及系统-CN202210809556.X在审
发明人：刘洋;刘继鸿;杨亮 -专利权人：南方科技大学医院
申请日： 2022-07-11 - 公布日： 2022-11-01 - 主分类号： G16B30/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种预测微生物DNA甲基化调控基因表达的方法以及系统，包括对基因组测序，得到基因组组装数据和DNA甲基化修饰信号；对基因组组装数据注释，得到转录调控区域和基因编码区；从DNA甲基化修饰信号中选取甲基化位点，获取甲基化位点与转录调控区域发生位置重叠的第一位置重叠区域以及与基因编码区发生位置重叠的第二位置重叠区域；根据两个位置重叠区域，预测甲基化位点与基因之间的关系。本发明利用SMRT测序技术搭建基因和DNA甲基化的一一对应关系，能够获取全基因组中可能受到DNA甲基化调控的基因，从而减少实验时间，缩小DNA甲基化调控的基因的范围，以高通量方式提高对微生物DNA甲基化的调控方式的解读
一种预测微生物 dna 甲基化调控基因表达方法以及系统

[发明专利]基于甲基化数据的癌症类型的预测方法及装置-CN201710785909.6有效
发明人：杨飞;任一;陈昌岳;郑冠涛;王芳;李静;路远 -专利权人：上海美吉生物医药科技有限公司
申请日： 2017-09-04 - 公布日： 2021-05-14 - 主分类号： G16H50/20 文献下载
摘要：本发明提供基于甲基化数据的癌症类型的预测方法及装置，包括：从DNA甲基化芯片检测到的DNA序列的甲基化数据中随机选取某些位点的数据作为训练数据来训练分类器模型；其中，作为训练数据的甲基化数据所代表的癌症种类为已知；通过训练好的分类器模型预测未知癌症种类的DNA甲基化芯片数据可能代表的癌症种类，或预测单细胞或多细胞的甲基化测序数据可能代表的癌症种类。本发明从测得的甲基化数据中随机选取某些位点的数据来训练分类器，可以在待测癌种类型的样本的某些位点的甲基化数据没有获知时，令分类器根据和待测样本已获知的甲基化位点相同的位点的数据作训练，极大程度上提高了基于甲基化的癌种类型的预测的便利性
基于甲基化数据癌症类型预测方法装置

[发明专利]一种差异性甲基化区域筛选方法及其装置-CN202111340427.2有效
发明人：黄毅;赵蔷;李俊;刘青峰;朱彬彬;易鑫;杨玲 -专利权人：深圳吉因加医学检验实验室;苏州吉因加医学检验有限公司
申请日： 2021-11-12 - 公布日： 2022-07-29 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：一种差异性甲基化区域筛选方法及其装置，筛选方法包括：CpG簇的提取步骤；CpG簇的筛选步骤；肿瘤组织特异的差异性甲基化区域筛选步骤；肿瘤cfDNA特异的差异性甲基化区域筛选步骤，以健康样本的cfDNA测序数据和患病样本的cfDNA测序数据作为背景数据集，对高差异性甲基化区域、低差异性甲基化区域进行过滤，获得过滤后的高差异性甲基化区域、低差异性甲基化区域。本发明基于CpG位点距离与甲基化信号连锁性的高度相关性，动态地将基因组划分为具有连锁关系的CpG簇，结合数据库中的肿瘤群体数据和健康个体数据，筛选获得肿瘤cfDNA中特异的差异性甲基化区域，有效提高甲基化标记物筛选的灵敏性与特异性
一种差异性甲基化区域筛选方法及其装置

[发明专利]循环无细胞DNA转录因子结合位点的甲基化水平分析方法及装置-CN202211059714.0有效
发明人：吕芳;黄宇;陈维之;杜波 -专利权人：臻和（北京）生物科技有限公司;臻悦生物科技江苏有限公司
申请日： 2022-09-01 - 公布日： 2022-11-25 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明提供了一种循环无细胞DNA转录因子结合位点的甲基化水平分析方法及装置，包括：接收待分析血浆样本的甲基化测序数据并从中提取循环无细胞DNA分子片段；提取转录因子结合位点上下游区域CpG位点的甲基化状态；以转录因子结合位点的基因组位置作为参照，将其上下游区域的CpG位点的坐标对齐；针对每个转录因子，分别统计各相对坐标上甲基化的CpG分子片段占比；计算转录因子结合位点中心点与侧翼区域的甲基化占比差值；将甲基化占比差值输入甲基化水平分析模型，根据甲基化水平分析模型的输出结果完成对待分析血浆样本循环无细胞DNA转录因子结合位点甲基化水平的分析，实现通过甲基化数据对转录因子的集合状态进行评估的目的。
循环细胞 dna 转录因子结合甲基化水平分析方法装置

[发明专利]从全基因组中富集甲基化DNA的方法及其所用层析柱组-CN200610147409.1无效
发明人：秦颖;肖华胜 -专利权人：上海生物芯片有限公司
申请日： 2006-12-18 - 公布日： 2008-06-25 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明涉及生物技术领域，公开了一种从全基因组中富集甲基化DNA的方法，包括：制备层析柱组，该层析柱组包括甲基化DNA特异的亲和层析柱和非甲基化DNA特异的亲和层析柱；抽提待测样品DNA；将待测样品DNA与非甲基化DNA特异的亲和层析柱进行结合反应，以去除待测样品核酸中的非甲基化DNA；把所得的滤过液再与甲基化DNA特异的亲和层析柱进行结合反应，以实现富集甲基化DNA的目的。本发明从全基因组中富集甲基化DNA的方法，能显著提高从全基因组范围内富集甲基化DNA的效率，且明显增加甲基化DNA富集的特异性和敏感性。
基因组富集甲基化 dna 方法及其所用层析

[发明专利]从血浆无创测定胎儿或肿瘤的甲基化组-CN201380058654.3在审
发明人：赵慧君;陈君赐;卢煜明;伦妙芬;江培勇;陈渭雯 -专利权人：香港中文大学
申请日： 2013-09-20 - 公布日： 2015-07-15 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本实施例提供了测定并使用各种组织和样品的甲基化型态的系统、方法和设备。因阐述发明的需要，我们提供了相关的实例说明。基于血浆DNA甲基化(或具有游离DNA的其它样品，例如尿液、唾液、生殖器洗涤液等)与母亲/患者的甲基化型态的比较来推断胎儿/肿瘤组织的甲基化型态。当样品具有DNA混合物时，可以使用组织特定的等位基因以鉴别来自胎儿/肿瘤的DNA，来确定胎儿/肿瘤组织的甲基化型态。甲基化型态可以用于确定胎儿/肿瘤的基因组中的拷贝数变异。通过各种技术鉴别出胎儿的甲基化标记物。可以通过确定DNA片段的尺寸分布的尺寸参数来确定甲基化型态，其中所述尺寸参数的参考值可以用于确定甲基化水平。另外，甲基化水平可以用于确定癌症等级。
血浆测定胎儿肿瘤甲基化

[发明专利]散发性大肠癌发病可能性的判定方法-CN201780059361.5在审
发明人：楠正人;问山裕二;三井彰;竹鼻健司;梅泽努 -专利权人：哈鲁曼有限公司;EA制药株式会社
申请日： 2017-09-28 - 公布日： 2019-06-04 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本申请发明提供散发性大肠癌发病可能性的判定方法，该方法具有以下步骤：测定步骤，测定由采自人受试者的生物样品回收的DNA中的特定的甲基化可变区中存在的1个以上的CpG位点的甲基化率；以及判定步骤，根据基于所测定的甲基化率算出的甲基化可变区的平均甲基化率和预先设定的基准值或者预先设定的多变量判别式，判定上述人受试者的散发性大肠癌发病的可能性，上述基准值是指针对各甲基化可变区的甲基化率分别设定的、用于识别散发性大肠癌患者和非散发性大肠癌患者的值，上述多变量判别式包含特定的甲基化可变区中的1处以上的甲基化可变区的平均甲基化率作为变量
甲基化率大肠癌甲基化可变区散发性判定发病可能性多变量判别式生物样品回收申请

[发明专利]一种氯甲基化腰果酚的制备方法-CN201210583116.3有效
发明人：江成真;陈英军;刘卫 -专利权人：山东圣泉化工股份有限公司
申请日： 2012-12-27 - 公布日： 2013-04-03 - 主分类号： C07C39/373 文献下载
摘要：本发明提供了一种氯甲基化腰果酚的制备方法，包括以下步骤：将腰果酚、氯甲基化试剂、Lewis酸混合，进行氯甲基化反应，得到具有式（I）所示结构的腰果酚，所述氯甲基化试剂为氯甲基烷烃或氯甲基烷基醚，式（I）本发明提供的制备方法以氯甲基烷烃或氯甲基烷基醚为氯甲基化试剂，其具有较高的反应活性，能够较彻底的将反应原料腰果酚进行氯甲基化；且本发明提供的方法以Lewis酸为催化剂，将腰果酚进行一步氯甲基功能化，所述催化剂也具有较高的反应活性，能够提高原料腰果酚向氯甲基化腰果酚的转变，从而提高了反应产物氯甲基化腰果酚的得率。
一种氯甲基化腰果制备方法