[发明专利]基于微生物与宿主互作的阿尔兹海默症标志物识别方法在审
申请号: | 202310098268.2 | 申请日: | 2023-02-10 |
公开(公告)号: | CN116052767A | 公开(公告)日: | 2023-05-02 |
发明(设计)人: | 赵兴明;刘金鑫 | 申请(专利权)人: | 复旦大学 |
主分类号: | G16B20/20 | 分类号: | G16B20/20;G16B50/10;G16B5/00;G16H50/30;C12Q1/6883 |
代理公司: | 合肥正则元起专利代理事务所(普通合伙) 34160 | 代理人: | 刘念 |
地址: | 200433 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明公开了基于微生物与宿主互作的阿尔兹海默症标志物识别方法,属于医学检验技术领域,具体包括:提取患者的微生物‑宿主基因组,对二者进行质检并作为发现集;识别微生物基因组中与AD表型关联的子社团结构,将子社团结构与宿主基因组进行关联,对显著关联的宿主基因变异位点进行基因注释和富集分析;对子社团结构进行单双样本孟德尔随机化,识别子社团结构与AD表型间的因果关系;利用子社团结构涉及的微生物丰度建立AD预测模型并验证,采集到AD风险基因涉及的SNP与单菌进行关联分析,将通过AD差异物种富集检验的显著关联物种标记为AD标志物;本发明利用子社团结构的概念,使用较少的物种特征提升对AD表型预测模型的泛化能力。 | ||
搜索关键词: | 基于 微生物 宿主 阿尔兹海默症 标志 识别 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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