本发明公开了一种HPV分型检测的核酸组合及其应用和试剂盒,属于基因检测技术领域。本发明提供的HPV分型检测的核酸组合用于检测HPV 16亚型的第一核酸组合和用于检测HPV 18亚型的第二核酸组合。第一核酸组合包括SEQ ID NO.1‑2所示的第一引物对和SEQ ID NO.3所示的第一捕获探针。第二核酸组合包括SEQ ID NO.4‑5所示的第二引物对和SEQ ID NO.6所示的第二捕获探针。该核酸组合以PCR和EFIRM技术为基础,能够高灵敏地、高特异性地检测出样本中的HPV亚型类别,其具有检测耗时短、检测成本低等特点,可适用于大量的临床检测和大规模的流行病学筛查。