[发明专利]一种基于ceRNA网络的癌症基因挖掘分析方法在审

专利信息
申请号: 202211336050.8 申请日: 2022-10-28
公开(公告)号: CN115631172A 公开(公告)日: 2023-01-20
发明(设计)人: 石玉虎;金志斌 申请(专利权)人: 上海海事大学
主分类号: G06T7/00 分类号: G06T7/00;G06T7/11;G06T7/136;G06T7/62;G06T7/90;G06V10/762;G16B20/00;G16B40/00
代理公司: 上海诺衣知识产权代理事务所(普通合伙) 31298 代理人: 张若川
地址: 201306 上海市*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明公开了一种基于ceRNA网络的癌症基因挖掘分析方法,步骤:获取患有目标癌症的患者以及未患病的患者的基因表达数据以及病理图像;对相关病理图像进行处理,提取病理图像切割的细胞核的核级特征,作为WSI特征;根据基因表达数据构建反映不同RNA之间连接关系的ceRNA网络;建立不同RNA的配对的稀疏矩阵,将WSI特征与mRNA数据进行皮尔逊相关系数求解;利用JSNMCNMF算法整合WSI、mRNA、miRNA和lncRNA四部分数据,得到mRNA与WSI之间的关系;利用KJMCNMF算法获取ceRNA网络中的隐含连接关系。本发明的方法,首次构建了基因与病理图像之间的关系,为癌症研究提供新的方向。
搜索关键词: 一种 基于 cerna 网络 癌症 基因 挖掘 分析 方法
【主权项】:
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