[发明专利]一种基于构象依赖性电荷的分子对接方法及系统在审

专利信息
申请号: 202210601832.3 申请日: 2022-05-30
公开(公告)号: CN115206441A 公开(公告)日: 2022-10-18
发明(设计)人: 邓伟侨;孙磊;胡雪萍;赵慧萱;张德鹏 申请(专利权)人: 山东大学
主分类号: G16C10/00 分类号: G16C10/00;G16C20/50
代理公司: 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 代理人: 张庆骞
地址: 266237 *** 国省代码: 山东;37
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摘要: 发明公开一种基于构象依赖性电荷的分子对接方法及系统,包括:对小分子配体经结构优化后,进行构象搜索,得到小分子构象;对小分子构象经结构优化后,计算稳定构象在真空中的RESP电荷;将RESP电荷赋值到结构优化后得到的小分子构象中,得到配体电荷;对蛋白‑配体复合物在现有力场模式下进行分子对接,在分子对接中使用得到的配体电荷。通过药物小分子构象搜索配以电荷拟合的方法,对每一种药物分子根据其不同构象得到多套RESP电荷参数,以提高分子对接的精度。
搜索关键词: 一种 基于 构象 依赖性 电荷 分子 对接 方法 系统
【主权项】:
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