[发明专利]一种RNA-DNA嵌合接头及其应用

摘要

本发明提出一种RNA‑DNA嵌合接头及其应用，属于生物分析检测以及基因测序领域，尤其涉及一种用于确保单个解旋酶结合以及阻滞解旋酶移动的测序接头序列设计、构建方法以及应用。采用RNA结合DNA的方式，特异性保证解旋酶在接头上的结合位置、个数等；而RNA‑DNA杂合结构具有比单独RNA双链结构更稳定的特性，并且只能被RNaseH所识别(RNaseH特异性识别RNA‑DNA杂合结构)，切除RNA‑DNA杂合结构中的RNA链，从而暴露出作为引导链的单链DNA。adapter引入Cy3，Cy3能够有效阻滞Dda。本发明所述的RNA‑DNA嵌合adapter主要应用在纳米孔测序中，通过本发明实验的系统验证，该adapter以及adapter mix能够有效进行纳米孔测序。